Une nouvelle procédure de laboratoire permet aux scientifiques de surveiller jusqu’à quatre événements GM à l’aide d’une seule analyse
Les cultures génétiquement modifiées (GM) sont devenues de plus en plus courantes depuis le début de leur commercialisation dans les années 1990. Parallèlement, les consommateurs du monde entier ont commencé à se préoccuper davantage de ce qui se trouve dans leurs aliments. En tant que pays exportateur, le Canada a besoin de méthodes efficaces pour détecter et surveiller les événements GM dans des cultures importantes comme le soja et le canola, au besoin.
Un essai d’amplification en chaîne par polymérase (PCR) en temps réel est une procédure de laboratoire largement utilisée pour détecter et quantifier des événements GM individuels. Pour utiliser un essai de PCR en temps réel afin de surveiller un événement GM en particulier, il faut utiliser un échantillon de référence pour établir une courbe d’étalonnage convenable pour cet événement. Une courbe d’étalonnage est un graphique servant à mesurer différentes concentrations d’un événement GM. Elle est utilisée pour calculer la quantité du produit GM qui se trouve dans l’échantillon d’essai. Il est possible de recourir à la PCR numérique (dPCR) pour mesurer la présence d’un événement GM dans un échantillon sans qu’il soit nécessaire d’utiliser un échantillon de référence ou une courbe d’étalonnage. En général, une analyse par dPCR est effectuée pour détecter un événement GM à la fois. Pour surveiller plus d’un événement GM dans un même échantillon, l’analyse est effectuée à plusieurs reprises.
Nous avons décidé de chercher à déterminer si nous pouvions détecter et quantifier avec exactitude deux, trois ou quatre événements GM en même temps. À l’aide du système PCR numérique à gouttelettes (ddPCR) QX200, nous avons tenté de détecter et de quantifier de multiples événements GM dans le canola et le soja à trois concentrations différentes : 0,1 %, 1 %, et 5 %.
Nous avons été en mesure d’obtenir des résultats concluants aux essais de ddPCR multiplex pour chaque concentration ayant fait l’objet d’analyse. Grâce à l’optimisation des essais, nous avons pu détecter et quantifier quatre événements GM en une seule analyse. Les essais que nous avons mis au point dans le cadre de cette étude permettront de détecter et de quantifier d’autres événements GM de façon plus efficace et de réduire le temps et les ressources nécessaires à la surveillance.
Citation
« Comme la technologie de modification génétique a été largement adoptée en agriculture, nous devons continuer d’améliorer nos méthodes fondées sur l’ADN visant à détecter les événements GM nouveaux et abandonnés. L’essai de PCR numérique multiplex que nous avons élaboré nous permet d’analyser quatre événements GM à la fois, ce qui nous fait économiser du temps et des ressources. »

Complément d’information
Demeke, Tigst, Sung-Jong Lee, et Monika Eng. « Increasing the Efficiency of Canola and Soybean GMO Detection and Quantification Using Multiplex Droplet Digital PCR », Biology, vol. 11, no 2 (2022), p. 201. https://doi.org/10.3390/biology11020201 (en anglais)