Mise à l’essai de deux systèmes d’identification du blé par l’ADN

Compte tenu du fait que plus de 500 variétés de blé sont actuellement enregistrées au Canada et que 125 autres variétés non enregistrées ou désenregistrées peuvent être cultivées, l’identification par l’ADN est un élément important du système d’assurance de la qualité des grains du Canada. Il est essentiel de pouvoir identifier avec précision les variétés de blé présentes dans une cargaison de grain pour s'assurer que les exportations de grain canadien répondent aux attentes des acheteurs en matière de transformation et de fabrication de produits alimentaires. Dans le cadre de cette étude, nous avons comparé la précision et l'efficacité de deux systèmes d'identification des variétés de blé à l'aide de l'ADN.

Le génotypage permet de recenser les différences entre les séquences d'ADN des plantes et des animaux. Nous utilisons le génotypage pour distinguer les variétés de blé en comparant les composants génétiques particuliers du blé analysé à notre base de données sur l'ADN du blé.

Dans le cadre de cette étude, nous avons mis au point des procédures de laboratoire raffinées pour distinguer les variétés de blé avec une plus grande précision. Nous avons adapté ces procédures pour les utiliser avec le système de génotypage SmartChip, qui est semblable au système OpenArray actuellement utilisé par la Commission canadienne des grains. Nous avons utilisé chaque système pour analyser 288 échantillons connus de variétés de blé canadien. Nous avons ensuite comparé les résultats pour déterminer les différences sur le plan de la performance.

Les deux systèmes présentent des avantages qui les rendent adaptés à différentes applications. En général, nous avons observé que le système OpenArray a un débit plus élevé que le système SmartChip. Le système SmartChip, quant à lui, offre une meilleure précision et moins de points de données manquants. Les systèmes de génotypage OpenArray et SmartChip peuvent tous deux être utilisés avec nos procédures de laboratoire améliorées pour identifier les variétés de blé canadien.

Citation

L'analyse de la composition des variétés contribue à préserver la réputation du Canada en tant que fournisseur fiable de blé de qualité supérieure. Le Laboratoire de recherches sur les grains étudie les technologies les plus récentes pour s'assurer que nos services apportent une valeur ajoutée au secteur canadien des grains tout en fournissant des renseignements précis et opportuns aux acheteurs de grain.

Article de recherche intégral

Sung-Jong Lee, Tigst Demeke, Mathieu Dusabenyagasani, Danny Saydak, Daniel Perry, et Sean Walkowiak. 2023. « Evaluation of two high-throughput genotyping systems for rapid identification of Canadian wheat varieties. », Canadian Journal of Plant Science (2023). e-First https://doi.org/10.1139/cjps-2022-0192 (en anglais)