Le Consortium international de l'épigénome humain (CIEH) souligne une importante publication coordonnée d'articles

Des chercheurs du CIEH publient une série de 41 articles dans Cell, des revues associées à Cell Press et d’autres revues influentes

Le fait que les nombreux et différents types de cellules dont notre corps est constitué soient dérivés d’une cellule unique et d’une seule séquence d’ADN, ou génome, demeure l’un des grands mystères de la biologie. L’étude du génome humain nous a appris beaucoup de choses, mais nous a permis de comprendre en partie seulement les processus qui sous‑tendent la détermination des cellules. L’identité de chaque type de cellules est largement définie par une couche instructive d’annotations moléculaires en plus du génome – l’épigénome – qui sert de plan unique à chaque type de cellules et à chaque stade du développement cellulaire. Contrairement au génome, l’épigénome change à mesure que les cellules se développent et réagissent aux changements dans l’environnement. Des vices dans les facteurs qui lisent, écrivent et effacent le plan épigénétique sont en cause dans de nombreuses maladies. L’analyse détaillée des épigénomes de cellules saines et de cellules anormales facilitera la découverte de nouvelles façons de diagnostiquer et de traiter diverses maladies, et se traduira à terme par une amélioration de la santé.

Une série de 41 articles coordonnés publiés en ce moment par des chercheurs du Consortium international de l’épigénome humain (CIEH) jette de la lumière sur ces processus, faisant ainsi faire un important bond à la recherche mondiale en épigénomique. Un ensemble de 24 manuscrits ont été publiés en groupe dans Cell et des revues associées à Cell Press, et 17 de plus l’ont été dans d’autres revues influentes.

Ces articles représentent les plus récents travaux réalisés dans le cadre de projets du CIEH au Canada, dans l’Union européenne, en Allemagne, au Japon, à Singapour et aux États‑Unis. La série d’articles met en évidence les réalisations et les progrès scientifiques du CIEH dans des domaines centraux de la recherche actuelle en épigénétique.

Sont notamment publiés des manuscrits de sept études différentes dirigées par des Canadiens ou codirigées :

1. Bourque, G. (2016a). « The International Human Epigenome Consortium (IHEC) Data Portal ». Cell Systems.
2. Bourque, G. (2016b). « Optimizing ChIP-seq peak detectors using visual labels and supervised machine learning ». Bioinformatics.
3. Hirst, M. (2016). « Nucleosome density ChIP-seq identifies distinct chromatin modification signatures of promoters associated with MNase accessibility ». Cell Reports.
4. Hirst, M. et Eaves, C. (2016). « Analysis of normal human mammary epigenomes reveals cell-specific active enhancer states and associated transcription factor networks ». Cell Reports.
5. Hirst, M. et Marra, M.A. (2016). « Genome-Wide Profiles of Extra-cranial Malignant Rhabdoid Tumors Reveal Heterogeneity and Dysregulated Developmental Pathways ». Cancer Cell 29, 394‑406
6. Joly, Y. (2016). « Are Data Sharing and Privacy Protection Mutually Exclusive? » Cell.
7. Pastinen, T. (2016). « Genetic drivers of epigenetic and transcriptional variation in human immune cells ». Cell

Une importante contribution canadienne à cette initiative est le Portail de données du CIEH. Ce portail a été créé et est hébergé au Canada. Il est conçu pour intégrer et répartir les ensembles de données produits par différents membres du CIEH. Le Portail intègre à l’heure actuelle une base de données et une interface graphique pour plus de 7 000 ensembles de données épigénomiques. Il offre également un aperçu de toutes les expériences en épigénomique réalisées par les membres du CIEH, regroupées par fournisseur, type de tissu et type d’épreuve biologique. On y trouve aussi une grille dynamique qui sert à naviguer dans les ensembles de données et qui présente des liens permettant de voir les données dans un navigateur de génome ou de les télécharger.

Le Consortium canadien de recherche en épigénétique, environnement et santé (CCREES) appuie la recherche de pointe sur le rôle de l’ADN et des interactions environnementales sur la santé et la maladie humaines. Cette initiative assurera au Canada un rôle de premier plan en épigénétique grâce à l’application pratique des découvertes issues de la recherche.

Le CCREES travaille en partenariat avec la plupart des instituts des IRSC et est codirigé par les instituts suivants : Neurosciences, santé mentale et toxicomanies, Génétique et Cancer. Parmi ses partenaires externes figurent notamment Genome BC, Génome Québec, Génome Canada et le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS). Le CCREES établit actuellement des collaborations avec des organismes de financement et des intervenants pour améliorer la recherche dans ce domaine.

Aux IRSC, nous comprenons le pouvoir et le potentiel de la recherche en santé, et l’importance de la collaboration avec des partenariats nationaux et internationaux. Le savoir que nous produisons ensemble mène à  des personnes et à un monde en meilleure santé.