Surveillance nationale en laboratoire de la maladie invasive due au streptocoque au Canada - Rapport sommaire annuel de 2017

Sommaire

• Streptococcus pneumoniae : En 2017, 3 006 isolats de Streptococcus pneumoniae causant une infections invasives à pneumocoque (IPP) ont été caractérisés.
• En 2017, l’incidence des IPP a connu un recul chez les enfants de moins d’un an, s’établissant à 14,9 cas pour 100 000 habitants, et chez les personnes âgées de 60 ans et plus, s’établissant à 21,1 cas pour 100 000 habitants. Le taux d’incidence brut global est demeuré stable et s’élève en moyenne à 9,4 cas pour 100 000 habitants depuis 2009.
• Les sérotypes contenus dans le vaccin Pneu‑C‑7 sont demeurés relativement inchangés de façon générale en 2017, représentant 12 % des IPP. Une hausse des sérotypes 4 et 19F a été observée.
• Les sérotypes contenus dans le vaccin Pneu‑C‑13 (excluant les sérotypes contenus dans le vaccin Pneu‑C‑7) représentaient 18 % de l’ensemble des IPP, un déclin général qui se poursuit depuis 2012, où la proportion était de 36 %. Cependant, les taux de cas attribuables au sérotype 3 sont demeurés relativement constants chez tous les groupes d’âge. Une diminution constante des sérotypes contenus dans les vaccins Pneu‑C‑7 et Pneu‑C‑13 chez les personnes âgées de 65 ans et plus, de même que des taux de cas plus faibles au sein de ce groupe d’âge, indiquent une réduction indirecte de la maladie qui est probablement attribuable aux effets de l’immunité de groupe.
• Dans l’ensemble, les sérotypes contenus dans le vaccin Pneu‑P‑23 et les sérotypes non inclus dans les vaccins (SNIV) sont demeurés relativement inchangés en 2017, s’établissant à 42 % et à 29 %, respectivement. Une augmentation des cas attribuables au sérotype 9N a été observée chez les personnes âgées de 50 ans ou plus.
• En 2017, les sérotypes prédominants étaient les sérotypes 3 (10 %), 22F (9 %), 4 (8 %), 9N (7 %) et 8 (5 %). Le sérotype 33F était le sérotype le plus fréquemment observé chez les enfants de moins de 2 ans, représentant 16 % des cas, suivi de près par le sérotype 15B/C, représentant 15 % des cas. Chez les enfants de 2 à 4 ans, le sérotype 22F demeure prédominant, représentant 12 % des cas. Une augmentation du sérotype 4 chez les adultes était associée aux régions de l’Ouest; le sérotype 23B était prédominant chez les enfants de 2 à 14 ans, et le sérotype 15A était associé au groupe des 65 ans et plus en 2017 (figure A).
• Sensibilité aux antimicrobiens : L’analyse de 1 129 isolats a révélé que les taux de résistance étaient demeurés relativement stables en 2017. Les pourcentages de résistance étaient les suivants : clarithromycine (26 %), pénicilline (15 %), doxycycline (11 %), clindamycine (8 %), triméthoprime/sulfaméthoxazole (7 %), méropénème (1,6 %) et imipénème (0,1 %). Les sérotypes 6A/C, 19A/F, 23A/F, 15A, 9V, 14 et 35B affichaient généralement les taux les plus élevés de résistance aux antimicrobiens. La multirésistance a augmenté, passant de 6 % en 2016 à 10 % en 2017. Les taux les plus élevés de multirésistance ont été observés chez les sérotypes 15A (65 %) et 19F (31 %) (figure B).
• S. pyogenes (streptocoque du groupe A) : Au total, 2 473 isolats causant des infections invasives ont été caractérisés en vue de déterminer le type emm.
• L’incidence globale des infections invasives est passée de 4,0 cas pour 100 000 habitants en 2009 à 6,7 cas pour 100 000 habitants en 2017.
• Malgré un déclin depuis 2013, le type emm1 demeure le plus fréquent chez tous les groupes d’âge combinés et dans toutes les régions combinées (18 %) (figure C). Des hausses régionales du type emm12 ont été observées dans l’Est (15 %), du type emm74 dans le Centre (14 %) et du type emm49 dans l’Ouest (5 %).
• Sensibilité aux antimicrobiens : La résistance aux antimicrobiens de S. pyogenes est relativement faible. Toutefois de légères augmentations de la résistance ont été observées en 2017; la non‑sensibilité au chloramphénicol atteignait 5 %, la résistance à l’érythromycine, 10 % et la résistance à la clindamycine, 7 %.
• S. agalactiae (streptocoque du groupe B) : Au total, 229 isolats de streptocoque du groupe B causant une infection invasive ont été soumis au Laboratoire national de microbiologie (LNM) en 2017, dont 7 provenaient de cas d’infection précoce (nourrissons de sept jours ou moins), et 8, de cas d’infection tardive (nourrissons de 8 à 31 jours). L’incidence des infections invasives a fluctué passablement, passant d’un creux de 27,6 cas pour 100 000 habitants en 2009 à un sommet de 38,7 cas pour 100 000 habitants en 2014. Le taux d’incidence s’établissait à 30,6 en 2017.
• Les sérotypes Ia (22 %), IV (19 %) ainsi que III et V (17 % chacun) prédominaient.
• Sensibilité aux antimicrobiens : On a observé une augmentation de la résistance à l’érythromycine, qui a atteint 58 %, et de la résistance à la clindamycine, qui a atteint 45 %.

Figure A - Équivalent textuel

Diagramme à barres illustrant le pourcentage de sérotypes de S. pneumoniae de 2013 à 2017 en fonction du nombre total d'isolats testés chaque année.

Column1	2013 (n=2568)	2014 (n=2466)	2015 (n=2593)	2016 (n=2764)	2017 (n=3006)
4note de bas de page *    (42,57,103,182,229)note de bas de page ‡	1,6%	2,3%	4,0%	6,6%	7,6%
6Bnote de bas de page *   (15,6,10,20,8)	0,6%	0,2%	0,4%	0,7%	0,3%
9Vnote de bas de page *   (9,9,7,5,12)	0,4%	0,4%	0,3%	0,2%	0,4%
14note de bas de page *   (15,10,12,14,23)	0,6%	0,4%	0,5%	0,5%	0,8%
18Cnote de bas de page *  (10,5,6,8,6)	0,4%	0,2%	0,2%	0,3%	0,2%
19Fnote de bas de page *  (27,23,42,43,73)	1,1%	0,9%	1,6%	1,6%	2,4%
23Fnote de bas de page *  (10,10,9,4,2)	0,4%	0,4%	0,3%	0,1%	0,1%
1note de bas de page **   (10,3,4,3,0)	0,4%	0,1%	0,2%	0,1%	0,0%
3note de bas de page **   (229,219,235,261,289)	8,9%	8,9%	9,1%	9,4%	9,6%
5note de bas de page **   (5,0,2,0,0)	0,2%	0,0%	0,1%	0,0%	0,0%
6Anote de bas de page **  (15,16,9,19,6)	0,6%	0,6%	0,3%	0,7%	0,2%
7Fnote de bas de page **  (226,184,145,109,111)	8,8%	7,5%	5,6%	3,9%	3,7%
19Anote de bas de page ** (299,220,212,176,143)	11,6%	8,9%	8,2%	6,4%	4,8%
2note de bas de page ^    (1,0,0,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
8note de bas de page ^    (119,99,137,148,151)	4,6%	4,0%	5,3%	5,4%	5,0%
9Nnote de bas de page ^   (113,109,115,138,203)	4,4%	4,4%	4,4%	5,0%	6,8%
10Anote de bas de page ^  (47,49,45,48,57)	1,8%	2,0%	1,7%	1,7%	1,9%
11Anote de bas de page ^  (92,99,88,91,90)	3,6%	4,0%	3,4%	3,3%	3,0%
12Fnote de bas de page ^  (90,88,126,102,123)	3,5%	3,6%	4,9%	3,7%	4,1%
15B/Cnote de bas de page ^(87,85,87,125,114)	3,4%	3,4%	3,4%	4,5%	3,8%
17Fnote de bas de page ^  (18,31,17,23,28)	0,7%	1,3%	0,7%	0,8%	0,9%
20note de bas de page ^   (50,69,88,81,113)	1,9%	2,8%	3,4%	2,9%	3,8%
22Fnote de bas de page ^  (312,281,252,254,267)	12,1%	11,4%	9,7%	9,2%	8,9%
33Fnote de bas de page ^  (72,56,74,98,100)	2,8%	2,3%	2,9%	3,5%	3,3%
6C    (92,91,74,73,60)	3,6%	3,7%	2,9%	2,6%	2,0%
6D    (3,2,3,0,0)	0,1%	0,1%	0,1%	0,0%	0,0%
7A    (0,0,1,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
7B    (0,1,2,0,2)	0,0%	0,0%	0,1%	0,0%	0,1%
7C    (12,13,26,42,22)	0,5%	0,5%	1,0%	1,5%	0,7%
9A    (1,0,2,0,0)	0,0%	0,0%	0,1%	0,0%	0,0%
9L    (0,0,0,2,2)	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%	0,1%
10B   (1,4,2,2,2)	0,0%	0,2%	0,1%	0,1%	0,1%
10F   (1,1,0,2,3)	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%	0,1%
11B   (1,1,4,3,0)	0,0%	0,0%	0,2%	0,1%	0,0%
11D   (0,0,0,0,3)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%
11F   (1,0,0,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
12B   (0,0,0,0,1)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
13    (4,13,7,8,6)	0,2%	0,5%	0,3%	0,3%	0,2%
15A   (99,113,119,123,145)	3,9%	4,6%	4,6%	4,5%	4,8%
16F   (60,72,64,72,72)	2,3%	2,9%	2,5%	2,6%	2,4%
17A   (0,0,1,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
18A   (2,1,0,1,0)	0,1%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
18B   (1,0,0,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
18F   (0,0,0,1,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
21    (11,7,9,11,16)	0,4%	0,3%	0,3%	0,4%	0,5%
22A   (1,4,1,0,1)	0,0%	0,2%	0,0%	0,0%	0,0%
23A   (88,107,110,106,140)	3,4%	4,3%	4,2%	3,8%	4,7%
23B   (50,86,78,83,93)	1,9%	3,5%	3,0%	3,0%	3,1%
24    (0,0,2,1,0)	0,0%	0,0%	0,1%	0,0%	0,0%
24A   (0,0,0,1,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
24B   (1,0,1,1,1)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
24F   (4,12,18,21,24)	0,2%	0,5%	0,7%	0,8%	0,8%
25F   (0,1,0,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
28A   (4,2,2,5,10)	0,2%	0,1%	0,1%	0,2%	0,3%
29    (4,13,9,8,4)	0,2%	0,5%	0,3%	0,3%	0,1%
31    (32,39,31,46,43)	1,2%	1,6%	1,2%	1,7%	1,4%
32A   (0,0,0,0,1)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
33A   (10,3,10,4,2)	0,4%	0,1%	0,4%	0,1%	0,1%
33B   (1,0,0,1,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
33C   (0,0,0,0,1)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
34    (19,21,25,23,27)	0,7%	0,9%	1,0%	0,8%	0,9%
35A   (3,2,1,4,2)	0,1%	0,1%	0,0%	0,1%	0,1%
35B   (58,45,60,61,73)	2,3%	1,8%	2,3%	2,2%	2,4%
35C   (1,1,1,0,0)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
35F   (44,52,61,54,50)	1,7%	2,1%	2,4%	2,0%	1,7%
37    (4,2,2,2,2)	0,2%	0,1%	0,1%	0,1%	0,1%
38    (36,21,37,46,46)	1,4%	0,9%	1,4%	1,7%	1,5%
42    (0,0,0,0,1)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%
NT    (6,8,5,5,3)	0,2%	0,3%	0,2%	0,2%	0,1%
Note de bas de tableau * Composante du Pneu-C-7 Retour à la référence de la note de bas de page * Note de bas de tableau ** Composante du Pneu-C-13 Retour à la référence de la note de bas de page ** Note de bas de tableau ^ Composante de Pneu-P-23 Retour à la référence de la note de bas de page ^ Note de bas de tableau ‡ Nombre d'isolats pour 2013, 2014, 2015, 2016 et 2017 respectivement Retour à la référence de la note de bas de page ‡

Figure B - Équivalent textuel

Une ligne de combinaison et un graphique à barres empilées affichant les tendances de la résistance aux antimicrobiens de S. pneumoniae de 2013 à 2017.

Category 1	Resistant to 7 classesnote de bas de page *	Resistant to 6 classes	Resistant to 5 classes	Resistant to 4 classes	Resistant to 3 classes	Resistant to 2 classes	Resistant to 1 class	Resistant to ≥3 classes
2013 (n=1058)	0.1%	0.0%	2.8%	1.6%	3.0%	4.8%	20.6%	7.6%
2014 (n=1116)	0.0%	0.5%	1.0%	1.5%	2.0%	8.3%	18.3%	5.0%
2015 (n=1128)	0.0%	0.0%	1.8%	2.6%	2.4%	5.2%	18.4%	6.7%
2016 (n=1114)	0.0%	0.1%	0.8%	2.8%	2.5%	6.4%	18.2%	6.2%
2017 (n=1129)	0.0%	0.4%	1.5%	4.6%	3.1%	6.1%	19.5%	9.6%
Note de bas de tableau * Les classes d’antimicrobiens sont les suivantes: β-lactamines (amoxicilline/acide clavulanique, pénicilline en fonction des doses seuils pour la méningite, ceftriaxone en fonction des doses seuils pour la méningite, céfuroxime en fonction de la dose seuil parentérale, ertapénème, imipénème et méropénème); macrolides (clarithromycine); fluoroquinolones (lévofloxacine et moxifloxacine); tétracyclines (doxycycline); inhibiteurs de la voie folate (triméthoprime-sulfaméthoxazole); phénicols (chloramphénicol); lincosamides (clindamycine); oxazolidinones (linézolide). Retour à la référence de la note de bas de page *

Figure C - Équivalent textuel

Diagramme à barres présentant les types emm de S. pyogenes de 2013 à 2017 en pourcentage basé sur le nombre total d'isolats testés chaque année.

Column1	2013 (n=1527)	2014 (n=1704)	2015 (n=1760)	2016 (n=2154)	2017 (n=2473)
1   (352,456,317,323,449)note de bas de page †	23,1%	26,8%	18,0%	15,0%	18,2%
2   (35,46,39,31,33)	2,3%	2,7%	2,2%	1,4%	1,3%
3   (36,37,150,132,61)	2,4%	2,2%	8,5%	6,1%	2,5%
4   (86,99,86,98,86)	5,6%	5,8%	4,9%	4,5%	3,5%
5   (6,9,8,11,7)	0,4%	0,5%	0,5%	0,5%	0,3%
6   (55,80,41,57,48)	3,6%	4,7%	2,3%	2,6%	1,9%
9   (14,10,11,11,41)	0,9%	0,6%	0,6%	0,5%	1,7%
11  (65,55,85,64,68)	4,3%	3,2%	4,8%	3,0%	2,7%
12  (73,108,128,137,147)	4,8%	6,3%	7,3%	6,4%	5,9%
18  (0,0,0,5,4)	0,0%	0,0%	0,0%	0,2%	0,2%
22  (22,18,26,25,25)	1,4%	1,1%	1,5%	1,2%	1,0%
28  (94,107,92,97,126)	6,2%	6,3%	5,2%	4,5%	5,1%
29  (1,8,0,2,4)	0,1%	0,5%	0,0%	0,1%	0,2%
41  (18,36,44,37,55)	1,2%	2,1%	2,5%	1,7%	2,2%
44  (4,6,3,4,4)	0,3%	0,4%	0,2%	0,2%	0,2%
48  (0,1,3,5,4)	0,0%	0,1%	0,2%	0,2%	0,2%
49  (4,1,3,12,70)	0,3%	0,1%	0,2%	0,6%	2,8%
53  (49,45,57,26,37)	3,2%	2,6%	3,2%	1,2%	1,5%
58  (4,3,9,22,14)	0,3%	0,2%	0,5%	1,0%	0,6%
59  (37,31,24,49,57)	2,4%	1,8%	1,4%	2,3%	2,3%
63  (0,1,0,1,2)	0,0%	0,1%	0,0%	0,0%	0,1%
68  (55,43,31,40,25)	3,6%	2,5%	1,8%	1,9%	1,0%
73  (3,10,9,8,15)	0,2%	0,6%	0,5%	0,4%	0,6%
74  (2,0,9,172,234)	0,1%	0,0%	0,5%	8,0%	9,5%
75  (14,21,23,33,41)	0,9%	1,2%	1,3%	1,5%	1,7%
76  (6,10,9,8,73)	0,4%	0,6%	0,5%	0,4%	3,0%
77  (36,18,36,36,33)	2,4%	1,1%	2,0%	1,7%	1,3%
80  (33,33,26,22,9)	2,2%	1,9%	1,5%	1,0%	0,4%
81  (17,30,113,160,226)	1,1%	1,8%	6,4%	7,4%	9,1%
82  (43,23,60,104,63)	2,8%	1,3%	3,4%	4,8%	2,5%
83  (34,19,24,32,37)	2,2%	1,1%	1,4%	1,5%	1,5%
87  (36,37,29,37,29)	2,4%	2,2%	1,6%	1,7%	1,2%
89  (136,159,112,107,136)	8,9%	9,3%	6,4%	5,0%	5,5%
90  (2,1,2,0,2)	0,1%	0,1%	0,1%	0,0%	0,1%
91  (19,15,25,38,34)	1,2%	0,9%	1,4%	1,8%	1,4%
92  (8,4,2,3,14)	0,5%	0,2%	0,1%	0,1%	0,6%
93  (0,1,1,3,4)	0,0%	0,1%	0,1%	0,1%	0,2%
94  (3,4,4,7,5)	0,2%	0,2%	0,2%	0,3%	0,2%
101 (28,52,42,110,87)	1,8%	3,1%	2,4%	5,1%	3,5%
102 (3,1,7,5,8)	0,2%	0,1%	0,4%	0,2%	0,3%
104 (0,1,0,1,2)	0,0%	0,1%	0,0%	0,0%	0,1%
106 (0,0,0,0,2)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%
112 (0,0,2,0,2)	0,0%	0,0%	0,1%	0,0%	0,1%
114 (13,11,14,17,8)	0,9%	0,6%	0,8%	0,8%	0,3%
115 (13,3,5,6,2)	0,9%	0,2%	0,3%	0,3%	0,1%
118 (35,25,23,29,8)	2,3%	1,5%	1,3%	1,3%	0,3%
128 (0,1,0,2,3)	0,0%	0,1%	0,0%	0,1%	0,1%
162 (0,0,0,0,2)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%
169 (2,1,1,2,9)	0,1%	0,1%	0,1%	0,1%	0,4%
232 (0,0,0,0,2)	0,0%	0,0%	0,0%	0,0%	0,1%
Other (31,24,25,23,16)	2,0%	1,4%	1,4%	1,1%	0,6%
Note de bas de tableau † Nombre d'isolats 2013, 2014, 2015, 2016 et 2017 respectivement. Retour à la référence de la note de bas de page †