De la surveillance à l'action : l'histoire des Salmonella résistantes aux céphalosporines de troisième génération chez la volaille

Le Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (PICRA)

Le Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (PICRA) est un programme national de surveillance intégrée qui recueille, analyse et communique les tendances en matière d'utilisation des antimicrobiens (UAM) et de résistance aux antimicrobiens (RAM) le long de la chaîne alimentaire, qui concerne les animaux destinés à l'alimentation, la viande vendue au détail et la population humaine à travers le Canada.

L'année 2022 marque 20 ans d'excellence dans l'acquisition de données de surveillance sur la résistance aux antimicrobiens et l'utilisation des antimicrobiens.

2002 à 2004

Risque pour la santé et impact sur la santé publique

• Le PICRA a observé une augmentation préoccupante de la résistance aux céphalosporines de troisième génération (C3G) parmi les Salmonella Heidelberg retrouvées chez des volailles et des personnes malades
• La résistance au ceftiofur (une C3G utilisée pour soigner les animaux) confère de la résistance à la ceftriaxone (une C3G utilisée pour soigner les humains)
• Les C3G sont des antimicrobiens de catégorie I — d'une très grande importance pour la médecine humaine
• S. Heidelberg est un sérotype commun au Canada et peut causer des infections invasives

2005 à 2007

Appel à l'action de l'industrie et changement volontaire de politique

• Dans le cas du ceftiofur, l'utilisation de médicaments en dérogation des directives de l'étiquette (UMDDE) dans les couvoirs de poulets de chair pourrait être à l'origine de la résistance aux C3G chez les Salmonella isolées de la volaille et des personnes maladies
• Il y a eu un retrait volontaire de l'utilisation du ceftiofur dans l'industrie du poulet au Québec (poussins d'incubation et poussins d'un jour) de 2005 à 2007
• La Direction des médicaments vétérinaires de Santé Canada a également modifié l'étiquette du médicament ceftiofur pour déconseiller l'UMDDE
• Diminution de la résistance aux C3G dans les isolats de Salmonella et d'E. coli de poulets vendus au détail et de personnes malades tout au long de la chaîne alimentaire

2008 à 2012

Données du PICRA et impact sur les politiques

• Les données du PICRA ont été citées lors des audiences du Congrès américain (2010) appuyant un lien entre l'utilisation d'antimicrobiens dans l'alimentation des animaux et les répercussions négatives sur la santé humaine
• La Food and Drug Administration des États-Unis s'est servie des données du PICRA pour interdire certaines UMDDE pour les céphalosporines aux États-Unis

2013

Utilisation du ceftiofur et résistance à la ceftriaxone

• En 2013, on a observé une réémergence de la résistance aux C3G pour Salmonella chez des personnes malades et des isolats de poulets vendus au detail
• 31 % des troupeaux ont déclaré avoir utilisé du ceftiofur à la ferme

Figure 1 - Description textuelle

Source	Résistance aux C3G chez les Salmonella en 2013
Poulet (ferme)	24 %
Personnes malades (non typhique)	6 %
Poulets (vendus au détail)	26 %

2014

Intervention de l'industrie avicole

• L'industrie avicole canadienne a cessé d'utiliser les C3G pour la prévention des maladies
• La réduction de l'utilisation du ceftiofur a entraîné une diminution des isolats humains et des poulets résistants à la ceftriaxone
• 6 % (-25 %) des troupeaux ont déclaré avoir utilisé du ceftiofur à la ferme, en 2014

Figure 2 - Description textuelle

Source	Résistance aux C3G chez les Salmonella en 2014
Poulet (ferme)	12 %
Personnes malades (non typhique)	5 %
Poulets (vendus au détail)	21 %

2015 à 2017

Résistance à la ceftriaxone chez les sérotypes non typhiques de Salmonella et d'E. coli générique

• Depuis 2015, aucune utilisation de ceftiofur dans les élevages de poulets de chair n'a été signalée
• Diminution de la résistance à la ceftriaxone dans les isolats d'E. coli et de Salmonella provenant de poulets et de viande de poulet
• Une diminution continue des isolats résistants à la ceftriaxone chez les humains et les poulets a été liée à l'interdiction du ceftiofur

2018

Une histoire en mouvement : résistance aux C3G et sérotypes

• En 2018, la diminution continue de la résistance à la ceftriaxone des sérotypes de Salmonella chez les malades a été observée
• Mais… la majorité de ces isolats résistants étaient des sérotypes Infantis, suivis par Heidelberg
• Parmi les poulets et la viande de poulet, la plupart des isolats de Salmonella résistants à la ceftriaxone étaient des S. Kentucky, suivis des S. Heidelberg et des S. Infantis
• Quelques augmentations de la résistance à la ceftriaxone ont été observées en 2018 par rapport à 2017, notamment chez les Salmonella isolées de poulets provenant de la ferme

2019 jusqu'à présent

Surveillance continue

• Dans l'ensemble, on constate une diminution souhaitée de la tendance à la résistance aux C3G; la résistance à la ceftriaxone reste à un faible niveau
• Cependant, bien qu'il ne soit pas aussi fréquent que d'autres sérotypes présents chez les humains, S. Kentucky joue probablement le rôle de réservoir pour ces gènes de résistance
• L'utilisation d'autres antimicrobiens peut également maintenir la résistance en raison de la cosélection des gènes
• L'industrie avicole s'est engagée à retirer l'utilisation préventive d'autres types d'antimicrobiens importants pour la médecine humaine

Figure 3 - Description textuelle

Année	Ferme (%)	Détail (%)	Humain (%)	Utilisation du ceftiofur (% de troupeaux) - Injectable
2003	s/o	31.5	6.5	s/o
2004	s/o	40.5	7.5	s/o
2005	s/o	13.8	5.3	s/o
2006	s/o	8	3.5	s/o
2007	s/o	9.9	2.1	s/o
2008	s/o	12.4	2.2	s/o
2009	s/o	22.7	2.8	s/o
2010	s/o	22.5	4.7	s/o
2011	s/o	31	6.9	s/o
2012	s/o	26	5.3	s/o
2013	23.9	25.9	5.6	31
2014	11.6	21	5.5	6
2015	12.5	12.5	5.5	0
2016	6.7	6.6	4	0
2017	4.1	6	3.4	0
2018	12.8	9.4	2.6	0
2019	7.6	6.2	3.7	0
2005 à 2007: Retrait volontaire de l'utilisation du ceftiofur 2015: Arrêt de l'utilisation préventive des C3G dans l'industrie avicole

Points clés

• Les données de surveillance du PICRA ont permis d'identifier une tendance inquiétante, qui a conduit à une action gouvernementale (mise en garde sur l'étiquette), à une intervention volontaire de l'industrie et à des actions dans un autre pays
• La réduction de l'utilisation du ceftiofur et la diminution associée de la résistance à la ceftriaxone par rapport aux données antérieures à 2014 chez les poulets et les humains sont un bon exemple d'une intervention réussie pour limiter la résistance aux antimicrobiens
• Une faible résistance à la ceftriaxone persiste malgré la réduction de l'utilisation des antimicrobiens, peut-être en raison du maintien de gènes de résistance par certaines bactéries et certains sérotypes
• Un changement dans l'utilisation des antimicrobiens, même pour ceux qui sont de moindre importance pour la médecine humaine, peut entraîner un changement dans les tendances de la résistance