ARCHIVÉ - Lignes directrices pour la prévention et la lutte contre les atteintes méningococciques

5.0 Diagnostic et typage bactérien

La confirmation en laboratoire d'un diagnostic clinique de MI est un élément important de la détection et de la prise en charge des cas et des éclosions ainsi que de la surveillance régionale et nationale et du suivi des tendances épidémiologiques. Les isolats méningococciques de tous les cas de MI devraient systématiquement être envoyés au laboratoire provincial/territorial pour assurer la surveillance adéquate et opportune des sérogroupes et réaliser un antibiogramme. Les isolats sont transmis au Laboratoire national de microbiologie (LNM) de l'Agence de la santé publique du Canada à des fins de phénotypage et d'analyse génétique.

Pour isoler la bactérie et l'identifier, il faut effectuer une culture du sang, du liquide céphalorachidien (en l'absence de contre-indications à une ponction lombaire) et d'autres prélèvements normalement stériles. Plusieurs centres un peu partout au Canada utilisent le test d'amplification par la polymérase (PCR) pour établir rapidement, à partir d'échantillons de sang total et de liquide céphalorachidien, un diagnostic moléculaire rapide de l'infection à méningocoque et déterminer le sérogroupe en cause. Le test de PCR présente une plus grande sensibilité que la culture, en particulier si l'on a déjà administré des antibiotiques^(8,25-27). La détection des antigènes par la réaction au latex peut être un complément utile.

Le suivi épidémiologique de N. meningitidis au Canada repose sur plusieurs méthodes de laboratoire. Il est possible de déterminer le sérogroupe, le sérotype et le sous-type de l'organisme par l'observation des anticorps ou par le séquençage de l'ADN des gènes responsables. On peut aussi déceler les variations antigéniques des protéines situées sur la membrane externe de l'organisme. Par exemple, un isolat de N. meningitidis C:2a:P1.2 est du sérogroupe C, sérotype 2a, sous-type P1.2.

On peut également avoir recours à des techniques de génotypage, telles que l'électrophorèse enzymatique multilocus (MLEE), le typage génomique multilocus (MLST) et l'électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE). La MLEE et le MLST conviennent davantage à l'étude de l'épidémiologie moléculaire globale. La PFGE peut quant à elle aider à différencier des souches de N. meningitidis au sein d'une population, en particulier durant une période d'incidence accrue de la maladie. La connaissance des profils PFGE peut être très utile dans l'étude des petites populations, où l'incidence de la maladie est élevée même si le nombre de cas est faible, ce qui fait en sorte que des tests de discrimination sont nécessaires pour déterminer si les cas sont causés par des souches différentes ou s'il y a transmission accrue d'une souche donnée.