Infections à E. coli O157:H7 associées à des produits à base de porc au Canada

Résumé

Que connaît-on déjà à ce sujet?

La viande de porc est une source connue, bien que rare, de l'infection chez l'humain à Escherichia coli O157:H7. Chez les humains, les infections à E. coli O157:H7 se manifestent souvent par une affection grave sur le plan clinique, accompagnée de graves complications.

Qu'est-ce que ce rapport apporte de nouveau?

Au cours des mois de juillet à octobre 2014, une éclosion de 119 cas d'infection à E. coli O157:H7 associée à une exposition à des produits de viande de porc contaminés s'est produite en Alberta, au Canada. De la viande de porc et des environnements de production de porc contaminés par E. coli O157:H7 et une mauvaise manipulation des produits du porc ont été repérés à tous les points clés dans la chaîne de distribution de porc en cause. Les mesures visant à maîtriser l'éclosion comprenaient des rappels de produits, la destruction de produits à base de porc, la fermeture temporaire d'établissements alimentaires, des interventions ciblées pour atténuer les mauvaises pratiques en matière de manipulation du porc, ainsi que la poursuite d'un exploitant d'un établissement alimentaire.

Quelles sont les répercussions pour les pratiques de santé publique?

On doit tenir compte du porc dans les recherches et les messages de santé publique concernant E. coli O157:H7, et les pratiques en matière de manipulation et de cuisson du porc doivent être minutieusement évaluées lors des inspections réglementaires des établissements alimentaires.

Introduction

Au cours des mois de juillet à octobre 2014, une éclosion de 119 cas d'infection à Escherichia coli O157:H7 a été repérée en Alberta, au Canada, au moyen de la surveillance des maladies à déclaration obligatoire, et a fait l'objet d'une enquête par les autorités locales, provinciales et fédérales de la santé publique et de réglementation des aliments. Vingt-trois (19 %) des patients ont été hospitalisés, dont six ont présenté un syndrome hémolytique et urémique; aucun décès n'a été signalé. Grâce aux entrevues auprès des cas, sept sources alimentaires potentielles ont été repérées et étudiées. La majorité des patients ont déclaré qu'ils avaient consommé des repas contenant du porc à des restaurants de style asiatique dans plusieurs villes de diverses régions de l'Alberta au cours de la période d'exposition. Les enquêtes de retraçage ont révélé l'existence d'une chaîne complexe de production et de distribution du porc, concentrée entièrement en Alberta. De la viande de porc et des environnements de production de porc contaminés par E. coli O157:H7 et une mauvaise manipulation des produits du porc ont été repérés à tous les points clés dans la chaîne, y compris dans des établissements d'abattage, de transformation, de vente au détail et de restauration. Un profil des grappes d'éclosion obtenu par électrophorèse sur gel en champ pulsé (EGCP) se retrouvait dans des isolats d'E. coli O157:H7 cliniques et de porcs. Les mesures visant à atténuer le risque d'exposition et de maladie comprenaient des rappels de produits à base de porc, la destruction de produits à base de porc, la fermeture temporaire d'établissements alimentaires, des interventions ciblées pour atténuer les mauvaises pratiques en matière de manipulation du porc recensées aux établissements alimentaires en cause, ainsi que la poursuite d'un exploitant d'un établissement alimentaire. On doit tenir compte du porc comme source possible dans les recherches et les messages concernant E. coli O157:H7, et les pratiques en matière de manipulation et de cuisson du porc doivent être minutieusement évaluées lors des inspections réglementaires des établissements alimentaires.

Enquête épidémiologique

Dans le cas de la présente éclosion, un cas a été défini comme une infection à E. coli O157:H7 confirmée en laboratoire à l'aide d'un des 16 profils de grappes d'éclosion EGCP identifiés chez un résident ou un visiteur du Canada durant les mois de juillet à octobre 2014. Les cas ont été recensés par le biais de la surveillance des maladies à déclaration obligatoire.

Un total de 119 cas ont été signalés, dont quatre (3 %) patients qui ont été classés dans la catégorie des infections secondaires (c.-à-d. acquise par un contact familial avec un patient associé à l'éclosion). Tous les patients étaient en Alberta durant toute la période d'incubation ou une partie de celle-ci. Les dates d'apparition de la maladie chez les 119 patients variaient du 20 juillet au 6 octobre (figure 1). Les cas englobaient des personnes d'une vaste distribution géographique partout en Alberta. Vingt-trois (19 %) des patients ont été hospitalisés, dont six ont présenté un syndrome hémolytique et urémique; aucun décès n'a été signalé. L'âge médian des patients était de 23 ans (intervalle = de 1 à 82 ans), et 76 d'entre eux (64 %) étaient des femmes.

Une exposition à des aliments dans des restaurants de style asiatique (36 établissements, largement distribués dans toute la province) a été déclarée par 85 (74 %) des 115 patients de l'éclosion primaire. Les entrevues de routine de santé publique n'ont pas permis de repérer la source. Des entrevues approfondies avec les patients et un suivi aux restaurants ont révélé que la fréquence d'exposition à chacun des sept ingrédients (haricots mungos germés, bœuf, carottes, concombres, échalotes, laitue et porc) excédait 35 %.

Étude environnementale

Les organismes de réglementation ont mené des inspections dans 201 restaurants et installations de transformation des aliments afin d'éclairer l'enquête et de maîtriser l'éclosion. Une enquête approfondie des installations des fournisseurs et des distributeurs de haricots mungos germés ont permis d'éliminer la probabilité que ce produit soit une source de l'infection. Une enquête de retraçage a été lancée chez les fournisseurs des six autres aliments auxquels l'exposition avait été fréquente. Aucun fournisseur unique commun aux restaurants n'a été repéré, en ce qui concerne ces aliments. Le porc a été mis en évidence comme le seul ingrédient dont le réseau de fournisseurs se trouvait entièrement en Alberta et est ainsi devenu la source hypothétique de premier plan de l'éclosion. La confirmation du réseau intra-albertin complexe des fournisseurs de porc (figure 2) a révélé que l'exposition à un aliment d'un établissement du réseau était l'exposition la plus fréquemment recensée (tableau 1) parmi les patients de l'éclosion primaire (96 patients sur 115, soit 83 %). La plupart de ces expositions ont eu lieu dans des restaurants (81, 84 %). Une consommation de porc a été repérée chez 65 % des patients victimes de l'éclosion. Au total, 295 échantillons, y compris des écouvillons de surfaces de l'environnement (n = 157), des aliments (116), des écouvillons de surface d'aliments (13) et de l'eau (9), ont été recueillis et analysés pour détecter la présence de la bactérie E. coli O157:H7. Bien qu'un éventail de types d'échantillons ait été recueilli pour générer des hypothèses, la collecte d'échantillons s'est ultérieurement concentrée sur la viande de porc et les environnements de production de porc, en vertu des résultats de l'enquête. La bactérie E. coli O157:H7 a été détectée dans 18 échantillons^{Note de bas de page *}, qui provenaient tous de viande de porc ou de produits à base de porc ou d'écouvillons de surface dans des établissements de production de porc. À l'exception de deux isolats provenant d'un établissement d'abattage, les profils de grappes d'éclosion EGCP des isolats identifiés chez les patients correspondaient à ceux des isolats des aliments et des échantillons environnementaux. Quatre cas de l'éclosion ont été associés à une exposition à des produits de saucisse de poulet provenant d'un établissement; l'analyse en laboratoire des produits a identifié la bactérie E. coli O157:H7, a détecté du porc, mais n'a pas détecté de volaille. L'enquête a révélé que le producteur de produits de poulet avait acheté des produits de porc frauduleusement étiquetés comme étant du poulet par un distributeur illégal lié à un établissement du réseau de fournisseurs de porc en Alberta.

Description textuelle : Figure 2

Figure 2 : Réseau des fournisseurs de porc en Alberta, éclosion d'infection à E. coli O157:H7 associée à de la viande de porc - Alberta (Canada), de juillet à octobre 2014 ^{Figure 2 note 1Figure 2 note 2Figure 2 note 3Figure 2 note 4}

Au haut de la figure de l’organigramme du réseau de fournisseurs de porc en Alberta, il a quatre cases appelées Abattoir A, B, C et D. À partir de l’abattoir A, il y a deux flèches; l’une pointe vers le transformateur/détaillant A et l’autre, vers le transformateur/détaillant/distributeur A. Aucune flèche ne part de la case du transformateur/détaillant A. Deux flèches partent de la case du transformateur/détaillant/distributeur A. L’une pointe vers le transformateur/détaillant C, qui est agréé par le fédéral, et l’autre, vers cinq restaurants. Deux flèches partent de la case de l’abattoir B, dont l’une pointe vers le transformateur/détaillant A, tout comme l’abattoir A, et l’autre, vers l’abattoir E. Une flèche partant de la case de l’abattoir G pointe également vers l’abattoir E, duquel partent trois flèches. La première flèche pointe vers une case indiquant un restaurant, la deuxième, vers la case du distributeur A et la troisième, vers la case du transformateur/détaillant/distributeur B. Une flèche bidirectionnelle figure entre le transformateur/détaillant/distributeur B et le distributeur A, duquel partent trois autres flèches. Une flèche pointe vers le transformateur/détaillant/distributeur C, une deuxième, vers le transformateur/détaillant D et la troisième, vers une case indiquant quatre restaurants. À partir de la case du transformateur/détaillant D, une flèche pointe vers une case indiquant un restaurant. Six flèches partent de la case du transformateur/détaillant/distributeur B. Une flèche pointe vers la case du distributeur illégal B, qui pointe vers le détaillant A. La deuxième flèche pointe vers deux restaurants. Une troisième flèche pointe vers le transformateur/détaillant/distributeur I qui pointe vers six restaurants. Une quatrième flèche pointe vers le transformateur/détaillant/distributeur H qui pointe vers 41 restaurants. Une cinquième flèche pointe vers 19 restaurants et la sixième, vers le transformateur/détaillant/distributeur J qui, en retour, pointe vers 4 restaurants. Deux flèches partent du transformateur/détaillant/distributeur C. L’une pointe vers 13 restaurants et l’autre, vers le transformateur/détaillant/distributeur G, duquel partent deux autres flèches, dont l’une pointe vers 12 restaurants et l’autre, vers le distributeur C, qui pointe vers 8 restaurants. Trois flèches partent de l’abattoir C; l’une pointe vers le transformateur/détaillant/distributeur B, la deuxième, vers l’abattoir F et la troisième, vers le transformateur/détaillant B. Six flèches partent de l’abattoir F et pointent vers le transformateur/détaillant/distributeur C, 2 restaurants, le transformateur/détaillant/distributeur I, le transformateur/détaillant/distributeur H, 52 restaurants et détaillants, ainsi que le transformateur/détaillant/distributeur F. À partir de l’abattoir D, trois flèches pointent vers les transformateurs/détaillants/distributeurs F, E et D. Trois flèches partent du transformateur/détaillant/distributeur F et pointent vers un restaurant (tout comme le transformateur/détaillant/distributeur E), un autre restaurant (tout comme le transformateur/détaillant/distributeur D), puis un autre restaurant. De plus, le transformateur/détaillant/distributeur E pointe vers deux restaurants (qui sont également liés au transformateur/détaillant/distributeur D).

Tableau 1 : Caractéristiques de l'exposition des 115^{Tableau 1 - Note 1} cas primaires de l'éclosion d'une infection à E. coli O157:H7 associée à de la viande de porc - Alberta (Canada), de juillet à novembre 2014

Lieux potentiels d'exposition	N. de patients ayant été exposés au lieu	N. de patients ayant été exposés au porc (%)
Restaurant(s) de style asiatiqueTableau 1 - Note 2	81	48 (59)
Marché de style asiatiqueTableau 1 - Note 2	3	1 (33)
Producteur/détaillant de saucissesTableau 1 - Note 2	4	4 (100)
Installations alimentaires temporaires lors d'un festivalTableau 1 - Note 2	7	7 (100)
Transformateur/détaillant de viandeTableau 1 - Note 2	1	1 (100)
Restaurant(s) de style asiatiqueTableau 1 - Note 3	4	4 (100)
Établissements sources non suspectsTableau 1 - Note 4	12	10 (83)
Historique peu fiable	3	S.O.
Total	115	75 (65)

Intervention de santé publique

Le service de santé local a ordonné la fermeture temporaire de quatre établissements, y compris un établissement d'abattage et de vente au détail, deux installations de traitement, de distribution et de vente au détail et un établissement de restauration, en raison du nombre de cas associés à une exposition à des aliments distribués par l'établissement, d'infractions graves en matière de manipulation des aliments et/ou d'écouvillons de surface positifs pour E. coli O157:H7. Le distributeur illégal ayant vendu du porc en prétendant qu'il s'agissait de poulet a reçu des ordonnances de la cour lui intimant de fermer son entreprise et de comparaître pour un interrogatoire. L'exploitant ne s'est pas présenté et un mandat d'arrestation a été délivré. L'Agence canadienne d'inspection des aliments a publié des avis de rappel, relativement aux produits de porc (et aux produits de poulet contenant du porc) distribués par six établissements. Plusieurs communiqués de presse publiés dans les médias locaux ont permis d'informer le public à propos de l'enquête sur l'éclosion.

Des analyses des causes fondamentales ont été menées par les organismes de réglementation des aliments à quatre abattoirs du réseau des fournisseurs de porc. Toutes les installations abattaient plusieurs espèces, notamment des bovins. Les observations communes comprenaient des risques de contamination croisée liés au partage des enclos des animaux, au nettoyage et à l'assainissement inadéquats des couteaux entre les carcasses, et à la proximité des carcasses durant les activités d'abattage. Aux installations d'abattage qui avaient été temporairement fermées, on a également observé des pratiques d'hygiène personnelle irrégulières et une mauvaise connaissance de la salubrité des aliments. Des mesures correctives liées aux procédures d'habillage hygiénique, au cheminement du processus, à l'hygiène, au lavage des mains, au nettoyage et à l'assainissement ont été mises en place et surveillées au moyen d'inspections systématiques. Des produits possiblement contaminés ont été retirés d'un établissement.

Les agents d'hygiène du milieu (AHM) du service de santé local ont mené une évaluation exhaustive des pratiques de manipulation du porc et d'autres facteurs contributifs à 111 restaurants (ceux où les patients semblaient avoir contracté l'infection et d'autres restaurants semblables sélectionnés en Alberta). Les agents d'hygiène du milieu ont observé les pratiques utilisées par les exploitants au départ, ont interrogé ces derniers au sujet de leurs procédures à l'aide d'un questionnaire normalisé, et se sont servis de cette information pour orienter les stratégies d'intervention. Seuls 32 % des exploitants appliquaient des procédures validées ou normalisées concernant la cuisson de produits à base de porc, tandis que 77 % des exploitants utilisaient des indicateurs visuels pour déterminer si les produits à base de porc étaient suffisamment cuits. Des risques de contamination croisée qui pourraient avoir contribué à l'infection ont été relevés dans plusieurs restaurants, par exemple, 74 % des établissements n'utilisaient pas un calendrier de nettoyage du matériel de préparation des aliments et, dans 54 % des établissements, les personnes qui manipulaient des aliments ne se lavaient pas les mains entre les différentes tâches. Dans les établissements répondant aux exigences en matière de formation sur la salubrité des aliments (82 %), le personnel dûment formé supervisait rarement de façon directe les activités quotidiennes liées à la manipulation des aliments. Des interventions et des programmes de surveillance continue avec les objectifs à court, moyen et long terme ont été mis en œuvre aux établissements pour atténuer les problèmes cernés. Cette approche progressive comprenait la prestation de formation en matière de salubrité des aliments sur place par les agents d'hygiène du milieu, l'élaboration et la distribution de ressources éducatives dans la langue maternelle des employés (imprimées et en ligne) et une aide à la création de plans de salubrité des aliments pour la cuisson adéquate des produits à base de porc. Les stratégies d'atténuation comprenaient la distribution de thermomètres et de minuteries numériques par les agents d'hygiène du milieu. Au cours des séances de formation sur place, les agents d'hygiène du milieu ont fait la démonstration des procédures adéquates de lavage des mains et d'assainissement des surfaces de l'environnement et ont énuméré d'autres stratégies que les exploitants peuvent utiliser en vue de réduire le risque de contamination croisée. La conformité à ces éléments de salubrité des aliments a été mesurée avant et après la mise en œuvre des stratégies d'atténuation afin d'évaluer les mesures d'intervention choisies.

Discussion

Cette éclosion représente, en importance, la deuxième plus grande éclosion d'origine alimentaire et la troisième éclosion générale d'une infection à E. coli O157:H7 de l'histoire du Canada, après une éclosion d'origine alimentaire associée à du salami produit en Colombie-Britannique, en 1999, avec 143 cas confirmés en laboratoire ^{Note de bas de page 1} et une éclosion d'origine hydrique à Walkerton, en Ontario, en 2000, avec 167 cas confirmés en laboratoire ^{Note de bas de page 2}. De solides données épidémiologiques indiquent que la cause de cette éclosion a été l'exposition à des produits de viande de porc contaminés transformés et distribués en Alberta. L'épidémiologie moléculaire des isolats d'E. coli O157:H7 cliniques et porcins est décrite ailleurs ^{Note de bas de page 3}. La viande de porc est une source connue, bien que rare, de l'infection à E. coli O157:H7 chez l'humain ^{Note de bas de page 4Note de bas de page 5Note de bas de page 6Note de bas de page 7Note de bas de page 8}. La plupart des éclosions documentées ont été associées à des produits de saucisse contenant du porc et d'autres viandes, et l'espèce précise à la source de la contamination n'a pas été confirmée. Il a été signalé que la bactérie E. coli O157:H7 est répandue à l'échelle mondiale à différents taux chez le porc, que les porcs infectés peuvent transmettre la bactérie pendant deux mois et qu'une transmission horizontale entre les porcs et d'autres espèces d'animaux d'élevage pourrait se produire ^{Note de bas de page 9}.

De la viande de porc et des environnements de production de porc contaminés par E. coli O157:H7 et une mauvaise manipulation de produits du porc ont été repérés à tous les points clés dans la chaîne de distribution de porc de l'Alberta en cause, y compris dans les établissements d'abattage, de transformation, de vente au détail et de restauration. Toutefois, la ou les sources initiales de contamination n'ont pas été déterminées. La contamination croisée semble être un important facteur contributif dans cette éclosion, comme en témoigne l'absence d'une exposition connue à du porc dans 35 % des cas de l'éclosion. À la lumière des observations de cette enquête, on doit tenir compte du porc comme source possible dans les recherches et les messages de santé publique concernant E. coli O157:H7, et les pratiques en matière de manipulation et de cuisson du porc doivent être minutieusement évaluées lors des inspections réglementaires des établissements alimentaires.

Remerciements

Brent Friesen, Kate Snedeker, Adrienne MacDonald, organisme de santé publique Alberta Health Services, Linda Chui, Jocelyne Kakulphimp, Laboratoire provincial de santé publique de l'Alberta.