Infections nosocomiales et résistance aux antimicrobiens dans les hôpitaux canadiens

Résumé

Contexte : Les infections nosocomiales (IN) et la résistance aux antimicrobiens (RAM) continuent de contribuer à la morbidité et à la mortalité excessives parmi les Canadiens.

Objectif : Le présent rapport décrit les caractéristiques épidémiologiques et les caractéristiques de laboratoire ainsi que les tendances des IN et de la RAM de 2019 à 2023 (Candida auris 2019–2021) en utilisant les données de surveillance et de laboratoire soumises par les hôpitaux au Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales (PCSIN) et par les laboratoires provinciaux au Laboratoire national de microbiologie (LNM).

Méthodes : Nous avons recueilli des données auprès de 109 hôpitaux de soins de courte durée sentinelles canadiens entre le 1^er janvier 2019 et le 31 décembre 2023 pour les infections à Clostridioides difficile (ICD), les infections sanguines à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), les bactériémies à Enterococcus résistant à la vancomycine (ERV) (en particulier Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium), les infections et colonisations à Enterobacterales productrices de carbapénémase (EPC) et à Acinetobacter baumannii producteur de carbapénémase (APC), et Candida auris (C. auris). Le rapport présente l'analyse des tendances concernant le nombre de cas, les taux d'incidence (taux), les résultats, la caractérisation moléculaire et les profils de résistance aux antimicrobiens.

Résultats : Les taux sont restés relativement stables pour les IDC (intervalle : 4,90–5,35 infections pour 10 000 jours-patients) et les bactériémies à SARM (intervalle : 1,00–1,16 infections pour 10 000 jours-patients) tout en augmentant de manière significative pour les bactériémies à ERV (intervalle : 0,30–0,37 infections pour 10 000 jours-patients). Les taux d'infection par l'EPC sont restés faibles par rapport aux autres IN, mais ont doublé de manière non significative (taux : 0,08–0,16), le nombre d'APC est resté très faible (n = 4 cas) et le nombre d'isolats de C. auris est resté faible (n = 36 isolats).

Conclusion : L'incidence des bactériémies à SARM et des ICD est restée stable, tandis que les bactériémies à ERV et les infections à EPC ont augmenté dans les hôpitaux canadiens de soins de courte durée participant au PCSIN. Peu d'isolats de C. auris ont été repérés. La déclaration de données de surveillance normalisées et l'application cohérente de pratiques de prévention et de contrôle des infections dans les hôpitaux de soins de courte durée sont essentielles pour contribuer à la réduction du fardeau des IN et de la RAM au Canada.

Introduction

Les infections nosocomiales (IN) représentent l'un des événements indésirables les plus courants auxquels sont confrontés les patients dans les établissements de soins de courte durée à l'échelle mondiale ^{Note de bas de page 1}. Outre l'augmentation de la morbidité et de la mortalité, elles sont associées à des durées de séjour plus longues dans les hôpitaux et à des coûts de soins plus élevés ^{Note de bas de page 1}. Au Canada, une étude de prévalence ponctuelle réalisée en 2017 a estimé que la prévalence des patients ayant subi au moins une IN était de 7,9 % ^{Note de bas de page 2}. La prévalence des IN entre 2015 et 2018 a été estimée à 3,2 % aux États-Unis, à 6,5 % en Europe et à 9,9 % en Australie (et elle est probablement deux fois plus élevée dans les pays en développement) ^{Note de bas de page 1Note de bas de page 3Note de bas de page 4Note de bas de page 5}. En Europe, la charge de morbidité cumulée de six IN (infection urinaire, pneumonie, infection du site opératoire, infection à Clostridioides difficile [ICD], bactériémies et septicémie néonatale) est supérieure à la charge de morbidité de 32 autres maladies transmissibles combinées, y compris la grippe et la tuberculose ^{Note de bas de page 6}. Il est important de noter qu'une grande partie des IN sont évitables et que les données américaines montrent que les progrès en matière de soins, de prévention et de contrôle des infections peuvent faire baisser les taux des IN au fil du temps ^{Note de bas de page 4}.

Bon nombre des micro-organismes à l'origine des IN ont une propension à la résistance aux antimicrobiens (RAM), et les taux croissants de résistance menacent de saper les efforts visant à réduire les taux des IN ^{Note de bas de page 6}. L'infection par un organisme résistant est associée à un risque de décès accru de 84,4 % et, en 2019, la RAM bactérienne a été associée à environ cinq millions de décès dans le monde ^{Note de bas de page 7Note de bas de page 8}. Des données canadiennes montrent que l'ICD est liée à une durée d'hospitalisation plus longue, à une mortalité toutes causes confondues plus élevée et à un surcoût moyen de 11 056 dollars par patient ^{Note de bas de page 9}. D'autres données provenant du Canada et de l'étranger montrent que les bactériémies à Staphylococcus aureus (SARM) contribuaient à une morbidité et une mortalité importantes, à des séjours prolongés à l'hôpital et à une augmentation des coûts des soins de santé pour les patients hospitalisés ^{Note de bas de page 10Note de bas de page 11Note de bas de page 12Note de bas de page 13}. On prévoit que le taux de RAM atteindra 40 % d'ici 2050. Dans cette situation, on prévoit que 13 700 Canadiens pourraient mourir chaque année d'infections résistantes et que l'impact annuel global sur le PIB du Canada s'élèverait à 21 milliards de dollars ^{Note de bas de page 14}. En outre, l'émergence de pathogènes résistants tels que Candida auris a nécessité une surveillance accrue et des modifications aux protocoles existants de prévention et de contrôle des infections ^{Note de bas de page 15}. Une action coordonnée de santé publique au niveau mondial, une surveillance, une meilleure gestion des antibiotiques, la prévention et le contrôle des infections et une meilleure sensibilisation du public sont essentielles pour identifier les schémas de résistance aux antimicrobiens et pour prévenir et contrôler les infections émergentes ^{Note de bas de page 16}.

Au Canada, l'Agence de la santé publique du Canada (l'Agence) recueille des données nationales sur diverses IN et sur la RAM dans le cadre du Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales (PCSIN). Créé en 1994, le PCSIN est le fruit d'une collaboration entre l'Agence, l'Association pour la microbiologie médicale et l'infectiologie Canada et des hôpitaux sentinelles de tout le pays. L'objectif du PCSIN est de faciliter et d'informer la prévention, le contrôle et la réduction des IN et des organismes résistants aux antimicrobiens dans les hôpitaux de soins courte durée au Canada par le biais d'une surveillance active et de rapports.

Conformément aux éléments fondamentaux de l'Organisation mondiale de la Santé en matière de prévention et de contrôle des infections ^{Note de bas de page 17}, le PCSIN exerce une surveillance cohérente et normalisée afin d'estimer de manière fiable la charge des IN, d'établir des taux de référence à des fins de comparaison nationale et internationale, d'identifier les facteurs de risque et d'évaluer et d'informer les interventions spécifiques visant à améliorer les résultats pour la santé des patients. Les données fournies par le PCSIN soutiennent directement les objectifs de collaboration décrits dans le Plan d'action pancanadien sur la résistance aux antimicrobiens ^{Note de bas de page 16}.

Dans ce rapport, nous décrivons les données de surveillance des IN et de la RAM les plus récentes recueillies auprès des hôpitaux participant au PCSIN entre 2019 et 2023.

Méthodes

Conception

Le PCSIN effectue une surveillance prospective et sentinelle des IN (y compris des organismes résistants aux antimicrobiens) ^{Note de bas de page 18}.

Définitions de cas

Des définitions de cas normalisées pour les IN et les infections acquises dans la communauté (IAC) ont été utilisées. Voir l'appendice A pour les définitions complètes des cas.

Sources des données

Entre le 1^er janvier 2019 et le 31 décembre 2023, les hôpitaux participants ont soumis des données épidémiologiques et des isolats pour les cas répondant aux définitions de cas respectives pour les ICD, les bactériémies à SARM, les bactériémies à Enterococcus résistant à la vancomycine (ERV) (spécifiquement Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium) et les entérobactéries productrices de carbapénémase (EPC) et Acinetobacter baumannii producteur de carbapénémase (APC) (infections ou colonisations). Les isolats de C. auris (infections ou colonisations) ont été identifiés par les laboratoires provinciaux et territoriaux et les laboratoires des hôpitaux participants. En 2023, 109 hôpitaux dans dix provinces et un territoire ont participé à la surveillance des IN; les activités sont décrites plus en détail dans le tableau 1. La participation des hôpitaux a varié selon le projet de surveillance et l'année(appendice B, figures et tableaux supplémentaires disponibles sur demande auprès de l'auteur). En 2023, dans le cadre de la surveillance des IN du PCSIN, les admissions de patients ont été classées en fonction du nombre de lits de l'hôpital : petit (1 à 200 lits, n = 56 sites, 51 %), moyen (201 à 499 lits, n = 34 sites, 31 %) ou grand (500 lits ou plus, n = 19 sites, 17 %). La participation des hôpitaux varie également selon les régions : Ouest (Colombie-Britannique, Alberta, Saskatchewan et Manitoba, n = 44 sites, 40 %), Centre (Ontario et Québec, n = 38 sites, 35 %), Est (Nouvelle-Écosse, Nouveau-Brunswick, Île-du-Prince-Édouard et Terre-Neuve-et-Labrador, n = 26 sites, 24 %) et Nord (Yukon, Territoires du Nord-Ouest et Nunavut, n = 1, 0,9 %) (tableau 1).

Les données épidémiologiques (démographiques, cliniques et de résultats) et les données de dénominateur (jours-présence et admissions de patients) ont été collectées et soumises par les hôpitaux participants par l'intermédiaire du Réseau canadien de renseignements sur la santé publique, soit une plateforme de données en ligne sécurisée.

Des groupes de travail composés d'experts en maladies infectieuses examinent chaque année les protocoles normalisés et les définitions de cas. Le personnel des hôpitaux participant au PCSIN a reçu une formation sur la transmission des données, selon les besoins. La qualité des données des projets de surveillance est évaluée périodiquement. Plus de détails sur la méthodologie ont été publiée précédemment ^{Note de bas de page 19Note de bas de page 20}.

Données de laboratoire

Tous les isolats de laboratoire liés aux patients (échantillons de selles pour les cas d'ICD) ont été envoyés au Laboratoire national de microbiologie de l'Agence pour une caractérisation moléculaire et des tests de sensibilité des antimicrobiens. Les isolats de bactériémies à SARM, de bactériémies à ERV, d'infections à EPC, de C. auris (2019–2022) et d'ICD pédiatriques ont été soumis tout au long de l'année Les isolats d'ICD adultes ont été soumis chaque année au cours d'une période ciblée de deux mois (du 1^er mars au 30 avril).

Analyse statistique

Les taux des IN ont été calculés en divisant le nombre total de cas identifiés chez les patients admis dans les hôpitaux participant au PCSIN par le nombre total d'admissions de patients (multiplié par 1 000) ou de jours-présence (multiplié par 10 000). En raison du faible nombre de cas, les taux pour C. auris n'ont pas été calculés. Les taux des IN sont rapportés au niveau national et par région. En raison du faible nombre de cas de bactériémies à CA-VRE signalés chaque année, les taux stratifiés ainsi que les taux de mortalité et les résultats de laboratoire pour les bactériémies à CA-VRE n'ont pas été inclus dans ce rapport. Les sites qui n'ont pas été en mesure de fournir des données sur les cas ont été exclus du calcul des taux et les données manquantes du dénominateur ont été estimées à l'aide des données rapportées l'année précédente, le cas échéant. Les données épidémiologiques et moléculaires manquantes ont été exclues de l'analyse. Le test de Mann-Kendall a été utilisé pour évaluer les tendances des taux dans le temps. Le test du χ² pour les tendances a été utilisé pour analyser les tendances dans les proportions au fil du temps. Le test du χ² a été utilisé pour comparer deux variables catégorielles, tandis que le test t a été utilisé pour comparer les différences entre les groupes. Les tests de signification étaient bilatéraux et les différences étaient considérées comme significatives à p ≤ 0,05. La stabilité des taux dans le temps indique qu'aucune tendance statistiquement significative n'a été observée. Lorsqu'elle était disponible, la mortalité attribuable et la mortalité toutes causes confondues ont été rapportées pour les IN. Le taux de mortalité toutes causes confondues a été défini comme le nombre de décès pour 100 cas des IN 30 jours après une culture positive.

Résultats

Infection à Clostridioides difficile

Entre 2019 et 2023, les taux globaux d'ICD sont restés stables, allant de 4,90 à 5,35 infections pour 10 000 jours-patients. Les taux ont d'abord augmenté de 2019 à 2020, puis ont diminué de 2020 à 2022, avant d'augmenter à nouveau en 2023. Cependant, aucune tendance significative n'a été observée (p = 1,0) (tableau 2). L'âge médian des patients atteints d'ICD était de 69 ans (ÉI : 55–79), les hommes et les femmes représentant chacun 50 % du total des cas (appendice B).

Source d'infection : Stratifiée par source d'infection, entre 2019 et 2023 l'incidence d'ICD nosocomiales a peu évolué, passant de 3,62 à 3,56 infections pour 10 000 jours-patients (p = 0,31) (tableau 2). Les taux d'ICD IAC ont augmenté de 1,17 à 1,42 infection pour 1 000 admissions de patients par rapport aux taux de 2019 à ceux de 2023; cependant, cette tendance n'était pas significative (p = 0,32) (tableau 2).

Au niveau régional, les taux d'ICD nosocomiales ont connu des fluctuations dans toutes les régions, avec des changements non significatifs observés entre 2019 et 2023. Plus précisément, la région de l'Ouest a connu une diminution globale de 3,34 à 3,13 infections pour 10 000 jours-patients (p = 0,46), la région Centre est restée stable (3,40–3,77 infections pour 10 000 jours patients (p = 0,61), l'Est a connu une augmentation régulière du taux de 2019 à 2021 (2,90–3,58 infections pour 10 000 jours-patients, p = 0,09), enregistrant une baisse significative de 2022 à 2023 (3,58–3,02 infections pour 10 000 jours-patients, p = 0,05). Pour les ICD IAC, les taux pour 1 000 admissions de patients restent les plus élevés dans la région Centre entre 2019 et 2023 (intervalle : 1,39–1,65), suivi de l'Ouest (intervalle : 0,99–1,58) et de l'Est (intervalle : 0,68–1,05) (appendice B).

Types d'hôpital : Les taux d'ICD nosocomiales pour 10 000 jours-patients étaient systématiquement plus élevés chez les adultes (intervalle : 3,62–3,84, p ≤ 0,005) et les hôpitaux pédiatriques (intervalle : 3,09–3,61, p ≤ 0,005), les taux les plus bas étant observés dans les hôpitaux mixtes (intervalle : 2,57–3,06). Les taux d'ICD IAC pour 1 000 admissions de patients étaient plus élevés chez les adultes (intervalle : 1,55–1,77, p ≤ 0,005) et les hôpitaux mixtes (intervalle : 1,26–1,61), avec des taux plus faibles observés dans les hôpitaux pédiatriques (intervalle : 0,57–1,15, p ≤ 0,005) entre 2019 et 2023 (appendice B). Stratifié taille de l'hôpital, les taux d'ICD nosocomiales étaient généralement les plus élevés dans les grands hôpitaux (intervalle : 3,28–3,87), suivi par les hôpitaux (intervalle : 3,15–3,55) de taille moyenne et de petite taille (intervalle : 2,43–2,84). Les taux d'ICD IAC pour 1 000 admissions de patients étaient comparables pour les grands hôpitaux (intervalle : 1,23–1,69) et les hôpitaux de taille moyenne (intervalle : 1,22–1,47), et plus faibles pour les hôpitaux de petite taille (intervalle : 0,69–1,19) (appendice B).

Mortalité toutes causes confondues à 30 jours : La mortalité globale toutes causes confondues à 30 jours, due à l'ICD est restée stable au fil du temps (intervalle : 8,2–9,0 décès pour 100 cas) (p = 0,81) entre 2019 et 2023 (tableau 2). En 2023, la mortalité toutes causes confondues à 30 jours était significativement plus élevée pour l'ICD nosocomiale (8,7 %) que pour l'ICD IAC (6,3 %) (p = 0,02).

Résistance aux antimicrobiens : De 2019 à 2023, 27,1 % (n = 656/2 424) des isolats d'ICD étaient résistants à un ou plusieurs antimicrobiens testés. La proportion d'isolats de C. difficile résistants à la moxifloxacine a diminué de 7,8 % entre 2019 (11,6 %, n = 66/568) et 2023 (6,3 %, n = 32/506) (tableau 3). Depuis 2019, la résistance à la moxifloxacine a diminué de manière significative parmi les isolats ICD nosocomiales (5,2 %, p = 0,22), tandis qu'une diminution moins importante et non significative a été observée parmi les ICD IAC (5,4 %, p = 0,31) (appendice B). Tous les isolats de C. difficile testés ne présentaient aucune résistance au métronidazole, à la vancomycine ou à la tigécycline.

Typage moléculaire : De 2019 à 2023, les cinq principaux ribotypes d'isolats provenant de cas définis d'ICD nosocomiales étaient 106, 014, 020, 002 et 027 ayant des prévalences globales de 15,3 %, 9,0 %, 6,9 %, 6,0 % et 5,7 %, respectivement, tandis que les cinq principaux ribotypes d'isolats provenant d'ICD IAC étaient 106, 014, 020, 015 et 002 ayant des prévalences globales de 15,2 %, 7,9 %, 7,4 %, 5,8 % et 5,2 %. De 2019 à 2023, la prévalence de RT027 associée à NAP1 a diminué de 7,3 % à 3,3 % et de 3,1 % à 2,1 %, dans les populations ayant des ICD nosocomiales et IAC respectivement (appendice B).

Infections du sang à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline

Entre 2019 et 2023, les taux globaux de bactériémies à SARM sont restés stables, allant de 1,00 à 1,16 infection pour 10 000 jours-patients. Les taux ont atteint leur maximum en 2020 (n = 1,16) et leur minimum en 2022 (n = 1,00); toutefois, aucune tendance significative n'a été observée (p = 0,462) (tableau 4). L'âge médian des patients atteints de bactériémie à SARM était de 55 ans (ÉI : 39–70), les femmes représentant 38 % des cas (appendice B).

Source d'infection : Les taux de bactériémies à SARM IAC sur le site ont légèrement augmenté, passant de 0,59 en 2019 à 0,67 infection pour 10 000 jours-patients en 2023, bien que la tendance ne soit pas significative (p = 0,81). Les taux de bactériémies dues aux SARM nosocomiaux sont restés stables (intervalle : 0,42–0,47 infection pour 10 000 jours-patients) (tableau 4).

Au niveau régional, les taux de bactériémies à SARM nosocomial sont restés stables dans toutes les régions (intervalle pour l'Ouest : 0,47–0,52; intervalle pour le Centre : 0,37–0,52; intervalle pour l'Est : 0,20–0,57; intervalle pour le Nord : 0,00 pour 10 000 jours-patients) (appendice B). Les taux de bactériémies à SARM IAC sont restés stables dans toutes les régions, à l'exception de l'Est où l'on a observé une augmentation significative de 0,41 infection pour 10 000 jours-patients (p = 0,027) (intervalle pour l'Ouest : 0,70–0,83; intervalle pour le Centre : 0,42–0,61; intervalle pour l'Est : 0,09–0,50; intervalle pour le Nord : 0,00 pour 10 000 jours-patients) (appendice B). En 2023, les taux de bactériémies à SARM IAC étaient les plus élevés dans l'Ouest du Canada (0,77 infection par 10 000 jours-patients), et les taux de bactériémies à HA-MRSA étaient les plus élevés dans l'Est du Canada (0,57 infection par 10 000 jours-patients) (appendice B).

Types d'hôpital : Les taux de bactériémies à SARM nosocomial et à SARM IAC étaient systématiquement plus élevés de 2019 à 2023 chez les adultes (intervalle SARM nosocomial : 0,44–0,54, p = 0,007; intervalle SARM IAC : 0,57–0,71, p < 0,001) et les hôpitaux mixtes (intervalle SARM nosocomial : 0,38–0,48, p = 0,01; intervalle SARM IAC : 0,54–0,78, p = 0,004), avec des taux plus faibles observés dans les hôpitaux pédiatriques (intervalle SARM nosocomial : 0,24–0,41; intervalle SARM IAC : 0,28–0,36 infection pour 10 000 jours-patients) (appendice B). Stratifiés par taille de l'hôpital, les taux de bactériémies à SARM nosocomial et à SARM IAC étaient généralement plus élevés dans les hôpitaux de taille moyenne (201–499 lits; SARM nosocomial p = 0,02; SARM IAC p < 0,001) et de grande taille (500 lits ou plus; SARM nosocomial p = 0,07; SARM IAC p < 0,001) (appendice B).

Mortalité toutes causes confondues à 30 jours : Le taux de mortalité toutes causes confondues à 30 jours est resté stable entre 2019 et 2023 (intervalle : 16,4–19,9) (tableau 4). En 2023, la mortalité toutes causes confondues à 30 jours était significativement plus élevée pour les bactériémies à SARM nosocomial (24,7 %) que pour les SARM IAC (15,2 %) (p < 0,001).

Résistance aux antimicrobiens : La résistance à la clindamycine parmi les isolats de SARM a diminué de manière significative, passant de 40 % à 20 % entre 2019 et 2023 (p = 0,027) (tableau 5). Depuis 2019, la proportion d'isolats de SARM résistants à l'érythromycine et à la ciprofloxacine est restée relativement stable et élevée à environ 70 % par rapport aux autres antibiotiques testés. Tous les isolats de bactériémies à SARM soumis entre 2019 et 2023 étaient sensibles au linézolide et à la vancomycine.

En comparant les isolats des cas de SARM nosocomial avec ceux des cas de SARM IAC, la résistance à la clindamycine était systématiquement plus élevée parmi les isolats de SARM nosocomial chaque année, de 2019 (47,5 %, n = 160/337 vs 30,3 %, n = 122/403) à 2023 (31,6 %, n = 87/275 vs 17,0 %, n = 70/412) (appendice B). Il n'y a pas eu d'autres différences notables dans les profils de résistance aux antibiotiques selon le type de cas de bactérie SARM.

Typage moléculaire : Entre 2019 et 2023, la proportion de types de spas identifiés comme t002, le plus souvent associés au SARM nosocomial a continué à diminuer, passant de 20,2 % de tous les isolats dans les cas nosocomiaux en 2019 à 9,5 % en 2023 (p < 0,001) (appendice B). Parallèlement, le type de spa t008, historiquement le plus souvent associé au SARM IAC, a continué d'augmenter et représente la plus grande proportion d'isolats identifiés dans les cas définis de SARM IAC (42,4 % en 2019 à 48,8 % en 2023, p = 0,04) et de SARM nosocomial (28,5 % en 2019 à 40,0 % en 2023, p < 0,001) (appendice B).

Infections du sang à Enterococcus résistant à la vancomycine

De 2019 à 2023, les taux de bactériémies à ERV ont augmenté de manière significative, passant de 0,30 à 0,37 infection pour 10 000 jours-patients (p = 0,02) (tableau 6). L'âge médian des patients atteints d'une bactériémie à ERV était de 62 ans (ÉI : 51–71) et les femmes représentaient 40 % des cas de bactériémies à ERV (appendice B).

Source d'infection : Les bactériémies à Enterococcus résistant à la vancomycine étaient majoritairement nosocomiales, puisque 89,5 % (n = 1 199/1 339) de ces cas déclarés entre 2019 et 2023 ont été acquis dans un établissement de soins de santé. Stratifiés par source d'infection, les taux de bactériémies à ERV nosocomial ont significativement augmenté entre 2019 et 2023, passant de 0,27 à 0,33 infections pour 10 000 jours-patients (p = 0,03) (appendice B). Les taux de bactériémies à ERV IAC sont restés faibles et stables dans le temps (intervalle : 0,02–0,04 infection pour 10 000 jours-patients).

Au niveau régional, les taux de bactériémies à ERV dans l'Ouest du Canada ont augmenté de manière significative, passant de 0,29 à 0,48 infection pour 10 000 jours-patients de 2019 à 2023 (p = 0,04). Aucune tendance significative n'a été observée dans la région centrale (intervalle : 0,29–0,39 infections pour 10 000 jours-patients, p = 1,00) et à l'Est du Canada (intervalle : 0–0,04 infection pour 10 000 jours-patients, p = 0,16) (appendice B).

Types d'hôpital : Stratifiés par type d'hôpital, les taux de bactériémies à ERV sont restés les plus élevés dans les hôpitaux pour adultes de 2019 à 2023 (intervalle : 0,38–0,48 infection pour 10 000 jours-patients). De 2019 à 2023, les taux de bactériémies à ERV dans les hôpitaux pédiatriques étaient faibles (intervalle : 0–0,25 infection pour 10 000 jours-patients). En 2019, les taux de bactériémies à ERV étaient les plus élevés dans les petits (1–200 lits) et les grands hôpitaux (500 lits ou plus) avec 0,35 infection pour 10 000 jours-patients, contre 0,26 infection pour 10 000 jours-patients dans les hôpitaux de taille moyenne (201–499 lits). Aucune tendance significative n'a été observée au fil du temps pour toutes les catégories de lits d'hôpitaux. En 2023, les taux de bactériémies à ERV dans les grands hôpitaux étaient les plus élevés, avec 0,49 infection pour 10 000 jours-patients, contre 0,31 dans les hôpitaux de taille moyenne et 0,16 dans les petits hôpitaux (appendice B). Les taux d'incidence de bactériémies à ERV nosocomial par région par type et taille d'hôpital sont présentés dans l'appendice B.

Mortalité toutes causes confondues à 30 jours : Le taux de mortalité toutes causes confondues est resté relativement stable entre 2019 et 2023 (intervalle : 33,5–38,4) (p = 0,23) (tableau 6).

Résistance aux antimicrobiens : Entre 2019 et 2023, la résistance de haut niveau à la gentamicine parmi les isolats d'infection du sang à ERV (Enterococcus faecium) a diminué de 32,9 % à 18,1 % (p = 0,01) (tableau 6). La résistance à la daptomycine a connu une diminution significative, passant de 4,0 % (n = 7 isolats) en 2019 à 1,8 % (n = 4 isolats) en 2023 (p = 0,04).

Typage moléculaire : De 2019 à 2023, la majorité des isolats de bactériémie à ERV ont été identifiés comme étant E. faecium; cependant, un E. faecalis a été identifié en 2020 (0,7 %), 2021 (0,6 %) et 2022 (0,5 %), respectivement, et trois (1,4 %) en 2023 (appendice B). La présence accrue de VanB chez E. faecium est passée de 0,6 % (n = 1) en 2019 à 7,2 % (n = 16) en 2023 (appendice B). Parmi les isolats d'E. faecium, un changement dans les types de séquences prédominants a été observé au cours des cinq dernières années. Parmi les isolats d'E. faecium, la proportion identifiée comme étant de type de séquence (ST) 1478 était la plus élevée en 2019 (31,2 %, n = 54/173) et a diminué à 1,4 % (n = 3/221) en 2023 (p = 0,04) (appendice B). En outre, la proportion d'isolats ST17 a augmenté de manière significative entre 2019 (17,9 %, n = 31/173) et 2023 (30,3 %, n = 67/221) (p = 0,40) (appendice B). La proportion d'isolats ST80 a augmenté de manière significative entre 2019 (15,6 %, n = 27/173) et 2023 (31,7 %, n = 70/221) (p = 0,01) (appendice B) et représente désormais le ST prédominant parmi tous les isolats testés.

Entérobactéries productrices de carbapénémase (EPC) et Acinetobacter baumannii (APC)

De 2019 à 2023, les taux d'infection à EPC sont restés faibles par rapport aux autres IN au Canada, bien qu'il y ait eu une augmentation non significative des taux au cours de cette période (0,08–0,16 infection pour 10 000 jours-patients, p = 0,08) (tableau 7). Le nombre d'infections à ACP était très faible, avec cinq cas ou moins par an entre 2019 et 2023. L'âge médian des infections à EPC était de 65 ans et 43 % des cas étaient des femmes (appendice B).

De 2019 à 2023, la majorité des infections à EPC (94,8 %) ont été identifiées dans les régions centrales (49,3 %, n = 220/446) et dans les territoires l'Ouest du Canada (45,5 %, n = 203/446), tandis que peu d'infections ont été identifiées dans l'Est (5,2 %, n = 23/446) (appendice B). De 2019 à 2023, les grands hôpitaux (500 lits ou plus) ont généralement déclaré les taux les plus élevés d'infections à EPC (0,09–0,22 infection pour 10 000 jours-patients) par rapport aux petits hôpitaux (moins de 200 lits) (0,1–0,07 infection pour 10 000 jours-patients). De 2017 à 2021, 30,8 % (n = 102/331) des patients infectés par EPC ont déclaré avoir voyagé à l'étranger, et parmi eux, 83,3 % (n = 75/90) ont reçu des soins médicaux à l'étranger. La majorité des infections à EPC ont été contractées au Canada, 84,2 % (n = 331/393) des infections à EPC ayant été contractées au Canada et 81,9 % (n = 271/331) ayant été contractées dans un hôpital canadien de soins de courte durée entre 2019 et 2023.

Organismes : Sur l'ensemble des isolats soumis (infections et colonisations), les quatre principaux organismes producteurs de carbapénémase en 2023 sont Escherichia coli (41,3 %), Klebsiella pneumoniae (16,4 %), Enterobacter cloacae (16,4 %) et Citrobacter freundii (14,2 %). De 2019 à 2023, on observe une augmentation de la proportion de carbapénémases produites par E. coli (33 %–41,3 %) et une diminution de la proportion de carbapénémases produites par K. pneumoniae (21,4 %–16,4 %) et E. cloacae (19,8 %–16,4 %) (appendice B). Les carbapénémases prédominantes identifiées au Canada étaient la K. pneumoniae productrice de carbapénémase (KPC), la New Delhi métallo β-lactamase (NDM) et la carbapénémase de type cxacillinase 48 (OXA-48), représentant 96,2 % des carbapénémases identifiées entre 2019 et 2023. Historiquement, la KPC a été la carbapénèmase la plus fréquemment identifiée au Canada; cependant, la proportion de KPC et de NDM n'a cessé de se rapprocher et était presque égale en 2023.

Mortalité toutes causes confondues à 30 jours : La mortalité toutes causes confondues pour les infections à EPC a fluctué entre 2019 et 2023 avec une moyenne de 20 % (tableau 7).

Résistance aux antibiotiques : Une multirésistance (MR) et une ultrarésistance aux médicaments (UR) ont été observées parmi les EPC (appendice B) ^{Note de bas de page 21}. Toutes années confondues, les isolats producteurs de NDM ont majoritairement démontré une UR (intervalle : 83,8–91,8). Inversement, en 2019, les producteurs de type OXA-48 étaient précédemment associés à une proportion plus élevée d'UR ou de MR (89,1 %) qu'en 2023 (63,5 %), ce qui montre une tendance générale à la baisse de la résistance. La carbapénémase de K. pneumoniae a été répartie de manière plus égale sur la période 2019–2023, soit pour l'UR (intervalle : 40,8–50,1) ou pour la MR (intervalle : 40,8–52,2). En examinant la résistance parmi les trois principales carbapénèmases, nous avons noté une augmentation de la résistance à tous les aminoglycosides entre 2021 et 2023 chez les producteurs de KPC (appendice B). En revanche, parmi les producteurs de type OXA-48, on a observé une diminution de la résistance à l'aztréonam, à la doxycycline, à la lévofloxacine, à la minocycline, au triméthoprime/sulfaméthoxazole, aux carbapénèmes, aux céphalosporines, à la tobramycine et à la gentamicine. Cela concorde avec les observations selon lesquelles moins de producteurs de type OXA-48 étaient l'UR ou la MR au fil du temps. De 2019 à 2023, la résistance globale des producteurs de KPC, NDM et OXA-48-like à l'ertapénème était respectivement de 78,2 %, 97,8 % et 66,9 %, et de 59,1 %, 92,3 % et 16,5 % pour le méropénem. Parmi les nouvelles associations médicamenteuses, les producteurs de KPC et d'OXA-48-like étaient très sensibles au méropénem/vaborbactam et à la ceftazidime/avibactam. La résistance à l'imipénème/relebactam par année variait de 11,1 % à 17,4 % chez les producteurs de type OXA-48 et de 86,3 % à 93,1 % chez les producteurs de NDM. La résistance au méropénem/vaborbactam chez les producteurs de NDM était comprise entre 61,3 % et 76 % par an.

Candida auris

Soixante-six pourcent (n = 72/109) des hôpitaux du PCSIN participent à la surveillance de C. auris, et entre la surveillance du PCSIN et celle du Laboratoire national de microbiologie, un total de 36 isolats (colonisations et infections) a été rapporté de 2019 à 2023. Le nombre de cas de C. auris détectés par an était de sept en 2019, quatre en 2020, trois en 2021, douze en 2022 et dix en 2023. Vingt-et-un cas ont été recensés dans l'Ouest du Canada, neuf dans le centre du pays et un dans l'est. Sur les 36 isolats de C. auris, 19,4 % étaient résistants à l'amphotéricine B et 77,8 % au fluconazole (tableau 8). Les isolats résistants à l'amphotéricine B étaient également résistants au fluconazole, de sorte que 19,4 % des isolats étaient multirésistants (résistants à deux classes d'antifongiques). D'après les renseignements disponibles sur les voyages, 73,3 % des personnes ayant déclaré avoir voyagé ont également reçu des soins de santé à l'étranger (tableau 8). Sur les onze patients ayant reçu des soins à l'étranger, sept avaient un statut connu d'organisme producteur de carbapénémase (OPC) et deux étaient positifs à l'OPC.

Discussion

Les données de surveillance du Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales ont montré qu'entre 2019 et 2023, les taux d'infection au Canada sont restés relativement stables pour les ICD (3 %) et les bactériémies à SARM (−0,8 %). Les taux ont augmenté pour les bactériémies à ERV et les infections à EPC (23,3 % et 100 %, respectivement), mais restent inférieurs aux taux d'ICD et de bactériémies à SARM. Peu d'isolats de C. auris ont été identifiés entre 2019 et 2023.

Les patients atteints de bactériémie à SARM avaient un âge médian de 55 ans (ÉI : 39–70) et étaient plus jeunes que les cas d'ICD (69 ans) ou de bactériémie à ERV (62 ans). Le délai médian entre l'admission et un test positif pour les patients atteints de bactériémies à SARM nosocomial liées à votre établissement de soins de courte durée était de 13 jours (ÉI : 3–30), ce qui est plus court que pour les bactériémies à ERV (19 jours) et l'ECP (20 jours), mais plus long que pour l'IDC (10 jours). Les infections à ICD se sont produites de manière plus égale chez les hommes et les femmes (50 % chacun), par rapport à 40 % de femmes pour les bactériémies à ERV, à 38 % de femmes pour les bactériémies à SARM et 43 % de femmes pour les infections à EPC (appendice B).

Les tendances des taux d'ICD observées dans le réseau du PCSIN sont harmonisées avec des tendances comparables rapportées au niveau mondial ^{Note de bas de page 22}, où la COVID-19 pourrait avoir contribué à l'augmentation en 2020 des taux des IN et d'ICD après les déclins pandémiques antérieurs à la COVID-19 ^{Note de bas de page 23}. Au-delà de COVID-19, les taux IN-ICD ont continué à diminuer tandis que les taux d'ICD IAC sont revenus aux niveaux prépandémiques ^{Note de bas de page 23}. Si l'on effectue une comparaison à l'échelle mondiale, les taux des IN (3,85 pour 10 000 jours-patients) et d'ICD IAC (1,83 pour 1 000 admissions de patients) observés dans le réseau du PCSIN étaient plus élevés que ceux rapportés dans les hôpitaux de soins de courte durée des pays de l'Union européenne/de l'Espace économique européen, qui ont rapporté un taux d'ICD nosocomiales de 2,58 pour 10 000 jours-patients et un taux de ICD IAC de 1,35 pour 1 000 admissions de patients en 2020 ^{Note de bas de page 22}.

La résistance aux antimicrobiens de C. difficile est moins fréquente au Canada qu'aux États-Unis ou dans le monde ^{Note de bas de page 24}. Dans un échantillon représentatif d'hôpitaux de soins de courte durée canadiens, de 2019 à 2023, une diminution de 5,3 % de la résistance à la moxifloxacine dans les populations atteinte d'IDC nosocomiales et d'ICD IAC est concordante avec une diminution globale de la prévalence de RT027. En outre, la résistance à la moxifloxacine est restée plus faible (6,3 % en 2023) que les données de résistance pondérées et regroupées précédemment publiées pour l'Amérique du Nord (44,0 %) et l'Asie (33,0 %) ^{Note de bas de page 25Note de bas de page 26}. La diminution de la prévalence du RT027 a été remplacée par une augmentation concomitante de la prévalence du RT106, du RT014 et du RT020, conformément aux tendances observées aux États-Unis ^{Note de bas de page 27Note de bas de page 28}. En outre, l'émergence du RT106, que l'on trouve désormais dans le monde entier, pose des problèmes supplémentaires, car il a été démontré que cette souche produit davantage de spores, présente des taux de récurrence plus élevés et s'avère hautement résistante à l'érythromycine, à la clindamycine, aux fluoroquinolones et aux céphalosporines de troisième génération. L'émergence potentielle de ribotypes résistants justifie la poursuite de la surveillance, du contrôle et de l'investigation ^{Note de bas de page 27Note de bas de page 29}.

Entre 2019 et 2023, les taux de bactériémies à SARM dans le réseau du PCSIN sont restés stables, fluctuant entre 1,00 et 1,16 infection pour 10 000 jours-patients. De 2019 à 2023, les taux de bactériémies à SARM IN dans le PCSIN (0,42–0,47 infection pour 10 000 jours-patients), étaient notamment plus élevés que les taux rapportés dans les hôpitaux publics australiens entre 2018 et 2022 (0,11–0,13 infection pour 10 000 jours-patients), probablement en raison des définitions plus larges du PCSIN qui prennent en compte davantage de cas ayant des liens indirects avec les soins de santé ^{Note de bas de page 30}. Cependant, le taux du PCSIN pour 2023 (0,47 infection) est comparable au taux rapporté dans les hôpitaux américains pour la même année (0,49 infection pour 10 000 jours-patients), où les définitions de la surveillance en laboratoire sont semblables ^{Note de bas de page 31}. Le taux de bactériémies à SARM IAC dans le PCSIN pour 2023 (0,67 infection pour 10 000 jours-patients) est inférieur au taux rapporté dans les hôpitaux américains pour la même année (0,84 infection), ce qui reflète des populations différentes ^{Note de bas de page 31}. Les taux de bactériémies à SARM IAC ont connu une augmentation soutenue dans les données du PCSIN depuis 2019, ce qui suggère une expansion du bassin communautaire de SARM au Canada et dans le monde ^{Note de bas de page 32Note de bas de page 33}.

Les taux de mortalité à 30 jours toutes causes confondues du PCSIN pour les bactériémies à SARM (nosocomial : 20,1 %–25,0 %; IAC 13,6 %–17,4 %) étaient inférieurs à ceux rapportés aux États-Unis (nosocomial : 29 %; IAC : 18 %) ^{Note de bas de page 33}. Les différences peuvent provenir de la limite stricte de mortalité à 30 jours du PCSIN par rapport aux délais non définis des États-Unis, ou des différences entre les systèmes de soins de santé, les stratégies de prévention des infections et les caractéristiques de la population ^{Note de bas de page 34Note de bas de page 35}.

Une diminution significative de 20 % de la résistance à la clindamycine parmi les isolats de bactériémies à SARM entre 2019 et 2023 a coïncidé avec des changements dans les types de spa SARM. La proportion du type de spa t002 (normalement SARM nosocomial) a diminué, tandis que le type de spa t008 (historiquement SARM IAC) a augmenté. Notamment, le t008 a augmenté parmi les isolats de SARM IAC (42,4 % à 48,8 %) et les isolats de SARM nosocomial (28,5 % à 40,0 %). Cette évolution souligne le rôle croissant des clones de SARM IAC dans les établissements de santé et met en évidence la nature dynamique de l'épidémiologie du SARM. La prévalence croissante des clones traditionnels IAC dans les hôpitaux souligne la nécessité d'une surveillance continue et de stratégies de prévention des infections adaptées. La surveillance continue des schémas de résistance aux antimicrobiens est essentielle pour orienter les protocoles de traitement et atténuer le fardeau du SARM dans les établissements de soins de santé et les collectivités. Les populations présentant un risque accru d'infection par le SARM IAC sont les enfants, les athlètes, les personnes incarcérées, les personnes âgées présentant des comorbidités et les personnes qui s'injectent des drogues ^{Note de bas de page 34Note de bas de page 35}. La consommation de drogues injectables, en particulier, pourrait signaler l'émergence d'une population à risque pour le SARM IAC. Des stratégies telles que le dépistage et la décolonisation des porteurs de SARM dans les populations à haut risque pourraient contribuer à réduire la charge globale des bactériémies à SARM ^{Note de bas de page 34Note de bas de page 35Note de bas de page 36}.

Il a été démontré que la résistance à la vancomycine liée aux bactériémies à ERV est associée à des taux de mortalité plus élevés et à des séjours hospitaliers plus longs, ce qui en fait un problème de santé publique important ^{Note de bas de page 37Note de bas de page 38Note de bas de page 39}. Les taux de bactériémies à Enterococcus résistant à la vancomycine observés dans le réseau PCSIN ont augmenté au fil du temps entre 2019 et 2023 et ont été les plus élevés en 2023 (0,37 infection pour 10 000 jours-patients). Le succès de certains types de séquences contribue probablement à l'augmentation de la charge de morbidité liée aux infections à ERV dans les hôpitaux participant au PCSIN. En 2023, les clones ST17 (30,3 %) et ST80 (31,7 %) étaient les clones prédominants, dépassant le clone ST1478 (1,4 %) qui dominait auparavant. Par rapport à d'autres types de séquences, une association distincte a été repérée entre le ST80 et le gène VanB. Cette association de gènes VanB hébergés principalement parmi les isolats ST80 a également été documentée dans des études récentes liées à des éclosions de VanB en Suède et au Danemark ^{Note de bas de page 40Note de bas de page 41}. Les tendances des bactériémies à ERV sont également influencées par le nombre de patients à haut risque admis à l'hôpital (par exemple, greffes de moelle osseuse, greffes d'organes solides, patients cancéreux, etc.) ^{Note de bas de page 42Note de bas de page 43}. La plupart des cas de bactériémies à ERV signalés par les hôpitaux participant au PCSIN étaient des infections associées aux soins de santé, ce qui souligne l'importance d'un dépistage approprié, du respect des mesures de prévention des infections et d'une bonne gestion des antimicrobiens. Bien que l'on manque de données récentes sur les taux de bactériémies à ERV dans des administrations comparables, des tendances à la hausse ont été observées en Europe ^{Note de bas de page 44Note de bas de page 45Note de bas de page 46Note de bas de page 47Note de bas de page 48}, qui peuvent être associées, en partie, à l'introduction et à la propagation d'un nouveau clone et à des lacunes dans les pratiques de prévention des infections ^{Note de bas de page 44Note de bas de page 45Note de bas de page 46Note de bas de page 47Note de bas de page 48Note de bas de page 49}.

Les infections à Enterobacterales productrices de carbapénémases constituent une menace importante pour la santé publique; elles sont de plus en plus répandues dans les environnements de soins de santé du monde entier, et sont associées à une mortalité élevée et à des options thérapeutiques limitées ^{Note de bas de page 50Note de bas de page 51Note de bas de page 52Note de bas de page 53}. Les Centres de contrôle et de prévention des maladies et l'Organisation mondiale de la Santé ont classé les infections à Enterobacterales productrices de carbapénémases (EPC) parmi les menaces les plus urgentes en matière de résistance aux antimicrobiens ^{Note de bas de page 54Note de bas de page 55}. Alors que le nombre d'infections à EPC a augmenté de 2019 à 2021 dans le réseau du PCSIN, le taux d'incidence a diminué par rapport à d'autres IN. Les données sur l'incidence des infections à EPC dans d'autres pays, tels que le Danemark, l'Italie, la Suisse et le Royaume-Uni, ont également montré une augmentation de l'incidence de ces infections ^{Note de bas de page 56Note de bas de page 57Note de bas de page 58Note de bas de page 59}. Historiquement, les infections à EPC étaient principalement associées aux voyages internationaux, mais on observe depuis quelques années une évolution vers IAC. Entre 2020 et 2023, 84,6 % des infections à EPC ont été contractées dans le pays et 80,8 % dans un hôpital canadien de soins de courte durée, ce qui suggère que la transmission intrahospitalière est à l'origine de la récente augmentation de l'incidence des infections à EPC. Par conséquent, la mise en œuvre stricte de mesures de contrôle des infections, notamment le dépistage chez les patients ayant déjà été hospitalisés dans le pays ou à l'étranger, est utile pour réduire la transmission des infections à EPC dans les hôpitaux de soins de courte durée au Canada.

Candida auris est une levure émergente multirésistante qui peut provoquer des infections invasives et des éclosions associées aux soins de santé ^{Note de bas de page 60}. Il a été détecté dans de nombreux pays et continents, y compris au Canada, depuis sa première détection en 2009 ^{Note de bas de page 61Note de bas de page 62Note de bas de page 63Note de bas de page 64}. Candida auris a été associé à des éclosions dans les établissements de santé de nombreux pays, y compris au Canada et aux États-Unis, bien que les éclosions au Canada aient été limitées à quelques cas jusqu'à présent ^{Note de bas de page 60}. La mortalité brute rapportée pour C. auris varie largement entre 15 et 60 %, mais elle est généralement similaire à celle d'autres espèces de Candida ^{Note de bas de page 60Note de bas de page 61Note de bas de page 62Note de bas de page 63Note de bas de page 64Note de bas de page 65Note de bas de page 66}. Bien qu'ils soient encore relativement rares au Canada, les États-Unis ont signalé plus de 4 500 cas cliniques et plus de 9 000 cas de dépistage en 2023 ^{Note de bas de page 67}. L'identification de C. auris dans les laboratoires de microbiologie de routine nécessite l'identification de Candida au niveau de l'espèce, ce qui n'est pas toujours le cas pour les isolats provenant de sites non stériles. Les options thérapeutiques sont limitées pour les patients, car un tiers des isolats de C. auris identifiés Canada étaient résistants à plusieurs médicaments et une résistance supplémentaire peut se développer au cours du traitement antifongique ^{Note de bas de page 68}. Par conséquent, l'identification rapide, le dépistage de la colonisation chez les patients à risque et la mise en œuvre stricte de mesures de prévention et de contrôle des infections sont nécessaires pour réduire la transmission de C. auris dans les établissements de santé canadiens. Il est important de continuer à signaler la présence de C. auris au Canada pour évaluer et surveiller le risque lié à ce pathogène, ainsi que pour identifier les tendances épidémiologiques et microbiologiques ^{Note de bas de page 69}.

Forces et limites

La principale force du PCSIN est la collecte de données épidémiologiques et de laboratoire normalisées et détaillées auprès de 109 hôpitaux sentinelles à travers le Canada, dans le but de fournir des tendances nationales en matière de IN et de RAM à des fins d'analyse comparative et d'informer les pratiques de prévention et de contrôle des infections en milieu hospitalier.

Les données épidémiologiques recueillies par le PCSIN se limitent aux renseignements disponibles dans les dossiers des patients. La rotation du personnel hospitalier peut affecter l'application cohérente des définitions du PCSIN lors de l'examen des dossiers médicaux; toutefois, ces données ont été recueillies par du personnel expérimenté et formé à la prévention et au contrôle des infections, qui reçoit une formation périodique sur les méthodes et les définitions du PCSIN. En outre, des évaluations de la qualité des données ont été réalisées afin de les maintenir et de les améliorer. Ces données peuvent être sujettes à un biais de sélection potentiel dû à l'exclusion des sites dont les données sont manquantes ou incomplètes tout au long de la période d'étude. Une des limites de la surveillance de C. auris est que des données épidémiologiques détaillées ne sont disponibles que pour les patients identifiés dans les hôpitaux participant au PCSIN. De 2019 à 2023, la couverture par le PCSIN des lits de soins de courte durée au Canada est passée de 33 % à 37 %, avec notamment une représentativité accrue des populations nordiques, communautaires, rurales et autochtones.

Conclusion

Les résultats de la surveillance d'un réseau sentinelle national d'hôpitaux de soins de courte durée canadiens indiquent que les taux de bactériémies à SARM et d'ICD sont restés stables entre 2019 et 2023, tandis que les taux de bactériémies à ERV et d'infections à EPC ont augmenté. Peu de cas de C. auris ont été détectés au Canada entre 2012 et 2021. Une surveillance cohérente et normalisée des données épidémiologiques et de laboratoire sur les IN est essentielle pour fournir aux praticiens hospitaliers des taux de référence et informer les politiques de prévention et de contrôle des infections et de gestion des antimicrobiens afin de réduire le fardeau des IN et l'impact de la résistance aux antimicrobiens dans les hôpitaux de soins de courte durée au Canada.

Des efforts sont actuellement déployés pour améliorer la qualité et la représentativité des données de surveillance des IN au Canada. Une enquête améliorée sur les pratiques de dépistage des hôpitaux est menée chaque année pour mieux comprendre et contextualiser l'évolution des taux des IN dans le réseau du PCSIN. En outre, le PCSIN mène une enquête de prévalence ponctuelle (EPP) pour évaluer la charge et l'incidence des IN et l'utilisation des antimicrobiens dans les hôpitaux canadiens de soins de courte durée participants, et pour établir des taux de référence continus. La quatrième EPP du PCSIN s'est déroulée de février à mars 2024. Le PCSIN continue de mettre à jour les taux des IN, d'organismes résistants aux antibiotiques et d'infections respiratoires virales, y compris la COVID-19, sur un tableau de bord accessible au public à l'aide de l'Infobase santé du Canada ^{Note de bas de page 70}. Afin d'améliorer la représentativité et la généralisation des taux de référence nationaux des IN, le PCSIN a lancé un ensemble de données simplifié accessible à tous les hôpitaux de soins de courte durée du Canada pour collecter et visualiser les données sur les taux annuels d'infections nosocomiales, et plus de 100 hôpitaux participent au projet. Enfin, le PCSIN étudie la surveillance des IN dans le secteur des soins de longue durée au Canada afin de mieux comprendre le fardeau des infections associées aux soins de santé au sein de cette population à risque.

Déclaration des auteurs

Les hôpitaux du Programme canadien de surveillance des infections nosocomiales ont apporté leur expertise dans l'élaboration de protocoles ainsi que dans la collecte et la soumission de données épidémiologiques et d'isolats de laboratoire Le Laboratoire national de microbiologie a effectué les analyses de laboratoire et a contribué à l'interprétation et à la révision de l'article. Des épidémiologistes de l'Agence de la santé publique du Canada ont été chargés de la conception, de l'analyse, de l'interprétation, de la rédaction et de la révision de l'article.

Intérêts concurrents

Aucun.

Remerciements

Nous remercions les médecins, les épidémiologistes, les spécialistes contribuant à la lutte contre les infections, et le personnel de laboratoire de chaque hôpital participant pour leur contribution : Hôpital général de Vancouver (VGH), Vancouver, Colombie-Britannique (BC); Hôpital général de Richmond, Richmond, BC; Hôpital de l'Université de la Colombie-Britannique, Vancouver, BC; Lion's Gate, North Vancouver, BC; Hôpital général de Powell River, Powell River, BC; Hôpital Sechelt (autrefois St. Mary's), Sechelt, BC; Hôpital général de Squamish, Squamish, BC; Hôpital général de Victoria, Victoria, BC; Hôpital Royal Jubilee, Victoria, BC; Hôpital général régional de Nanaimo, Nanaimo, BC; BC Women's Hospital, Vancouver, BC; Hôpital pour enfants de la Colombie-Britannique, Vancouver, BC; Hôpital général de Kelowna, Kelowna, BC; Hôpital régional de Penticton, Penticton, BC; Hôpital universitaire Northern BC, Prince George, BC; Hôpital régional d'Abbotsford, Abbotsford, BC; Hôpital de Burnaby, Burnaby, BC; Hôpital général de Chilliwack, Chilliwack, BC; Hôpital Delta, Delta, BC; Hôpital Eagle Ridge, Port Moody, BC; Hôpital Fraser Canyon, Hope, BC; Hôpital Memorial de Langley, Langley, BC; Hôpital Memorial de Mission, Mission, BC; Hôpital Peace Arch, White Rock, BC; Hôpital Royal Columbian, New Westminster, BC; Hôpital Ridge Meadows, Maple Ridge, BC; Hôpital Memorial de Surrey, Surrey, BC; Centre Queen's Park, New Westminster, BC; Centre de soins Fellburn, Burnaby, BC; Fleetwood Place, Surrey, BC; Centre Peter Lougheed, Calgary, Alberta (AB); Hôpital général Rockyview, Calgary, AB; South Health Campus, Calgary, AB; Centre médical Foothills, Calgary, AB; Hôpital pour enfants de l'Alberta, Calgary, AB; Hôpital de l'université de l'Alberta, Edmonton, AB; Hôpital pour enfants Stollery, Edmonton, AB; Hôpital Royal Universitaire, Saskatoon, Saskatchewan (SK); Hôpital général de Regina, Regina, SK; Hôpital Pasqua, Regina, SK; Hôpital de Moose Jaw, SK; Hôpital St. Paul's, Saskatoon, SK; Centre des sciences de la santé-Winnipeg, Winnipeg, Manitoba (MB); Hôpital pour enfants de l'Université du Manitoba, Winnipeg, MB; Children's Hospital of Western Ontario, London, Ontario (ON); Hôpital St. Michael's, Toronto, ON; Hôpital Victoria, London, ON; Hôpital universitaire, London, ON; Hôpital Toronto General, Toronto, ON; Hôpital Toronto Western, Toronto, ON; Princess Margaret, Toronto, ON; Hôpital Mount Sinai, Toronto, ON; Bridgepoint Active Healthcare, Toronto, ON; Hôpital Sunnybrook, Toronto, ON; Hôpital général de Kingston, Kingston, ON; L'Hôpital pour enfants malades, Toronto, ON; Hôpital pour enfants McMaster, Hamilton, ON; Centre de soins de santé St-Joseph, Hamilton, ON; Hôpital et Centre de cancérologie Juravinski, Hamilton, ON; Centre des sciences de la santé de Hamilton, Hamilton, ON; The Campus Civic de l'hôpital d'Ottawa, Ottawa, ON; Campus Général de l'hôpital d'Ottawa, Ottawa, ON; Institut de cardiologie de l'Université d'Ottawa, Ottawa, ON; Centre hospitalier pour enfants de l'est de l'Ontario (CHEO), Ottawa, ON; Hôpital général North York, Toronto, ON; Hôpital régional de Sudbury, Sudbury, ON; Hôpital Temiskaming, Temiskaming Shores, ON; Hôpital général juif – Sir Mortimer B. Davis (HGJ-SMBD), Montréal, Québec (QC); Hôpital de Lachine, Lachine, QC; Hôpital de Montréal pour enfants, Montréal, QC; Hôpital Maisonneuve-Rosemont, Montréal, QC; Hôtel-Dieu de Québec, QC; Centre hospitalier de l'Université de Montréal, Montréal, QC; Hôpital général de Montréal, Montréal, QC; Centre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine, Montréal, QC; Hôpital Royal Victoria, Montréal, QC; Institut-hôpital neurologique de Montréal, Montréal, QC; Hôpital régional de Rimouski, Rimouski, QC; Hôpital de Notre-Dame-du-lac, Témiscouata-sur-le-lac, QC; Centre hospitalier régional du Grand-Portage, Rivière-du-loup, QC; Hôpital Notre-Dame-de-Fatima, La Pocatière, QC; Hôpital d'Amqui, Amqui, QC; Hôpital de Matane, Matane, QC; Hôpital de Moncton, Moncton, New Brunswick (NB); Édifice Halifax Infirmary, Halifax, Nouvelle-Écosse (NS); Victoria General, Halifax, NS; Rehabilitation Centre, Halifax, NS; Édifice Veterans Memorial, Halifax, NS; Hôpital général de Dartmouth, Halifax, NS; Centre de Santé IWK, Halifax, NS; General Hospital & Miller Centre, St. John's, Terre-Neuve-et-Labrador (NL); Centre de soins de santé de la péninsule de Burin, Burin, NL; Hôpital général de Carbonear, Carbonear, NL; Dr. G.B. Cross Memorial Hospital, Clarenville, NL; Centre de santé et de réhabilitation de l'Hôpital pour enfants Janeway, St. John's, NL; Hôpital St. Clare's Mercy, St. John's, NL; Hôpital Sir Thomas Roddick, Stephenville, NL; Hôpital régional Western Memorial, Corner Brook, NL; Central Newfoundland Regional Health Centre, Grand Falls-Windsor, NL; Centre de santé régional James Paton, Gander, NL; Dr. Jeon Kittiwake Health Centre, New-Wes-Valley, NL; Fogo Island Health Centre, Fogo, NL; Notre Dame Bay Memorial Health Centre, Twillingate, NL; Connaigre Peninsula Health Centre, Harbour Breton, NL; A.M. Guy Health Centre, Buchans, NL; Green Bay Health Centre, Springdale, NL; Baie Verte Peninsula Health Centre, Baie Verte, NL; Hôpital Queen Elizabeth, Charlottetown, Île-du-Prince-Édouard (PE); Hôpital du comté de Prince County, Summerside, PE; Hôpital général Qikiqtani, Nunavut.

Nous remercions le personnel de l'Agence de santé publique du Canada au Centre de lutte contre les maladies transmissibles et les infections, Ottawa, ON (J. Bartoszko, J. Cayen, K. B. Choi, D. Lee, C. Lybeck, C. McClellan, E. McGill, R. Mitchell, A. Neitzel, A.-K. Nguyen, N. Papayiannakis, S. Rudat, A. Silva, Z. Suleman, O. Varsaneux) et le Laboratoire national de microbiologie, Winnipeg, MB (S. Ahmed, A. Bangit, A. Bharat, T. Du, R. Edirmanasinghe, K. Fakharuddin, G. Golding, G. Grewal, R. Hizon, X. Li, L. Mataseje, M. McCracken, M. Reimer, N. Lerminiaux, J. Tinsley).

Financement

Ce travail a été soutenu par l'Agence de la santé publique du Canada.

Appendice

Appendice A : Définitions de cas de surveillance et critères d'admissibilité, 2023

• Infection à Clostridioides difficile
• Infection à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM)
• Infection à Enterococcus résistant à la vancomycine (ERV)
• Infection à Enterobacterales productrices de carbapénémase (EPC)
• Candida auris

Appendice B

Des figures et des tableaux supplémentaires sont disponibles sur demande auprès de l'auteur : cnisp-pcsin@phac-aspc.gc.ca.

• Tableau S1.0 : Résumé des caractéristiques des patients pour les infections à Clostridioides difficile (ICD), les infections à Enterobacterales productrices de carbapénémase (EPC), les bactériémies à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et les bactériémies à Enterococcus résistant à la vancomycine (ERV), 2019–2023
• Tableau S1.1 : Résistance aux antimicrobiens des isolats d'infections à Clostridioides difficile nosocomiales et IAC selon la région, le type d'hôpital et la taille de l'hôpital, Canada, 2019–2023
• Tableau S1.2 : Résistance aux antimicrobiens des isolats d'infections à Clostridioides difficile nosocomiales et IAC, Canada, 2019–2023
• Tableau S1.3 : Nombre et proportion des ribotypes communs des cas d'infection à Clostridioides difficile nosocomiales et IAC, Canada, 2019–2023
• Tableau S2.1 : Cas et taux d'incidence des infections du sang à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associées aux soins de santé et à la communauté par région, type d'hôpital et taille de l'hôpital, 2019–2023
• Tableau S2.2 : Résistance aux antimicrobiens des isolats d'infections du sang à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associées aux soins de santé et à la communauté, Canada, 2019–2023
• Tableau S2.3 : Nombre et proportion de certains types de spa identifiés de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (avec les types d'épidémies correspondants)
• Tableau S3.1 : Taux d'incidence du nombre d'infections du sang à Enterococcus résistant à la vancomycine par région, type d'hôpital et taille de l'hôpital, 2019–2023
• Tableau S3.2 : Nombre d'infections du sang à Enterococcus résistant à la vancomycine associées aux soins de santé et taux d'incidence par région, type d'hôpital et taille de l'hôpital, 2019–2023
• Tableau S3.3 : Nombre et proportion de types d'isolats identifiés d'infections du sang à Enterococcus résistant à la vancomycine, 2019–2023
• Tableau S3.4 : Répartition des types de séquences sanguines d'Enterococcus faecium résistant à la vancomycine, 2019–2023
• Tableau S4.1 : Nombre d'infections à Enterobacterales productrices de carbapénémase et taux d'incidence par région, type d'hôpital et taille de l'hôpital, 2019–2023
• Tableau S4.2 : Nombre et proportion des principaux pathogènes identifiés producteurs de carbapénémases
• Tableau S4.3 : Analyses de sensibilité aux antimicrobiens pour la carbapénémases de Klebsiella pneumoniae, 2019–2023
• Tableau S4.4 : Analyse de sensibilité aux antimicrobiens pour la métallo β-lactamase de New Delhi, 2019–2023
• Tableau S4.5 : Analyses de sensibilité aux antimicrobiens pour OXA-48, oxacillinase-48, 2019–2023