Analyse approfondie: maladie respiratoire humaine associée au coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient

Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO-CoV)

En mars 2018, 17 nouveaux cas de syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO) ont été signalés. La majorité des nouveaux cas ont été signalés en Arabie saoudite (n = 16). Au total, 2 183 cas de coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO-CoV), dont au moins 760 décès, ont été signalés dans le monde depuis 2012. Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter la section d'analyse approfondie ci-dessous.

Contents

• Contexte
• Source d'exposition
• Caractéristiques du virus
• Manifestations cliniques
• Résumé de la situation: de janvier à mars 2018
• Analyse épidémiologique globale
• Répartition par âge et sexe
• Répartition temporelle
• Répartition géographique
• Vaccins contre le SRMO-CoV
• Limites
• Conclusion
• References

De Bulletin des agents pathogènes des voies respiratoires émergents numéro 15 (avril 2018).

Contexte

Le 13 juin 2012, un Saoudien âgé de 60 ans a été admis dans un hôpital privé de Jeddah, en Arabie saoudite, après s'être plaint de symptômes respiratoires (toux, expectoration, essoufflement et fièvre)^{Note de bas de page 1Note de bas de page 2}. Onze jours après son admission, le 24 juin 2012, il est décédé d'une insuffisance respiratoire et rénale progressive^{Note de bas de page 1}. L'enquête sur l'agent étiologique responsable de sa maladie a débuté au laboratoire rattaché à l'hôpital. Après deux mois d'essais sur des isolats cliniques provenant du patient pour détecter divers virus (virus grippal A, virus grippal B, para-influenza, paramyxovirus, hantavirus, entérovirus et adénovirus), l'isolat a été testé pour le coronavirus à l'aide d'un test RT-PCR pancoronavirus^{Note de bas de page 3}. Le test était positif, mais s'est avéré négatif pour les amorces spécifiques du SRAS, suggérant la découverte d'un nouveau coronavirus^{Note de bas de page 3}. Le 20 septembre 2012, après la confirmation par un autre laboratoire (le centre médical Erasmus), la découverte d'un nouveau coronavirus a été annoncée par ProMED^{Note de bas de page 3Note de bas de page 4}. Ce coronavirus, l'agent étiologique du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO), a finalement été nommé coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO-CoV), la 6e souche de coronavirus humain découverte^{Note de bas de page 5}.

Depuis lors, plus de 2 000 cas ont été signalés dans le monde. Des éclosions familiales et hospitalières se sont produites au Moyen-Orient et ailleurs, et les cas se sont propagés de la région vers d'autres pays [figure 1]^{Note de bas de page 6}. Des progrès importants ont également été réalisés dans le diagnostic en laboratoire, la caractérisation des virus, le développement de vaccins et la compréhension de l'évolution clinique de la maladie et du mécanisme de transmission [figure 1]. Cette analyse approfondie fournit un résumé de l'épidémiologie descriptive de l'infection humaine par le SRMO-CoV depuis son apparition en 2012, en mettant l'accent sur la répartition démographique, géographique et temporelle des cas signalés, ainsi qu'un examen des symptômes cliniques, des sources d'exposition et des caractéristiques du virus.

Source d'exposition

Les cas primaires de SRMO sont associés à la transmission zoonotique provenant de chameaux. Bien que les recherches suggèrent que l'origine du SRMO-CoV est les chauves-souris, plusieurs études sur son émergence et sa transmission soulignent le rôle des chameaux comme réservoir et source primaire d'infection zoonotique en raison de la forte prévalence des anticorps du SRMO-CoV chez les chameaux dans la péninsule arabique et en Afrique du Nord et de l'Est^{Note de bas de page 47Note de bas de page 62Note de bas de page 63Note de bas de page 64Note de bas de page 65}. La détection de SRMO-CoV par RT-PCR dans les sécrétions respiratoires, l'urine, les excréments et le lait de dromadaires, et la démonstration de similitudes dans la séquence génomique des virus isolés de sujets et de chameaux infectés^{Note de bas de page 47Note de bas de page 62Note de bas de page 63Note de bas de page 64Note de bas de page 65} soutiennent le rôle des chameaux dans la transmission zoonotique du SRMO-CoV. Ces résultats soulignent également l'importance de priorisation des mesures de prévention et de contrôle sur les chameaux.  Des tests de provocation effectués sur des chameaux suggèrent que leur infection par le SRMO-CoV entraîne une maladie respiratoire légère, avec peu ou pas de symptômes^{Note de bas de page 19}.  À ce jour, malgré le nombre de cas zoonotiques signalés, seules 14 flambées de SRMO associées à des chameaux ont été signalées à l'Organisation mondiale de la santé animale (OIE), ce qui signifie que les éclosions dans les troupeaux de camélidés risquent de ne pas être détectées et constituent un risque permanent de transmission aux humains^{Note de bas de page 66}. Selon les études séro-épidémiologiques réalisées sur d'autres animaux d'élevage, les alpagas sont les seuls autres animaux chez lesquels des anticorps spécifiques de SRMO-CoV ont été relevés; toutefois, aucun cas d'infection humaine avec exposition aux alpagas n'a été signalé à ce jour^{Note de bas de page 23}.

Bien que la voie de transmission des chameaux aux humains ne soit pas entièrement comprise, il est probable que les infections zoonotiques causées par le SRMO-CoV soient le résultat d'un contact direct ou indirect avec des chameaux ou des produits dérivés de chameaux (p. ex., le lait cru)^{Note de bas de page 31}. Des études sérologiques comparant la présence d'anticorps du SRMO-CoV chez des sujets avec et sans contact avec des dromadaires ont laissé une image contradictoire du rôle de l'exposition à des chameaux dans la transmission zoonotique du SRMO. Certaines études n'ont trouvé aucune preuve sérologique d'infections par le SRMO-CoV chez les humains ayant eu différents niveaux d'exposition aux dromadaires^{Note de bas de page 21Note de bas de page 67Note de bas de page 68}. Ces résultats suggèrent que la transmission zoonotique est rare^{Note de bas de page 21Note de bas de page 67Note de bas de page 68}. Cependant, d'autres études ont trouvé une séroprévalence beaucoup plus élevée des anticorps du SRMO-CoV chez les sujets exposés à des chameaux par rapport à la population générale, suggérant un plus grand risque d'infection par le SRMO-CoV chez ces sujets^{Note de bas de page 22Note de bas de page 69}. Les données actuellement disponibles suggèrent la nécessité de mener d'autres études afin de bien comprendre le rôle que l'interaction entre les humains et les animaux joue dans la transmission du SRMO-CoV.

La transmission interhumaine du SRMO-CoV a été largement associée à des flambées nosocomiales; cependant, la transmission dans un ménage a également été signalée^{Note de bas de page 10Note de bas de page 70}. Les flambées nosocomiales du SRMO ont joué un rôle important dans l'accroissement de l'ampleur des cas signalés. À ce jour, des flambées en milieu hospitalier à grande échelle ont été signalées en Arabie saoudite, aux Émirats arabes unis et en Corée du Sud^{Note de bas de page 42Note de bas de page 71Note de bas de page 72}.  Le manque de mesures de PCI (surpeuplement, isolement tardif des cas, manque de connaissance des définitions de cas de SRMO parmi les travailleurs de la santé, etc.) ainsi que la transmission dans les hôpitaux et entre les hôpitaux, les propagateurs extrêmement efficaces de virus et les personnes asymptomatiques sont des facteurs qui ont contribué dans le passé à ces flambées en milieu hospitalier^{Note de bas de page 73}. Une étude publiée en 2017 évaluant la mise en œuvre de mesures de PCI lors d'une éclosion importante dans un hôpital a montré que le respect rigoureux de ces mesures permettait la détection rapide des cas et la réduction importante du nombre de cas secondaires, ce qui pourrait expliquer la maîtrise rapide des flambées récentes en Arabie saoudite^{Note de bas de page 27Note de bas de page 28Note de bas de page 74}.

Caractéristiques du virus

Le SRMO-CoV est un virus à ARN monocaténaire appartenant à la famille des Coronaviridae^{Note de bas de page 2Note de bas de page 75}. Bien qu'il soit causé par le même genre de coronavirus que le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), le SRMO-CoV se distingue par le fait qu'il appartient à la lignée C, tandis que le SRAS appartient à la lignée B. L'entrée du SRMO-CoV dans les cellules hôtes est médiée par ses protéines de spicule (S), lesquelles sont liées au récepteur cellulaire hôte, soit la dipeptidyl peptidase 4 (DPP4)^{Note de bas de page 76}. DDP4 est une protéine cellulaire de surface qui est principalement exprimée dans les voies respiratoires humaines, mais qui est également largement exprimée dans les cellules épithéliales des reins, de l'intestin grêle, du foie, de la prostate et des leucocytes activés^{Note de bas de page 55}. Dans le cas du SRAS, de vastes mutations ont permis au virus de s'adapter au récepteur cellulaire humain, soit l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ECA2), ce qui a permis une augmentation de la transmission interhumaine^{Note de bas de page 77}. Bien que des isolats viraux séquencés provenant de chameaux et d'humains aient démontré que le SRMO-CoV a fait l'objet d'une recombinaison et de changements génétiques depuis son introduction dans la population humaine en 2012, aucune de ces mutations n'a permis une adaptation plus efficace au récepteur cellulaire humain DPP4^{Note de bas de page 78}. En fait, l'analyse des isolats viraux de la flambéeen Corée du Sud ayant une mutation dans le domaine de liaison au récepteur a démontré une affinité réduite à la DPP4 humaine^{Note de bas de page 79}. Étant donné l'ampleur de la flambéeen Corée du Sud, ces résultats compliquent davantage le rôle que jouent la protéine S et la DPP4 dans l'adaptation humaine de ce virus. Dans l'ensemble, les coronavirus possèdent des capacités de mutation et de recombinaison efficaces, et une propension à traverser les espèces hôtes et à s'adapter à un nouvel environnement. Ces capacités font craindre que le SRMO-CoV acquière de la virulence et une capacité accrue de transmission interhumaine. Cependant, une transmission interhumaine soutenue n'a pas eu lieu dans la population générale. Les foyers potentiels de la transmission d'animal à humain et interhumaine doivent être surveillés de façon continue.

Manifestations cliniques

L'infection humaine par le SRMO-CoV présente un large éventail de tableaux cliniques, allant de l'infection asymptomatique à des cas cliniques aigus^{Note de bas de page 2}.  Parmi les symptômes cliniques communs, on compte la fièvre, la toux et l'essoufflement, lesquels peuvent évoluer rapidement en pneumonie aiguë, en syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA), en choc septique, en défaillance multiviscérale (SDMV) et entraîner le décès^{Note de bas de page 2Note de bas de page 56}. Dans certains cas, des symptômes gastro-intestinaux tels que des douleurs abdominales, des vomissements et de la diarrhée se sont manifestés^{Note de bas de page 2}. Comparativement à des maladies chez l'humain causées par d'autres coronavirus tels que le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) (taux global de létalité de 14 %-15 %), le SRMO a un taux de létalité élevé de 35 % parmi tous les cas rapportés dans le monde et de 40 % en Arabie saoudite^{Note de bas de page 6Note de bas de page 32Note de bas de page 57}. Des études évaluant les facteurs de risque ont révélé que les problèmes de santé préexistants, l'âge avancé, le sexe (masculin) et la co-infection par d'autres agents bactériens ou viraux constituent des facteurs de risque importants de gravité de la maladie et de mortalité^{Note de bas de page 56Note de bas de page 58}.

Cas pédiatriques

Selon les données disponibles, les cas pédiatriques de SRMO sont rares^{Note de bas de page 34Note de bas de page 60Note de bas de page 61}. Jusqu'à présent, environ 2 % de tous les cas sont survenus chez des enfants (18 ans ou moins) et le taux de létalité est de 2,5 %.  En 2016, Al-Tawfiq et autres ont publié une étude visant à résumer les caractéristiques épidémiologiques et cliniques des cas pédiatriques signalés de juin 2012 au 19 avril 2016 (n = 31)^{Note de bas de page 60}. Parmi les cas pour lesquels des données cliniques étaient disponibles (n = 29), 45 % étaient asymptomatiques et 7 % présentaient des symptômes respiratoires légers^{Note de bas de page 60}. Parmi les cas pour lesquels des données sur la source d'exposition étaient disponibles (n = 15), 68 % ont contracté l'infection par contact dans le ménage^{Note de bas de page 60}. Bien que le nombre de cas pédiatriques soit faible, il est important de bien étudier  les manifestations cliniques dans les documents scientifiques afin de mieux comprendre s'il est différent pour cette population de celui de la population générale.

Résumé de la situation: de janvier à mars 2018

Entre le 1er janvier et le 31 mars 2018, 54 cas de SRMO, dont 5 décès (taux de létalité = 36 %), de sujets dont les résultats étaient connus ont été signalés à l'Organisation mondiale de la santé (OMS) et par le ministère de la Santé du Royaume d'Arabie saoudite (KSA MOH)^{Note de bas de page 24}. Le nombre de cas et les taux de létalité étaient comparables à ceux signalés au cours de la même période en 2016 et 2017, mais nettement inférieurs à ceux de 2015 et de 2014^{Note de bas de page 25}. La répartition par âge et par sexe des cas est restée relativement stable par rapport aux années précédentes : la plupart des cas étaient de sexe masculin (75 %) et l'âge médian était de 59 ans (de 5 ans à 89 ans). Sur le plan géographique, les cas ont été moins dispersés que les années précédentes, seuls trois pays (Malaisie, Arabie saoudite et Oman) ayant signalé des cas à ce jour. Le cas signalé d'Oman était contracté localement, tandis que le cas signalé en Malaisie a été importé d'Arabie saoudite - le pays avec la majorité des cas signalés^{Note de bas de page 26}. Parmi les cas pour lesquels des données sur l'exposition étaient disponibles (n = 5), 29 % ont fait état d'une exposition à des chameaux tandis que 21 % ont été exposés à un cas positif de SRMO, donnant des proportions similaires de cas secondaires^{Note de bas de page a} et de cas primaires^{Note de bas de page b} signalés à l'OMS cette année jusqu'à présent. Entre le 1^er janvier et le 31 mars 2018, une flambée nosocomiale a été signalée dans un hôpital privé de la région d'Hafr Albatin en Arabie saoudite, alors qu'un groupe d'infections nosocomiales a été détecté dans un établissement de santé de la région de Riyad en Arabie saoudite^{Note de bas de page 27Note de bas de page 28}.

Analyse épidémiologique globale

Depuis l'émergence du SRMO-CoV en 2012, 2 183 cas d'infection humaine, dont au moins 760 décès (taux de létalité = 35 %), ont été signalés dans 27 pays^{Note de bas de page 6Note de bas de page 32}. Les analyses épidémiologiques du SRMO-CoV à ce jour reflètent des infections zoonotiques sporadiques, avec une transmission interhumaine amplifiée dans les milieux de soins de santé.  Dans l'ensemble, les deux tiers des cas signalés (66 %) sont survenus chez des hommes dont l'âge médian était de 54 ans (de 9 mois à 109 ans). Bien que des cas de SRMO continuent d'être signalés chaque année, il y a eu une diminution du nombre de cas signalés et du taux de létalité depuis 2014 [tableau 1 ]^{Note de bas de page 29}. Compte tenu de l'association entre la transmission interhumaine amplifiée et les éclosions dans les milieux de soins de santé, le respect strict des mesures de prévention et de contrôle des infections (PCI) est probablement le principal facteur de la réduction observée de l'incidence des cas selon l'OMS^{Note de bas de page 30}.

Tableau 1 . Caractéristiques épidémiologiques des cas de SRMO signalés entre janvier et décembre (de 2013 à 2017), et janvier à mars 2018.

Caractéristiques	2013	2014	2015	2016	2017	2018
Nombre de cas signalés (taux de létalité %)	188 (53)	758 (38)	672 (33)	251 (29)	250 (29)	54 (36)
Âge médian (plage) en années	51 (2-94)	48 (4-99)	54 (9 mois-109 ans)	54 (18-94)	53 (10-88)	59 (5-89)
% Hommes	65	65	65	73	72	75
Nombre de pays ayant signalé des cas	10	17	12	7	5	3
% de travailleurs du domaine de la santé	20	26	10	13	17	4
Remarque : les données sur les caractéristiques épidémiologiques des cas de SRMO de 2013-2016 proviennent du bureau régional de l'OMS pour la Méditerranée orientale (EMRO), Mise à jour de la situation du SRMO de janvier à février 2017, et comparées avec les données extraites du bulletin sur les flambées épidémiques de l'OMS le 6 juillet, sur les cas de SRMO signalés de janvier à juin 2017. Les caractéristiques épidémiologiques des cas signalés de juin 2017 à mars 2018 reposaient sur des données extraites du bulletin sur les flambées épidémiques de l'OMS le 15 mars et sur des cas signalés par le ministère de la Santé du Royaume d'Arabie saoudite jusqu'à la fin de mars 2018. Les données présentées dans ce tableau peuvent changer à la suite d'enquêtes en cours et d'une nouvelle analyseNote de bas de page 24Note de bas de page 29Note de bas de page 32.

Répartition par âge et sexe

Dans l'ensemble, la répartition des cas selon l'âge et le sexe est biaisée en faveur des hommes plus âgés [figure 2]. Cependant, des recherches plus approfondies sur le type d'exposition révèlent des profils distinctifs selon l'âge et le sexe entre les cas primaires et les cas secondaires [figure 3]^{Note de bas de page 31}. Les données d'exposition et démographiques étaient disponibles pour 109 cas primaires et 62 cas secondaires (total = 171) signalés par le bulletin sur les flambées épidémiques de l'OMS et le ministère de la Santé de l'Arabie saoudite entre le 1er janvier 2017 et le 31 mars 2018^{Note de bas de page 24Note de bas de page 32}. Les cas primaires étaient biaisés en faveur des hommes plus âgés : les hommes (88 %) âgés de 50 ans et plus (67 %) constituaient une proportion beaucoup plus élevée de cas primaires. En revanche, les cas secondaires avaient une répartition plus équilibrée selon l'âge et le sexe : il n'y avait pas de différence significative entre la proportion d'hommes et de femmes ou parmi les groupes d'âge^{Note de bas de page 25}. De plus, l'âge moyen des cas secondaires était beaucoup plus bas que celui des cas primaires (46 ans contre 56 ans). Le profil âge-sexe observé dans les cas primaires - personnes infectées par contact direct avec des chameaux - est probablement dû à des comportements socioculturels, par exemple,  l'élevage de chameaux étant une activité populaire parmi les hommes d'âge moyen et à la retraite^{Note de bas de page 31}.

Répartition temporelle

La répartition temporelle globale de l'épidémie de SRMO peut être caractérisée par de multiples pics intermittents correspondant à des flambées hospitalières à grande échelle ou simultanées. Entre 2014 et juin 2016, ces pics se sont produits en moyenne toutes les 12 à 26 semaines [figure 4]. Cependant, entre 2016 et 2017, il y a eu une période de 52 semaines sans pic d'activité et aucun pic n'a été signalé en 2018 jusqu'à présent. La récente augmentation de la durée entre les pics d'activité, se traduisant en une activité faible mais continue, suggère qu'il y a eu des améliorations dans la mise en œuvre des mesures de PCI et une diminution des cas hospitalisés depuis 2015, comme indiqué par l'OMS^{Note de bas de page 28Note de bas de page 30}.

Une première analyse de la répartition temporelle des cas de SRMO entre 2012 et 2014 a suggéré une tendance saisonnière, les cas augmentant de mars à avril de chaque année. À l'époque, cette tendance saisonnière avait été liée aux modes de vêlage et de sevrage des chameaux; mais, cette tendance n'a pas été observée depuis 2014^{Note de bas de page 33}.  L'analyse de la répartition temporelle des cas annuels de SRMO signalés depuis 2014 démontre que la majorité des cas (environ 61 % à 84 %) surviennent au cours des 6 premiers mois de l'année, avec des pics correspondant aux flambées hospitalières signalées impliquant plus de 20 cas [figure 5]. Une analyse plus approfondie de la répartition temporelle des cas primaires et secondaires peut aider à déterminer si le SRMO est vraiment saisonnier.

Répartition géographique

À ce jour, 27 pays situés au Moyen-Orient, en Afrique du Nord, en Europe, en Amérique du Nord et en Asie ont signalé des cas de SRMO importés et acquis localement [figure 6]^{Note de bas de page 6}. La majorité des cas (n = 1845, 90 %) ont été signalés dans des pays de la péninsule arabique, 92 % de ces cas ont été signalés en Arabie saoudite. Les recherches sur les interactions entre les humains et les animaux et la circulation du SRMO-CoV chez les dromadaires suggèrent qu'outre la population de dromadaires dans la péninsule arabique, les pratiques économiques, culturelles et récréatives propres à la région, comme la tendance vers l'élevage intensif de chameaux autour des zones urbaines, sont la cause de la concentration observée des cas^{Note de bas de page 31Note de bas de page 33Note de bas de page 47Note de bas de page 48Note de bas de page 49Note de bas de page 50}. 

Actuellement, la majorité de la population mondiale de dromadaires (> 60 %) est située dans la Grande corne de l'Afrique, une région qui exporte régulièrement des chameaux vers les pays de la péninsule arabique^{Note de bas de page 48}. Bien que des études sérologiques menées sur des dromadaires de plusieurs pays d'Afrique (Égypte, Éthiopie, Nigéria, Somalie, Soudan) aient démontré que les chameaux dans ces régions ont une séroprévalence élevée du SRMO-CoV, aucune infection zoonotique locale par le SRMO-CoV n'a été signalée dans aucun pays d'Afrique. Les 6 cas signalés en Afrique ont tous été importés ou liés à un cas importé du Moyen-Orient^{Note de bas de page 47}. De plus, une étude sur la circulation des espèces de coronavirus en Arabie saoudite a montré que les chameaux locaux avaient des taux de portage beaucoup plus élevés que les chameaux importés^{Note de bas de page 49}. Des tests de lignage ont montré que le SRMO-CoV trouvé chez les chameaux africains est génétiquement différent du SRMO-CoV trouvé chez les chameaux et les humains au Moyen-Orient^{Note de bas de page 48Note de bas de page 83}. Ces données suggèrent que les cas de SRMO zoonotiques observés en Arabie saoudite et dans d'autres pays de la péninsule arabique sont liés à des facteurs spécifiques de ces régions.

Étant donné que le SRMO-CoV est endémique en Arabie saoudite depuis plus de deux décennies et que le virus est répandu dans la péninsule arabique, on peut s'attendre à ce que d'autres cas soient signalés et exportés à partir de ces régions^{Note de bas de page 51}.  Des pays comme l'Inde et le Bangladesh, dont un grand nombre de citoyens se rendent en Arabie saoudite pour des pèlerinages religieux, ont été identifiés comme des régions potentiellement à haut risque pour l'importation du SRMO-CoV^{Note de bas de page 52Note de bas de page 53}. À ce jour, le plus grand nombre de cas signalés à l'extérieur du Moyen-Orient s'est produit en Corée du Sud en 2015 : la majorité des 186 cas signalés étaient associés à une flambée importante dans plusieurs hôpitaux^{Note de bas de page 54}. Dans l'ensemble, les cas étaient les plus dispersés géographiquement au cours de la saison 2014 (signalés par 17 pays) [figure 7].

Vaccins contre le SRMO-CoV

Il n'existe aucun vaccin ou traitement antiviral efficace pour le SRMO-CoV. Toutefois, des recherches sont en cours, et de nombreux vaccins expérimentaux ciblant les humains sont en développement. Ces vaccins expérimentaux utilisent un large éventail de plateformes, y compris les vaccins à virus entier (vivants atténués et inactivés), les vaccins à virus vectorisés, les vaccins à ADN, et les vaccins à base de protéines. De nombreux virus ciblent la protéine S (enveloppe) ou le domaine de liaison au récepteur DPP4 (RBD) de la protéine S^{Note de bas de page 80}. Jusqu'à présent, un seul vaccin expérimental est passé à l'élaboration clinique : un vaccin à ADN appelé GLS-5300 ayant démontré qu'il peut générer des anticorps protecteurs contre le SRMO-CoV chez les souris, les chameaux et les singes est passé à la phase 1 des essais cliniques humains en février 2016^{Note de bas de page 81}. Ce vaccin expérimental a également été testé et a réduit l'excrétion du virus chez les dromadaires^{Note de bas de page 81}. Les vaccins à ADN destinés à provoquer des réactions anti-S confèrent également une protection aux primates non humains^{Note de bas de page 80}. Comme la protéine de spicule (spécifiquement S1) est très divergente entre les différents CoV, les anticorps neutralisants ne fournissent qu'une protection homotypique. En revanche, la séquence d'acides aminés de la protéine de spicule, spécifiquement du domaine S2, est conservée avec une variabilité minimale parmi les souches de SRMO-CoV. Par ailleurs, les souches circulantes de SRMO-CoV manquent également de variation significative de la réactivité sérologique. Comme la protéine du domaine S2 est plus conservée parmi les coronavirus, la réponse immunitaire adaptative dirigée contre la protéine S2 peut potentiellement constituer la base du développement d'un vaccin capable d'induire une protection hétérotypique contre les souches circulantes du SRMO-CoV. En outre, un essai d'innocuité de phase 1 pour un vaccin constitué du virus modifié de la vaccine d'Ankara ayant réduit l'élimination du virus et ayant généré des anticorps protecteurs et une immunité dans les muqueuses est actuellement prévu^{Note de bas de page 82}.

Limites

Cette analyse approfondie du SRMO-CoV comporte plusieurs limites. La majorité des données de ce rapport représentent des cas confirmés en laboratoire de SRMO-CoV signalés dans le Royaume d'Arabie saoudite. Des données très limitées sont disponibles sur les manifestations cliniques, le diagnostic, les traitements et les comorbidités des cas. Il existe une possibilité de biais de sélection inconnue, car les cas primaires ne sont détectés qu'après la manifestation de la maladie. Les cas primaires asymptomatiques ou les cas avec un accès limité aux soins de santé restent non détectés. L'interprétation des facteurs de risque associés à l'acquisition du SRMO-CoV reste donc difficile, en particulier en l'absence de données probantes provenant d'études épidémiologiques de cas-témoins approfondies.

Conclusion

En 2015, l'OMS a créé une liste des maladies prioritaires qui présentent des risques majeurs pour la santé publique et nécessitent des recherches et des développements plus poussés. La liste originale et sa version mise à jour fournies en février 2018 ont considéré le SRMO-CoV comme une urgence potentielle de santé publique^{Note de bas de page 59}. Depuis l'émergence du SRMO en 2012, des cas d'infection humaine, principalement dans les pays de la péninsule arabique, continuent d'être signalés. Les modes de transmission de la maladie n'ont pas changé, les introductions répétées dans la population humaine se produisant par transmission zoonotique, suivie d'une transmission interhumaine amplifiée dans les milieux des soins de santé. Une meilleure compréhension de la transmission du SRMO-CoV dans les milieux de soins de santé est nécessaire, en particulier des expositions qui entraînent une transmission interhumaine, du rôle potentiel des travailleurs de la santé infectés asymptomatiques et du rôle possible de la contamination de l'environnement, afin d'atténuer le risque de flambées nosocomiales. Bien que le nombre de cas signalés chaque année semble être en baisse, il est clair qu'une recherche et une surveillance continues sont nécessaires pour combler les lacunes dans les connaissances sur l'origine et les caractéristiques du virus, la transmission de cette maladie dans la communauté, le mode exact de la transmission zoonotique, et les sources environnementales potentielles de la maladie.

References

Notes de bas de page