Section 1 : Programme intégré canadien de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (PICRA) 2008 – Résistance aux antimicrobiens

Section 1 - Résistance aux antimicrobiens

Humains

Salmonella

En 2008, les laboratoires provinciaux de santé publique ont fait parvenir au total 3609 isolats de Salmonella (170 sérotypes) au Laboratoire national de microbiologie de l'Agence de la santé publique du Canada, à Winnipeg, au Manitoba, pour le lysotypage, le sérotypage et les tests de sensibilité aux antimicrobiens (voir l'annexe A - Méthodes, Résistance aux antimicrobiens). Aucun isolat de Salmonella n'a été soumis par les territoires (Yukon, Territoires du Nord-Ouest et Nunavut) au PICRA en 2008, directement ou par l'intermédiaire des laboratoires de santé publique. On a constaté que 8 isolats avaient été soumis en double; par conséquent, l'analyse finale a été effectuée sur 3601 isolats.

Les résultats portent sur les 3 sérotypes de Salmonella les plus communs au Canada (soit Enteritidis, Heidelberg et Typhimurium). Salmonella Newport a également fait l'objet d'une attention particulière en raison des éclosions antérieures de souches multirésistantes aux antimicrobiens. Bien que le secteur agroalimentaire ne soit pas une source de Salmonella Typhi, S. Paratyphi A ou S. Paratyphi B^{Note de bas de page 11}, les données relatives à ces sérotypes sont également présentées, car chacun d'entre eux provoque des maladies graves chez les humains^{Note de bas de page 12}.

Les résultats sur la résistance aux antimicrobiens sont présentés par province en raison des différences qui existent dans les protocoles de soumission des échantillons, selon qu'il s'agisse d'une province fortement peuplée ou non (voir l'annexe A - Méthodes). Les résultats sont aussi présentés par province en raison des différences provinciales dans l'utilisation des antimicrobiens, de la prévalence des souches et des différents profils de résistance à Salmonella.

Une attention particulière a été accordée aux isolats de Salmonella qui provenaient d'échantillons de sang et d'urine, car ces derniers laissent supposer que les patients présentaient une infection invasive qui a probablement été traitée avec des antimicrobiens. Il se peut que ces échantillons aient été soumis en raison de l'échec des traitements; cette hypothèse n'a pas pu être vérifiée, car il était impossible d'avoir accès aux dossiers des patients. Par conséquent, les isolats détectés dans ces échantillons étaient probablement plus résistants que les isolats provenant des autres types d'échantillons.

Si l'on compare les pourcentages d'isolats de Salmonella dans les autres groupes d'âge, le pourcentage d'isolats de Salmonella le plus élevé provenait de patients âgés de 30 à 49 ans (25 %, 654/2594; tableau C.1, annexe C). Par ailleurs, c'est de l'Ontario que provenait la plus grande proportion d'isolats (37 %, 1 337/3601).

Salmonella Enteritidis (n = 1258)

Les taux d'incidence provinciaux de Salmonella Enteritidis ont varié chez les humains de 4,37 à 10,06 (médiane = 6,60) cas par 100 000 habitants-années (voir la formule à l'annexe A). Les lysotypes (LT) les plus communs étaient les suivants : LT 8 (35 %, 444/1258) et LT 13 (17 %, 208/1258). Trois pour cent (33/1258) des isolats provenaient d'échantillons sanguins, et 2 % (21/1258) d'échantillons d'urine (tableau C.2, à l'annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 1 et au tableau B.1 (annexe B). Moins de 1 % (3/1 258) des isolats de S. Enteritidis étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans moins de 1 % (2/1258) des isolats. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été détectée dans 14 % (171/1258) des isolats. De la résistance à l'acide nalidixique a été détectée dans 13 % (158/1 258) des isolats et aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 et aux tableaux C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 ou plusieurs antimicrobiens a été détectée dans 14 % (182/1258) des isolats de S. Enteritidis. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été détectée dans 1 % (7/1258) des isolats. Le profil de résistance le plus commun était celui de la résistance à NAL (11 %, 136/1258), et 59 % (80/136) des isolats associés étaient des LT 1. Un pour cent (14/1258) des isolats (LT 5b et LT 4) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique. Parmi les isolats analysés, les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient A2C-AMP-CRO-STR-TET et AKSSuT-GEN-NAL (1 LT 6a chacun).

Vingt-sept pour cent (9/33) des isolats sanguins et 24 % (5/21) des isolats provenant de cultures d'urine étaient résistants à 1 antimicrobien ou plus. De la résistance à NAL constituait le profil de résistance le plus commun, et il a été observé dans 12 % (4/33) des isolats sanguins et 19 % (4/21) des isolats provenant de cultures d'urine.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 2. Le pourcentage d'isolats de S. Enteritidis présentant de la résistance à l'acide nalidixique a été significativement moins élevé en 2008 (13 %, 158/1 258) qu'en 2003 (19 %, 66/352). Le pourcentage des isolats démontrant de la résistance à l'acide nalidixique en 2008 était également significativement plus faible qu'en 2007 (18 %, 167/910). Le pourcentage d'isolats présentant de la résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole était significativement plus bas en 2008 (moins de 1 %, 5/1258) qu'en 2003 (1 %, 5/352). Le pourcentage des isolats résistants à la tétracycline était significativement plus faible en 2008 (2 %, 20/1258) qu'en 2007 (6 %, 58/910). Entre 2008 et 2003 ainsi qu'entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, le pourcentage d'isolats humains de Salmonella Enteritidis résistants à l'acide nalidixique (13 %, 158/1258) était significativement plus bas qu'en 2003 (19 %, 66/352). Le pourcentage d'isolats de S. Enteritidis résistants à l'acide nalidixique était également significativement plus faible en 2008 qu'en 2007 (18 %, 167/910). Un pour cent (14/1 258) des isolats LT 5b et LT 4 présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique.

Tableau 1. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella Enteritidis; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

	Antimicrobien	Nombre (%) d'isolats résistants										Canadaa %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 211	n = 147	n = 58	n = 85	n = 412	n = 221	n = 39	n = 41	n = 10	n = 34
I	Amoxicilline-acide clavulanique	2 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Ceftiofur	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Ceftriaxone	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	11 (5)	4 (3)	1 (2)	0 (0)	11 (3)	5 (2)	0 (0)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	3
	Céfoxitine	2 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Gentamicine	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	2 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Kanamycine	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Acide nalidixique	23 (11)	22 (15)	8 (14)	12 (14)	56 (14)	25 (11)	6 (15)	4 (10)	0 (0)	2 (6)	13
	Streptomycine	3 (1)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	5 (1)	1 (0)	0 (0)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	2 (1)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
III	Chloramphénicol	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Sulfisoxazole	2 (1)	2 (1)	0 (0)	0 (0)	4 (1)	2 (1)	1 (3)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Tétracycline	3 (1)	5 (3)	0 (0)	0 (0)	6 (1)	3 (1)	1 (3)	1 (2)	0 (0)	1 (3)	2
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. a Pourcentages estimés pour le Canada et ajustés pour tenir compte des différentes proportions d'isolats fournis par rapport au total disponible dans chacune des provinces alors que les pourcentages dans le texte représentent les valeurs non ajustées (voir l'annexe A).

Salmonella Heidelberg (n = 290)

Les taux d'incidence provinciaux de Salmonella Heidelberg chez les humains ont varié de 0,70 à 3,62 (médiane = 1,67) cas par 100 000 habitants-années. Les lysotypes les plus communs étaient le LT 19 (54 %, 157/290), le LT 29 (8 %, 24/290) et le LT 5 (8 %, 22/290). Douze pour cent (34/290) des isolats provenaient d'échantillons de sang et 2 % (6/290) d'échantillons d'urine (tableau C.2, à l'annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 2 et au tableau B.2 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été observée dans 13 % (39/290) des isolats de S. Heidelberg. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 14 % (41/290) des isolats. Aucun isolat n'a présenté de résistance à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique. De plus, aucun isolat ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 ainsi qu'aux tableaux C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 ou plusieurs antimicrobiens a été observée dans 38 % (111/290) des isolats de S. Heidelberg, alors que de la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été détectée dans 14 % (41/290) des isolats. Le profil de résistance le plus commun était AMP (14 %, 42/290). Ce profil de résistance a surtout été observé parmi les isolats de LT 19 (93 %, 39/42) provenant majoritairement de l'Ontario (46 %, 18/39) et du Québec (41 %, 16/39). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-SXT (1 LT 21).

Quarante-quatre pour cent (15/34) des isolats sanguins et 2 des 6 isolats provenant de cultures d'urine présentaient de la résistance à 1 antimicrobien ou plus. Le profil de résistance le plus commun, AMP, a été observé dans 18 % (6/34) des isolats sanguins (LT 19), mais il n'a pas été observé parmi aucun des isolats provenant de cultures d'urine.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 2. Le pourcentage d'isolats de S. Heidelberg résistants au ceftiofur était significativement plus faible en 2008 (14 %) qu'en 2004 (33 %, 181/556)^{Note de bas de page 13}. De façon analogue, le pourcentage d'isolats présentant de la résistance à l'ampicilline était significativement moins élevé en 2008 (32 %, 92/290) qu'en 2006 (39 %, 168/430) et qu'en 2004 (45 %, 250/556). Les pourcentages d'isolats présentant de la résistance à la streptomycine et à la tétracycline étaient significativement moins élevés en 2008 (7 % [20/290] et 6 % [18/290], respectivement) qu'en 2003 (12 % [72/608] et 15 % [93/608], respectivement). Entre 2008 et 2003, ainsi qu'entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, le pourcentage d'isolats humains de Salmonella Heidelberg présentant de la résistance au ceftiofur (14 %, 41/290) était significativement moins élevé qu'en 2004 (33 %, 181/556).

Tableau 2. Résistance aux antimicrobiens parmi les isolats humains de Salmonella Heidelberg; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canadaa %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 16	n = 32	n = 7	n = 19	n = 102	n = 65	n = 17	n = 22	n = 5	n = 5
I	Amoxicilline-acide clavulanique	2 (13)	7 (22)	0 (0)	2 (11)	14 (14)	8 (12)	4 (24)	1 (5)	0 (0)	1 (20)	14
	Ceftiofur	3 (19)	8 (25)	0 (0)	2 (11)	14 (14)	8 (12)	4 (24)	1 (5)	0 (0)	1 (20)	15
	Ceftriaxone	3 (19)	8 (25)	0 (0)	2 (11)	14 (14)	8 (12)	4 (24)	1 (5)	0 (0)	1 (20)	15
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	5 (31)	11 (34)	0 (0)	3 (16)	36 (35)	28 (43)	6 (35)	2 (9)	0 (0)	1 (20)	34
	Céfoxitine	2 (13)	7 (22)	0 (0)	2 (11)	14 (14)	8 (12)	3 (18)	1 (5)	0 (0)	1 (20)	14
	Gentamicine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (5)	1 (1)	3 (5)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	2
	Kanamycine	1 (6)	2 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1
	Acide nalidixique	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Streptomycine	0 (0)	5 (16)	0 (0)	1 (5)	7 (7)	6 (9)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	8
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0 (0)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (3)	0 (0)	1 (5)	0 (0)	0 (0)	1
III	Chloramphénicol	0 (0)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Sulfisoxazole	0 (0)	1 (3)	0 (0)	1 (5)	2 (2)	5 (8)	1 (6)	1 (5)	0 (0)	0 (0)	4
	Tétracycline	2 (13)	6 (19)	0 (0)	1 (5)	4 (4)	2 (3)	1 (6)	1 (5)	1 (20)	0 (0)	6
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. a Pourcentages estimés pour le Canada et ajustés pour tenir compte des différentes proportions d'isolats fournis par rapport au total disponible dans chacune des provinces alors que les pourcentages dans le texte représentent les valeurs non ajustées (voir l'annexe A).

Salmonella Newport (n = 177)

Les taux d'incidence provinciaux de Salmonella Newport chez les humains ont varié de 0 à 1,69 (médiane = 0,66) cas par 100 000 habitants-années. Aucun cas de résistance n'a été signalé à l'Île-du-Prince-Édouard. Les lysotypes les plus communs détectés dans les échantillons étaient les LT 9 (22 %, 39/177) et les lysotypes désignés comme étant atypiques (16 %, 29/177). Six pour cent des isolats (11/177) provenaient de cultures d'urine et quatre pour cent (7/177) provenaient d'échantillons sanguins (tableau C.2 à l'annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 3 et au tableau B.3 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été détectée dans 1 % (2/177) des isolats de S. Newport et de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 2 % (3/177) des isolats. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à l'acide nalidixique ont été détectées dans 1 % (2/177) des isolats. Aucun des isolat n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 et aux tableaux C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été détectée dans 5 % (9/177) des isolats de S. Newport. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été détectée dans 2 % (4/177) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (1 %, 2/177), lequel a été détecté dans 1 isolat LT 9 et 1 isolat LT 14c, ainsi que ACSSuT-A2C-CRO (1 %, 2/177), qui a été détecté dans 1 isolat LT 17a et 1 isolat LT 17c. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens parmi les isolats (1 LT 17a et 1 LT 17c) était ACSSuT-A2C-CRO, lequel figurait également parmi les profils de résistance les plus communs. Aucun des isolats sanguins ou provenant de cultures d'urine n'était résistant à 1 antimicrobien ou plus.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 2. Les pourcentages d'isolats de S. Newport présentant de la résistance au ceftiofur ou à l'ampicilline étaient significativement plus bas en 2008 (2 % et 3 % [5/177], respectivement) qu'en 2003 (10 % [17/175] et 13 % [22/175], respectivement). Les pourcentages d'isolats qui démontraient de la résistance à la streptomycine et à la tétracycline étaient également significativement inférieurs en 2008 (2 % [4/177] et 4 % [7/177], respectivement) qu'en 2003 (10 % [17/175] et 13 % [22/175], respectivement). Entre 2008 et 2003 ainsi qu'entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, les pourcentages d'isolats humains de Salmonella Newport résistants au ceftiofur et à l'ampicilline (2 % [3/177] et 3 % [5/177], respectivement) étaient significativement plus bas qu'en 2003 (10 % [17/175] et 13 % [22/175], respectivement). Les pourcentages d'isolats résistants à la streptomycine et à la tétracycline étaient également significativement moins élevés en 2008 (2 % [4/177] et 4 % [7/177], respectivement) qu'en 2003 (10 % [17/175] et 13 % [22/175], respectivement).

Tableau 3. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella Newport; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canada %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 18	n = 28	n = 8	n = 6	n = 74	n = 37	n = 3	n = 2	n = 0	n = 1
I	Amoxicilline-acide clavulanique	0 (0)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1
	Ceftiofur	0 (0)	2 (7)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ceftriaxone	0 (0)	2 (7)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	0 (0)	3 (11)	0 (0)	0 (0)	2 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3
	Céfoxitine	0 (0)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1
	Gentamicine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Kanamycine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Acide nalidixique	0 (0)	0 (0)	1 (13)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Streptomycine	0 (0)	2 (7)	0 (0)	0 (0)	2 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1
III	Chloramphénicol	0 (0)	2 (7)	0 (0)	0 (0)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Sulfisoxazole	0 (0)	2 (7)	0 (0)	0 (0)	3 (4)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3
	Tétracycline	0 (0)	3 (11)	0 (0)	0 (0)	4 (5)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	4
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. Aucun isolat de S. Newport n'a été reçu de l'Île-du-Prince-Édouard.

Salmonella Paratyphi A et Paratyphi B
(n = 65)

Les taux d'incidence provinciaux combinés de Salmonella Paratyphi A et de S. Paratyphi B^{Note de bas de page 14} ont varié de 0 à 0,91 (médiane = 0,18) cas par 100 000 habitants-années. Aucun cas n'a été rapporté au Nouveau-Brunswick, à l'Île-du-Prince-Édouard ou à Terre-Neuve-et-Labrador. Le lysotypage ne s'applique pas aux isolats de S. Paratyphi. Parmi les 12 isolats de S. Paratyphi B, les lysotypes observés comprenaient des lysotypes atypiques (9/12), Battersea (2/12) et Worksop (1/12). Soixante-quatre pour cent (34/53) des isolats de S. Paratyphi A provenaient de cultures d'échantillons sanguins, et 2 % (1/53) provenaient de cultures d'urine. Un des 12 isolats S. Paratyphi B provenait d'échantillons sanguins, et aucun autre de ces isolats ne provenait de cultures d'urine (tableau C.2, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 4 et au tableau B.4 (annexe B). De la résistance à l'acide nalidixique a été détectée dans 4 % (2/53) des isolats de S. Paratyphi A. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 2 % des isolats de S. Paratyphi. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à l'acide nalidixique ont été détectées dans 89 % (47/153) des isolats de S. Paratyphi A. Aucun des isolats de S. Paratyphi A ou S. Paratyphi B n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine. Aucun des isolats de S. Paratyphi B n'était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à la céfoxitine, à la gentamicine, à la kanamycine, à l'acide nalidixique ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole. Aucun non plus ne présentait de sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 et aux tableaux C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été détectée dans 91 % (48/53) des isolats de S. Paratyphi A et parmi 2 des 12 isolats de S. Paratyphi B. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été détectée dans 4% (2/53) des isolats de S. Paratyphi A et chez 1 des 12 isolats de S. Paratyphi B. Le profil de résistance le plus commun parmi les isolats de S. Paratyphi A était NAL (87 %, 46/53). Parmi ces isolats, 46 % (21/46) provenaient de l'Ontario et 37 % (17/46) de la Colombie-Britannique (aucune information sur les lysotypes n'était disponible). Le profil comportant le plus grand nombre d'isolats de S. Paratyphi A était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN (aucune information sur les lysotypes n'était disponible). Parmi les isolats de S. Paratyphi B, le profil le plus commun était ACSSuT (1 lysotype atypique).

Parmi les isolats sanguins, le profil de résistance le plus commun était NAL (89 %, 31/35), et tous les isolats présentant ce profil étaient des isolats de S. Paratyphi A. Le seul isolat de S. Paratyphi A provenant d'une culture d'urine était également résistant à l'acide nalidixique.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 3. Entre 2008 et 2003 et entre 2008 et 2007, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats de S. Paratyphi A ou S. Paratyphi B résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, le profil de résistance le plus commun parmi les isolats humains de Salmonella Paratyphi A était NAL (87 %, 46/53). Parmi ces isolats, 46 % (21/46) provenaient de l'Ontario et 37 % (17/46) provenaient de la Colombie-Britannique.

Tableau 4. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella Paratyphi A et de S. Paratyphi B; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canadaa %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 19	n = 4	n = 1	n = 5	n = 24	n = 11	n = 0	n = 1	n = 0	n = 0
I	Amoxicilline-acide clavulanique	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ceftiofur	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Ceftriaxone	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (100)	0 (0)	0 (0)	3
	Céfoxitine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Gentamicine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Kanamycine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Acide nalidixique	17 (89)	3 (75)	0 (0)	3 (60)	22 (92)	2 (18)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	74
	Streptomycine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (100)	0 (0)	0 (0)	3
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
III	Chloramphénicol	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (100)	0 (0)	0 (0)	3
	Sulfisoxazole	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	1 (100)	0 (0)	0 (0)	3
	Tétracycline	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	1 (4)	1 (9)	0 (0)	1 (100)	0 (0)	0 (0)	5
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. Aucun isolat de S. Paratyphi A ou S. Paratyphi B n'a été reçu du Nouveau-Brunswick, de l'Île-du-Prince-Édouard ou de Terre-Neuve-et-Labrador. a Pourcentages estimés pour le Canada et ajustés pour tenir compte des différentes proportions d'isolats fournis par rapport au total disponible dans chacune des provinces alors que les pourcentages dans le texte représentent les valeurs non ajustées (voir l'annexe A).

Salmonella Typhi
(n = 186)

Les taux d'incidence provinciaux des isolats humains de Salmonella Typhi ont varié de 0 à 2,34 cas (médiane = 0,22) par 100 000 habitants-années. Aucun cas n'a été signalé au Nouveau-Brunswick, en Nouvelle-Écosse, à l'Île-du-Prince-Édouard ou à Terre-Neuve-et-Labrador. Les lysotypes les plus communs qui ont été observés étaient LT E1 (35 %, 65/186), LT USV (I + IV) (11 %, 20/186), LT UVS (10 %, 19/186) et LT G3 (10 %, 18/186). L'identification du lysotype n'a pas été possible dans 8 % (15/186) des isolats et le lysotype a alors été désigné comme étant atypique. Soixante-quinze pour cent (140/186) des isolats provenaient de cultures sanguines, et moins de 1 % (1/186) provenaient de cultures d'urine (tableau C.2, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 5 et au tableau B.5 (annexe B). De la résistance à la ciprofloxacine a été détectée dans 72 % (134/186) des isolats de S. Typhi et de la résistance à l'acide nalidixique a été détectée dans 69 % des isolats (129/186). Aucun des isolats n'était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à la céfoxitine ou à la gentamicine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 et aux tableaux C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été détectée dans 74 % (137/186) des isolats de S. Typhi. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été détectée dans 17 % des isolats (31/186). Le profil de résistance le plus commun était NAL (54 %, 100/186). Ce profil de résistance a été principalement observé parmi les isolats LT E1 (47 %, 47/100), LT UVS (I + IV) (14 %, 14/100) et LT G3 (10 %, 10/100). Cinquante pour cent (50/100) des isolats présentant le profil de résistance NAL provenaient de l'Ontario. Trois pour cent (6/186) des isolats présentaient une sensibilité réduite à la ciprofloxacine sans être résistants à l'acide nalidixique. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACSSuT-NAL-SXT (3 dont le lysotype a été impossible à déterminer, 1 LT E1 et 1 LT UVS [I + IV]).

Parmi les isolats sanguins, le profil de résistance le plus commun était NAL, lequel a été observé parmi 54 % (76/140) des isolats. Les lysotypes courants associés à ce profil de résistance étaient LT E1 (45 %, 34/76) et LT UVS (I + IV) (13 %, 10/76). Le seul isolat provenant de cultures d'urine (LT G3) présentait également le profil de résistance à NAL.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 3. Le pourcentage d'isolats de S. Typhi présentant de la résistance à l'acide nalidixique était significativement plus élevé en 2008 (69%) qu'en 2003 (44 %, 56/127), mais il était similaire au cours des années 2008 et 2007 (78%, 122/156). Le pourcentage des isolats de S. Typhi résistants à la tétracycline était significativement moins élevé en 2008 (6 %, 11/186) qu'en 2007 (13 %, 20/156). Entre 2008 et 2003 et entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés n'a été observée.

En 2008, de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 72 % (134/186) des isolats humains de Salmonella Typhi et de la résistance à l'acide nalidixique a été détectée dans 69 % (129/186) des isolats. Le pourcentage des isolats résistants à l'acide nalidixique était significativement plus élevé en 2008 (69 %, 129/186) qu'en 2003 (44 %, 56/127), mais il était similaire en 2008 et en 2007 (78 %, 122/156). Trois pour cent (6/186) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique.

Tableau 5. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella Typhi; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canada %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 49	n = 17	n = 1	n = 4	n = 97	n = 18	n = 0	n = 0	n = 0	n = 0
I	Amoxicilline-acide clavulanique	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ceftiofur	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ceftriaxone	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	2 (4)	4 (24)	1 (100)	0 (0)	18 (19)	6 (33)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	17
	Céfoxitine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Gentamicine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Kanamycine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	< 1
	Acide nalidixique	34 (69)	14 (82)	1 (100)	3 (75)	67 (69)	10 (56)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	69
	Streptomycine	2 (4)	4 (24)	1 (100)	0 (0)	20 (21)	6 (33)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	18
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	2 (4)	3 (18)	1 (100)	0 (0)	20 (21)	6 (33)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	17
III	Chloramphénicol	2 (4)	3 (18)	1 (100)	0 (0)	21 (22)	6 (33)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	18
	Sulfisoxazole	2 (4)	4 (24)	1 (100)	0 (0)	21 (22)	6 (33)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	18
	Tétracycline	2 (4)	3 (18)	1 (100)	0 (0)	4 (4)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	6
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. Aucun isolat de S. Typhi n'a été reçu de la Saskatchewan, du Nouveau-Brunswick, de la Nouvelle-Écosse, de l'île-du-Prince-Édouard ou de Terre-Neuve-et-Labrador.

Salmonella Typhimurium
(n = 474)

Les taux d'incidence provinciaux de Salmonella Typhimurium chez les humains ont varié de 1,17 à 3,49 (médiane = 2,18) cas par 100 000 habitants-années. Les lysotypes les plus communs étaient LT 108 (21 %, 99/474), LT atypique (14 %, 68/474), LT 104 (11 %, 52/474) et LT 104b (6 %, 29/474). Trois pour cent des isolats (16/474) provenaient d'échantillons de sang et 2 % (11/474) d'échantillons d'urine (tableau C.2, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 6 et au tableau B.6 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été observée parmi 2 (12/474) des isolats de S. Typhimurium. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 2% (11/474) des isolats. Trois pour cent (15/474) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine. De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 2 % (10/474) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 8 et au tableau C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 40 % (187/474) des isolats de S. Typhimurium. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 25 % des isolats (118/474). Le profil de résistance le plus commun était ACSSuT (14 %, 64/474) et la plupart des isolats présentant ce profil étaient de type LT 104 (55 %, 35/64) et LT 104b (28 %, 18/64). Un isolat désigné comme étant un lysotype non typable présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à la ceftriaxone. Un pour cent (5/474) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine sans être résistants à l'acide nalidixique. Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens parmi les isolats étaient ACSSuT-A2C-CRO-GEN (1 LT U302 and 1 lysotype non typable), ACSSuT-A2C-CRO-SXT (1 LT U302), ACSSuT-A2C-CRO (2 LT 99 et 1 LT U302) et ACKSSuT-GEN-NAL-SXT (1 LT 120).

Dix des 16 isolats sanguins et 7 des 11 isolats provenant d'échantillons d'urine présentaient de la résistance à 1 antimicrobien ou plus. Le profil de résistance le plus commun parmi les isolats sanguins était ACSSuT (6/16) alors que AMP-SSS-TET (2/11) était le plus commun parmi les isolats provenant d'échantillons d'urine.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 3. Les pourcentages d'isolats de S. Typhimurium résistants à l'ampicilline, à la streptomycine et à la tétracycline étaient significativement moins élevés en 2008 (31 % [145/474], 30 % [144/474] et 32 % [152/474], respectivement) qu'en 2003 (44 % [269/605], 39 % [234/605)] et 47 % [282/605], respectivement). Toutefois, les pourcentages d'isolats résistants à l'ampicilline et à la streptomycine étaient significativement plus élevés en 2008 (31 % et 30 %, respectivement) qu'en 2007 (22 % [145/658] et 23 % [149/658], respectivement). Le pourcentage d'isolats présentant de la résistance à la tétracycline est demeuré semblable en 2008 (32 %) et 2007 (27 %, 176/658). Entre 2008 et 2003 et entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, les pourcentages d'isolats humains de Salmonella Typhimurium résistants à l'ampicilline et à la streptomycine (31 % [145/474] et 30 % [144/474], respectivement) étaient significativement plus élevés qu'en 2007 (22 % [145/658] et 23 % [149/658], respectivement).

Tableau 6. Résistance aux antimicrobiens parmi les isolats de Salmonella Typhimurium; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canadaa %
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 37	n = 58	n = 33	n = 26	n = 211	n = 62	n = 16	n = 23	n = 2	n = 6
I	Amoxicilline-acide clavulanique	1 (3)	0 (0)	1 (3)	3 (12)	6 (3)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ceftiofur	1 (3)	0 (0)	1 (3)	4 (15)	4 (2)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ceftriaxone	1 (3)	0 (0)	1 (3)	4 (15)	4 (2)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Ciprofloxacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	15 (41)	14 (24)	12 (36)	11 (42)	63 (30)	23 (37)	5 (31)	2 (9)	0 (0)	0 (0)	31
	Céfoxitine	1 (3)	1 (2)	1 (3)	3 (12)	4 (2)	1 (2)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Gentamicine	2 (5)	2 (3)	1 (3)	1 (4)	5 (2)	0 (0)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Kanamycine	9 (24)	13 (22)	2 (6)	3 (12)	18 (9)	8 (13)	4 (25)	1 (4)	0 (0)	1 (17)	13
	Acide nalidixique	2 (5)	3 (5)	0 (0)	1 (4)	2 (1)	1 (2)	1 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2
	Streptomycine	14 (38)	21 (36)	13 (39)	9 (35)	65 (31)	18 (29)	4 (25)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	31
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	5 (14)	2 (3)	0 (0)	2 (8)	7 (3)	5 (8)	2 (13)	1 (4)	0 (0)	0 (0)	5
III	Chloramphénicol	9 (24)	8 (14)	11 (33)	3 (12)	54 (26)	13 (21)	2 (13)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	22
	Sulfisoxazole	17 (46)	22 (38)	13 (39)	9 (35)	67 (32)	19 (31)	6 (38)	3 (13)	0 (0)	0 (0)	33
	Tétracycline	19 (51)	13 (22)	14 (42)	8 (31)	63 (30)	24 (39)	6 (38)	3 (13)	0 (0)	2 (33)	32
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. a Pourcentages estimés pour le Canada et ajustés pour tenir compte des différentes proportions d'isolats fournis par rapport au total disponible dans chacune des provinces alors que les pourcentages dans le texte représentent les valeurs non ajustées (voir l'annexe A).

Salmonella «  autres sérotypes »
(n = 1151)

La catégorie Salmonella « autres sérotypes » représentait 32 % (1151/3601) de tous les isolats de Salmonella et comprenait 162 sérotypes différents. Quatre pour cent (49/1151) des isolats provenaient d'échantillons sanguins et 7 % (78/1151) d'échantillons d'urine (tableau C.2, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau 7 et au tableau B.7 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été observée dans 2 % (19/1151) des isolats de Salmonella « autres sérotypes » (Agona, Anatum, ssp. I 4,[5],12:i:-, ssp. I Rough-O:i:-, ssp. I Rough-O:i:1,2, ssp. Rough-O:r:1,2, Kentucky, Reading, Saintpaul et Stanley). De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 2 % (21/1151) des isolats (ssp. I 4,[5],12:i:-, Agona, Anatum, Hadar, ssp. I Rough-O:i:1,2, ssp. Rough-O:r:1,2, Irenea, Kentucky, Reading, Saintpaul et Stanley). Un pour cent (11/1151) des isolats (Kentucky) étaient résistants à la ciprofloxacine et 5 % (60/1151) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et étaient principalement des sérotypes ssp. I 4,[5],12:i:- Infantis, Hadar, Agona, Thompson et ssp. I 4,[5],12:b:-. De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 5 % (56/1151) des isolats. Aucun isolat n'était résistant à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens: Les résultats sont présentés au tableau 8 et au tableau C.3 et C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 24 % (274/1151) des isolats de Salmonella « autres sérotypes ». La plupart de ces isolats comprenaient les sérotypes Hadar (22 %, 60/274), ssp. I 4,[5],12:i:- (18 %, 48/274), Agona (7 %, 18/274) et Kentucky (7 %, 18/274). De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 5 % (60/1151) des isolats. Le profil de résistance le plus commun était STR-TET (5 %, 55/1151), observé surtout parmi les isolats de Hadar (82 %, 45/55) et Kentucky (11 %, 6/55). Moins de 1 % (2/1151) des isolats (Saintpaul et ssp. I 4,[5],12:i:-) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à la ceftriaxone. Deux pour cent (18/1151) des isolats (Corvallis, Derby, ssp. I 4,[5],12:i:-, ssp. I Rough-O:i:-, Litchfield, Manhattan, Mbandaka, Muenster, Saintpaul et Weltevreden) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine sans être résistants à l'acide nalidixique. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN-SXT (1 Saintpaul).

Vingt-deux pour cent (11/49) des isolats sanguins et 20 % (14/78) des isolats provenant d'échantillons d'urine étaient résistants à 1 antimicrobien ou plus. Les profils de résistance les plus communs parmi les isolats sanguins étaient NAL (4 % 2/49) et STR-TET (4 %, 2/49) et les plus communs parmi les échantillons d'urine étaient SSS-TET (4 %, 3/78) et STR-TET (4 %, 3/78.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 3. Entre 2008 et 2003, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats de Salmonella « autres sérotypes » résistants aux antimicrobiens sélectionnés. Le pourcentage d'isolats présentant de la résistance au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (2 %) qu'en 2007 (1 %, 8/1090). De façon analogue, les pourcentages d'isolats présentant de la résistance à la gentamicine et à l'acide nalidixique étaient significativement plus élevés en 2008 (2 % [28/1151] et 5 %, respectivement) qu'en 2007 (1 % [6/1090] et 3 % [35/1090)], respectivement). Entre 2008 et 2007, aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, 2 des 1151 isolats humains de Salmonella « autres sérotypes » ( S. Saintpaul et Salmonella ssp. I 4,[5],12:i:-) ont présenté de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à la ceftriaxone. Deux pour cent (18/1151) des isolats ( S. Corvallis, S. Derby, Salmonella ssp. I 4,[5],12:i:-, Salmonella ssp. I Rough-O:i:-, S. Litchfield, S. Manhattan, S. Mbandaka, S. Muenster, S. Saintpaul et S. Weltevreden) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique. Le pourcentage d'isolats présentant de la résistance au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (2 %, 21/1151) qu'en 2007 (1 %, 8/1090). De façon analogue, les pourcentages d'isolats présentant de la résistance à la gentamicine et à l'acide nalidixique étaient significativement plus élevés en 2008 (2 % [28/1151] et 5 % [56/1151], respectivement) qu'en 2007 (1 % [6/1090] et 3 % [35/1090)], respectivement).

Tableau 7. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella « autres sérotypes »; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Antimicrobien		Nombre (%) d'isolats résistants										Canadaa
		BC	AB	SK	MB	ON	QC	NB	NS	PEI	NL
		n = 157	n = 142	n = 76	n = 103	n = 417	n = 168	n = 32	n = 39	n = 5	n = 12	%
I	Amoxicilline-acide clavulanique	3 (2)	2 (1)	1 (1)	2 (2)	5 (1)	4 (2)	1 (3)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	2
	Ceftiofur	3 (2)	2 (1)	1 (1)	2 (2)	5 (1)	4 (2)	1 (3)	2 (5)	0 (0)	1 (8)	2
	Ceftriaxone	3 (2)	2 (1)	1 (1)	2 (2)	5 (1)	4 (2)	1 (3)	2 (5)	0 (0)	1 (8)	2
	Ciprofloxacine	1 (1)	1 (1)	0 (0)	0 (0)	5 (1)	3 (2)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	1
II	Amikacine	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0
	Ampicilline	10 (6)	9 (6)	5 (7)	7 (7)	21 (5)	13 (8)	1 (3)	5 (13)	1 (20)	1 (8)	6
	Céfoxitine	3 (2)	2 (1)	2 (3)	5 (5)	5 (1)	4 (2)	1 (3)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	2
	Gentamicine	3 (2)	2 (1)	1 (1)	3 (3)	11 (3)	3 (2)	0 (0)	3 (8)	1 (20)	1 (8)	2
	Kanamycine	2 (1)	2 (1)	1 (1)	1 (1)	8 (2)	2 (1)	0 (0)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	2
	Acide nalidixique	16 (10)	4 (3)	4 (5)	2 (2)	22 (5)	5 (3)	2 (6)	0 (0)	1 (20)	0 (0)	5
	Streptomycine	24 (15)	13 (9)	10 (13)	14 (14)	52 (12)	17 (10)	3 (9)	10 (26)	1 (20)	3 (25)	12
	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	10 (6)	2 (1)	5 (7)	3 (3)	17 (4)	2 (1)	1 (3)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3
III	Chloramphénicol	6 (4)	5 (4)	4 (5)	5 (5)	8 (2)	3 (2)	1 (3)	2 (5)	0 (0)	1 (8)	3
	Sulfisoxazole	20 (13)	13 (9)	11 (14)	14 (14)	40 (10)	14 (8)	1 (3)	6 (15)	2 (40)	2 (17)	10
	Tétracycline	38 (24)	26 (18)	27 (36)	24 (23)	65 (16)	25 (15)	4 (13)	8 (21)	2 (40)	6 (50)	19
IV
Les chiffres romains de I à IV indiquent le rang des antimicrobiens selon leur importance en médecine humaine, tel que défini par la Direction des médicaments vétérinaires. a Pourcentages estimés pour le Canada et ajustés pour tenir compte des différentes proportions d'isolats fournis par rapport au total disponible dans chacune des provinces alors que les pourcentages dans le texte représentent les valeurs non ajustées (voir l'annexe A).

Tableau 8. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats humains de Salmonella, par province et sérotype; Surveillance des isolats cliniques humains, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Colombie-Britannique
Enteritidis	211 (41,6)	182	28	1	0
Typhi	49 (9,7)	13	34	2	0
Typhimurium	37 (7,3)	16	10	10	1
Newport	18 (3,6)	18	0	0	0
Paratyphi A	18 (3,6)	1	17	0	0
Heidelberg	16 (3,2)	10	6	0	0
I 4,[5],12:i:-	14 (2,8)	6	6	1	1
Stanley	11 (2,2)	6	4	0	1
Sérotypes moins communs	133 (26,2)	97	33	3	0
Total	507 (100)	349	138	17	3
Alberta
Enteritidis	147 (34,3)	120	26	1	0
Typhimurium	58 (13,6)	34	12	12	0
Heidelberg	32 (7,5)	18	12	1	1
Newport	28 (6,5)	24	2	2	0
I 4,[5],12:i:-	18 (4,2)	11	7	0	0
Typhi	17 (4,0)	3	10	4	0
Infantis	14 (3,3)	14	0	0	0
Sérotypes moins communs	114 (26,6)	88	19	7	0
Total	428 (100)	312	88	27	1
Saskatchewan
Enteritidis	58 (31,5)	50	8	0	0
Typhimurium	33 (17,9)	18	4	10	1
I 4,[5],12:i:-	18 (9,8)	11	6	0	1
Hadar	9 (4,9)	0	9	0	0
Newport	8 (4,3)	7	1	0	0
Heidelberg	7 (3,8)	7	0	0	0
Agona	6 (3,3)	1	5	0	0
Sérotypes moins communs	45 (24,5)	36	6	3	0
Total	184 (100)	130	39	13	2
Manitoba
Enteritidis	85 (34,3)	73	12	0	0
Typhimurium	26 (10,5)	15	3	7	1
I 4,[5],12:i:-	24 (9,7)	17	7	0	0
Heidelberg	19 (7,7)	14	5	0	0
Agona	8 (3,2)	6	2	0	0
Newport	6 (2,4)	6	0	0	0
Kentucky	5 (2,0)	3	2	0	0
Thompson	5 (2,0)	5	0	0	0
Sérotypes moins communs	70 (28,2)	42	25	2	1
Total	248 (100)	181	56	9	2
Ontario
Enteritidis	412 (30,8)	347	62	3	0
Typhimurium	211 (15,8)	136	19	54	2
Heidelberg	102 (7,6)	59	43	0	0
Typhi	97 (7,3)	25	54	18	0
Newport	74 (5,5)	70	2	1	1
Infantis	37 (2,8)	35	2	0	0
I 4,[5],12:i:-	28 (2,1)	19	8	1	0
Sérotypes moins communs	376 (28,1)	289	68	17	2
Total	1337 (100)	980	258	94	5
Québec
Enteritidis	221 (38,0)	193	28	0	0
Heidelberg	65 (11,2)	34	29	2	0
Typhimurium	62 (10,7)	33	15	13	1
Newport	37 (6,4)	37	0	0	0
Typhi	18 (3,1)	7	5	6	0
Thompson	16 (2,7)	15	1	0	0
I 4,[5],12:i:-	15 (2,6)	8	6	1	0
I 4,[5],12:b:-	12 (2,1)	12	0	0	0
Sérotypes moins communs	136 (23,4)	108	22	6	0
Total	582 (100)	447	106	28	1
Nouveau-Brunswick
Enteritidis	39 (36,4)	33	6	0	0
Heidelberg	17 (15,9)	11	5	1	0
Typhimurium	16 (15,0)	10	2	4	0
Agona	5 (4,7)	4	0	1	0
Hadar	3 (2,8)	0	3	0	0
Hartford	3 (2,8)	3	0	0	0
Newport	3 (2,8)	3	0	0	0
Oranienburg	3 (2,8)	3	0	0	0
Sérotypes moins communs	18 (16,8)	16	2	0	0
Total	107 (100)	83	18	6	0
Nouvelle-Écosse
Enteritidis	41 (32,0)	37	3	1	0
Typhimurium	23 (18,0)	19	4	0	0
Heidelberg	22 (17,2)	19	3	0	0
Hadar	7 (5,5)	0	6	1	0
I 4,[5],12:i:-	3 (2,3)	2	1	0	0
Infantis	3 (2,3)	3	0	0	0
Poona	3 (2,3)	3	0	0	0
Sérotypes moins communs	26 (20,3)	22	1	3	0
Total	128 (100)	105	18	5	0
Île-du-Prince-Édouard
Enteritidis	10 (45,5)	10	0	0	0
Heidelberg	5 (22,7)	4	1	0	0
I 4,[5],12:b:-	2 (9,1)	2	0	0	0
Typhimurium	2 (9,1)	2	0	0	0
I 4,[5],12:i:-	1 (4,5)	0	1	0	0
Infantis	1 (4,5)	1	0	0	0
Kentucky	1 (4,5)	0	0	1	0
Total	22 (100)	19	2	1	0
Terre-Neuve-et-Labrador
Enteritidis	34 (58,6)	31	3	0	0
Typhimurium	6 (10,3)	4	2	0	0
Heidelberg	5 (8,6)	3	2	0	0
Hadar	3 (5,2)	0	3	0	0
I 4,[5],12:i:-	3 (5,2)	2	0	1	0
Agona	2 (3,4)	0	2	0	0
Sérotypes moins communs	5 (8,6)	5	0	0	0
Total	58 (100)	45	12	1	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

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Figure 2. - Texte équivalent

Figure 2. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés, parmi les isolats cliniques humains, 2003-2008.

	Enteritidis						Heidelberg						Newport
Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	352	549	612	710	910	1258	608	556	409	430	318	290	175	152	142	146	127	177
Antimicrobien
Ampicilline	2%	4%	2%	3%	2%	3%	35%	45%	47%	39%	30%	32%	13%	11%	9%	12%	5%	3%
Ceftiofur	1%	0%	1%	0%	0%	0%	22%	33%	29%	13%	15%	14%	10%	9%	8%	8%	3%	2%
Gentamicine	0%	1%	1%	0%	0%	0%	4%	1%	1%	3%	3%	2%	1%	1%	1%	0%	0%	1%
Acide nalidixique	19%	23%	9%	20%	18%	13%	1%	1%	1%	2%	1%	0%	3%	1%	0%	5%	2%	1%
Streptomycine	1%	4%	2%	1%	1%	1%	12%	8%	8%	13%	10%	7%	10%	12%	10%	13%	5%	2%
Tétracycline	3%	5%	2%	4%	6%	2%	15%	16%	11%	13%	7%	6%	13%	13%	10%	18%	9%	4%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	1%	1%	0%	1%	1%	0%	1%	1%	3%	2%	1%	1%	1%	1%	1%	2%	2%	1%

Figure 3. - Cliquez pour agrandir

Figure 3. - Texte équivalent

Figure 3. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés, parmi les isolats humains de Salmonella des sérotypes Paratyphi A et B, Typhi, Typhimurium et « autres sérotypes »; Surveillance des isolats cliniques humains, 2003-2008.

	Typhi						Paratyphi A et B						Typhimurium						Autres sérotypes
Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	127	125	121	164	156	186	27	43	70	66	45	65	605	597	559	539	658	474	1147	1110	1245	1150	1090	1151
Antimicrobien
Ampicilline	10%	16%	26%	18%	21%	17%	11%	0%	7%	2%	4%	5%	44%	38%	44%	30%	22%	31%	7%	8%	10%	7%	6%	6%
Ceftiofur	1%	0%	0%	1%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	2%	2%	2%	4%	1%	1%	2%	2%	2%	2%	3%	1%	2%
Gentamicine	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	2%	1%	2%	2%	1%	2%	3%	2%	2%	1%	1%	1%	2%
Acide nalidixique	44%	57%	72%	80%	78%	69%	70%	84%	74%	85%	69%	72%	1%	1%	3%	2%	3%	2%	4%	5%	4%	5%	3%	5%
Streptomycine	10%	16%	27%	14%	21%	18%	11%	0%	9%	0%	4%	5%	39%	35%	40%	36%	23%	30%	11%	12%	13%	10%	10%	13%
Tétracycline	9%	15%	24%	10%	13%	6%	11%	0%	10%	2%	4%	6%	47%	41%	48%	38%	27%	32%	20%	19%	19%	15%	18%	20%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	9%	16%	26%	15%	21%	17%	11%	0%	3%	0%	2%	2%	6%	7%	8%	8%	5%	5%	4%	3%	3%	4%	3%	3%

Bovins

Salmonella

Surveillance des isolats cliniques animaux¹⁵ (n = 134)

Note : Les isolats pouvaient provenir de bovins laitiers ou de bovins de boucherie.

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 9 et au tableau C.3 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient Typhimurium (22 %, 30/134), Typhimurium var. 5- (19 %, 25/134) et Kentucky (11 %, 15/134). Ces 3 sérotypes représentaient 52 % (70/134) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.8 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur et à la ceftriaxone a été observée dans 4 % (6/134) des isolats de Salmonella. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 1 % (1/134) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 9 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 39 % (52/134) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 28 % (38/134) des isolats (21 S. Typhimurium var. 5-, 13 S. Typhimurium, 3 S. Heidelberg et 1 S. Agona). Les profils de résistance les plus communs étaient ACKSSuT (7 %, 10/134), ACKSSuT-GEN (5 %, 7/134) et ACSSuT (4 %, 6/134). Parmi les 10 isolats présentant le profil de résistance ACKSSuT, 7 d'entre eux étaient des isolats de S. Typhimurium var. 5-, et 3 étaient des isolats de S. Typhimurium. Un pour cent (1/134) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique. Parmi les isolats, le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-SXT (3 S. Typhimurium LT 108).

En 2008, les profils de résistance les plus communs parmi les isolats cliniques de Salmonella provenant de bovins étaient ACKSSuT (7 %, 10/134), ACKSSuT-GEN (5 %, 7,134) et ACSSuT (4 %, 6/134). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 4 % (6/134) des isolats. Un pour cent (1/134) des isolats présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistant à l'acide nalidixique. Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-SXT (3 S. Typhimurium LT 108).

Tableau 9. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de bovins, par sérotype; Surveillance des isolats cliniques animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Typhimurium	30 (22,4)	10	7	10	3
Typhimurium var. 5-	25 (18,7)	2	2	21	0
Kentucky	15 (11,2)	15	0	0	0
Cerro	13 (9,7)	13	0	0	0
I 6,14,18:-:-	10 (7,5)	10	0	0	0
Heidelberg	9 (6,7)	3	3	3	0
Muenster	8 (6,0)	8	0	0	0
Enteritidis	4 (3,0)	3	1	0	0
Thompson	4 (3,0)	4	0	0	0
Sérotypes moins communs	16 (11,9)	14	1	0	1
Total	134 (100)	82	14	34	4
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Escherichia coli

Surveillance en abattoir
(n = 176)

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 97 % (176/182) des échantillons caecaux de bovins de boucherie (tableau C.5, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 4 et au tableau B.9 (annexe B). Aucun des isolats d'E. coli n'était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à la céfoxitine, à la gentamicine, à l'acide nalidixique ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole. De plus, aucun des isolats ne présentait de la sensibilité réduite à la ceftriaxone ou de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 39 % (69/176) des isolats d'E. coli. Aucun des isolats n'était résistant à 5 antimicrobiens ou plus. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (17 %, 30/176) et SSS-TET (5 %, 9/176). Les profils de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient CHL-STR-SSS-TET et KAN-STR-SSS-TET, qui ont chacun été observés parmi 4 isolats dont 1 qui présentait les deux profils.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 5. Entre 2008 et 2003 et entre 2008 et 2007, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats d'E. coli résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 39 % (69/176) des isolats provenant d'échantillons de bovins de boucherie prélevés en abattoir. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (17 %, 30/176) et SSS-TET (5 %, 9/176). Aucun des isolats n'était résistant aux antimicrobiens de la Catégorie I testés, et aucun n'était résistant à 5 antimicrobiens ou plus.

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Figure 4. - Texte équivalent

Figure 4. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde bovins de boucherie; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Pourcentage	Bovins de boucherie (n = 176)
			Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	38%	30%	45%
	Sulfisoxazole	15%	10%	22%
	Chloramphénicol	3%	1%	7%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0%	0%	2%
	Streptomycine	15%	10%	21%
	Acide nalidixique	0%	0%	2%
	Kanamycine	3%	1%	7%
	Gentamicine	0%	0%	2%
	Céfoxitine	0%	0%	2%
	Ampicilline	1%	0%	4%
	Amikacine	0%	0%	2%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	2%
	Ceftriaxone	0%	0%	2%
	Ceftiofur	0%	0%	2%
	Amoxicilline-acide clavulanique	0%	0%	2%

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Figure 5. - Texte équivalent

Figure 5. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de bovins de boucherie; Surveillance en abattoir, 2003-2008.

Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	153	167	122	150	188	176
Antimicrobien
Ampicilline	3%	7%	2%	5%	3%	1%
Ceftiofur	1%	1%	0%	0%	0%	0%
Gentamicine	0%	1%	0%	0%	1%	0%
Acide nalidixique	1%	1%	0%	0%	0%	0%
Streptomycine	14%	10%	8%	9%	12%	15%
Tétracycline	29%	25%	22%	30%	36%	38%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	1%	1%	0%	1%	0%	0%

Surveillance de la viande vendue au détail
(n = 572)
(Colombie-Britannique [n = 88], Saskatchewan [n = 134], Ontario [n = 185], Québec [n = 126], Région des Maritimes [n = 39])

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 72 % (572/798) des échantillons de viande de bœuf vendue au détail. Les pourcentages par province ou région d'échantillons de viande de bœuf à partir desquels les isolats ont été obtenus se répartissent comme suit : Colombie-Britannique, 77 % (88/115); Saskatchewan, 76 % (134/177); Ontario, 78 % (185/236); Québec, 59 % (126/214) et la région des Maritimes, 70 % (39/56; tableau C.5, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 6 et au tableau B.10 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur et à la ceftriaxone a été détectée dans 2 % (2/88) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 1 % (1/134) des isolats de la Saskatchewan, 1 % (2/185) des isolats de l'Ontario, 1 % (1/126) des isolats du Québec et 3 % (1/39) des isolats de la région des Maritimes. Aucune différence significative entre les provinces/région n'a été constatée en ce qui a trait aux pourcentages d'isolats résistants à l'un des antimicrobiens testés. Aucun isolat d'aucune province ou région n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique ou présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 28 % (25/88) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 22 % (29/134) des isolats de la Saskatchewan, 23 % (43/185) des isolats de l'Ontario, 18 % (23/126) des isolats du Québec et 21 % (8/39) des isolats de la région des Maritimes. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 3 % (3/88) des isolats de la Colombie-Britannique, 1 % (1/134) des isolats de la Saskatchewan, 3 % (6/185) des isolats de l'Ontario, 1 % (1/126) des isolats du Québec et 3 % (1/39) des isolats de la région des Maritimes. Parmi les isolats des 5 provinces/région, les profils de résistance les plus communs étaient TET (9 %, 51/572) et SSS-TET (3 %, 15/572). Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens parmi les isolats était AKSSuT-A2C-CRO, observé dans 1 isolat provenant du Québec.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 7. Le pourcentage d'isolats d'E. coli de la Saskatchewan présentant de la résistance à la tétracycline était significativement plus élevé en 2008 (20 %, 27/134) qu'en 2007 (8 %, 9/118) et 2005 (9 %, 11/120). Le pourcentage d'isolats de l'Ontario présentant de la résistance à la streptomycine était significativement plus élevé en 2008 (11 %, 21/185) qu'en 2007 (3 %, 6/187). Dans le cas des autres provinces/région, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, le pourcentage d'isolats d'Escherichia coli provenant de viande de bœuf vendue au détail en Saskatchewan qui présentait de la résistance à la tétracycline (20 %, 27/134) était significativement plus élevé qu'en 2007 (8 %, 9/118) et 2005 (9 %, 11/120). Le pourcentage d'isolats de l'Ontario résistants à la streptomycine était significativement plus élevé en 2008 (11 %, 21/185) qu'en 2007 (3 %, 6/187).

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Figure 6. - Texte équivalent

Figure 6. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde viande de bœuf; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Maritimes (n = 39)			Québec (n = 126)			Ontario (n = 185)			Saskatchewan (n = 134)			Colombie-Britannique (n = 88)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	18%	8%	34%	17%	11%	24%	21%	15%	27%	20%	14%	28%	23%	14%	33%
	Sulfisoxazole	3%	0%	13%	8%	4%	14%	13%	8%	19%	7%	4%	13%	9%	4%	17%
	Chloramphénicol	0%	0%	7%	1%	0%	4%	3%	1%	7%	1%	0%	4%	0%	0%	3%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	3%	0%	13%	1%	0%	4%	3%	1%	7%	1%	0%	4%	0%	0%	3%
	Streptomycine	5%	1%	17%	7%	3%	13%	11%	7%	17%	5%	2%	10%	9%	4%	17%
	Acide nalidixique	0%	0%	7%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	3%
	Kanamycine	3%	0%	13%	5%	2%	10%	2%	0%	5%	1%	0%	4%	2%	0%	8%
	Gentamicine	0%	0%	7%	0%	0%	2%	1%	0%	4%	0%	0%	2%	0%	0%	3%
	Céfoxitine	3%	0%	13%	1%	0%	4%	2%	0%	5%	1%	0%	4%	2%	0%	8%
	Ampicilline	3%	0%	13%	2%	0%	7%	6%	3%	10%	1%	0%	4%	6%	2%	13%
	Amikacine	0%	0%	7%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	3%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	7%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	3%
	Ceftriaxone	3%	0%	13%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	2%	0%	8%
	Ceftiofur	3%	0%	13%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	2%	0%	8%
	Amoxicilline-acide clavulanique	3%	0%	13%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	1%	0%	4%	2%	0%	8%

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Figure 7. - Texte équivalent

Figure 7. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de viande de bœuf; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008.

	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	49	88	120	123	118	134	101	190	184	189	187	185	84	137	126	109	147	126	39
Antimicrobien
Ampicilline	2%	6%	2%	1%	3%	1%	8%	5%	3%	4%	3%	6%	7%	4%	6%	4%	3%	2%	3%
Ceftiofur	0%	2%	0%	0%	0%	1%	2%	1%	0%	1%	0%	1%	0%	2%	1%	0%	1%	1%	3%
Gentamicine	0%	0%	0%	0%	1%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	1%	1%	0%	1%	0%	0%	0%	0%
Acide nalidixique	2%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	1%	0%	1%	1%	0%	1%	1%	0%	0%	0%	0%	0%
Streptomycine	2%	9%	4%	2%	1%	5%	11%	6%	5%	4%	3%	11%	7%	9%	4%	6%	7%	7%	5%
Tétracycline	10%	23%	9%	9%	8%	20%	23%	19%	17%	15%	14%	21%	19%	15%	17%	20%	15%	17%	18%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	4%	0%	1%	0%	0%	1%	2%	2%	1%	2%	2%	3%	1%	2%	3%	2%	2%	1%	3%

Campylobacter

Surveillance en abattoir
(n = 128)

Isolement bactérien : Des isolats de Campylobacter ont été détectés dans 71 % (129/182) échantillons caecaux provenant de bovins de boucherie (tableau C.5, annexe C). Un des isolats n'a pu être mis en culture après avoir été congelé; 128 isolats ont donc pu être utilisés pour les tests de sensibilité aux antimicrobiens. Vingt-trois pour cent (30/128) des isolats restants étaient des C. coli, 73 % (93/128) étaient des C. jejuni et 4 % (5/128) étaient d'autres Campylobacter spp.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 8 et au tableau B.11 (annexe B). De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 2 % (3/128) des isolats de Campylobacter (1 C. coli et 2 C. jejuni). Aucun des isolats n'était résistant à la télithromycine, à l'azithromycine, à la clindamycine, à l'érythromycine ou à la gentamicine ou était non-sensible au florfénicol.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 10. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 67 % (86/128) des isolats de Campylobacter. De la résistance à 3 antimicrobiens ou plus a été observée dans 2 % (2/128) des isolats. Le profil de résistance le plus commun était TET (63 %, 80/128). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était CIP-NAL-TET, ce profil a été observé parmi 2 isolats de C. jejuni.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 9. Entre 2008 et 2006 et entre 2008 et 2007, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats de Campylobacter résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 67 % (86/128) des isolats de Campylobacter provenant d'échantillons de bovins de boucherie prélevés en abattoir. De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 2 % (3/128) des isolats (1 C. coli et 2 C. jejuni). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était CIP-NAL-TET, ce profil a été observé parmi 2 isolats de C. jejuni.

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Figure 8. - Texte équivalent

Figure 8. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Campylobacter provenantde bovins de boucherie; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Campylobacter jejuni (n = 93)			Campylobacter coli (n = 30)			Campylobacter spp. (n = 5)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	60%	50%	70%	87%	69%	96%	60%	15%	95%
	Florfénicol	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
II	Acide nalidixique	2%	0%	8%	3%	0%	17%	60%	15%	95%
	Gentamicine	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
	Érythromycine	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
	Clindamycine	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
	Azithromycine	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
I	Télithromycine	0%	0%	3%	0%	0%	10%	0%	0%	45%
	Ciprofloxacine	2%	0%	8%	3%	0%	17%	0%	0%	45%

Tableau 10. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Campylobacter provenant de bovins, par espèce de Campylobacter; Surveillance en abattoir, 2008.

Espèce	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 2	3 - 4	5 - 9
		Nombre d'isolats
C. jejuni	93 (72,7)	37	56	0	0
C. coli	30 (23,4)	3	27	0	0
Campylobacter spp.	5 (3,9)	2	3	0	0
Total	128 (100)	42	86	0	0

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Figure 9. - Texte équivalent

Figure 9. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Campylobacter provenant de bovins; Surveillance en abattoir, 2006-2008.

Année	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	105	73	128
Antimicrobien
Azithromycine	0%	0%	0%
Ciprofloxacine	1%	1%	2%
Gentamicine	0%	0%	0%
Tétracycline	46%	66%	66%

Poulets

Salmonella

Surveillance en abattoir
(n = 234)

Isolement bactérien : Des isolats de Salmonella ont été détectés dans 27 % (234/851) des échantillons caecaux provenant de poulets (tableau C.5, annexe C).

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 11 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient Kentucky (40 %, 93/234), Enteritidis (19 %, 45/234) et Heidelberg (14 %, 33/234). Ces 3 sérotypes représentaient 73 % (171/234) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 10 et au tableau B.12 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 12 % (27/234) des isolats de Salmonella. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à l'acide nalidixique ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole. De plus, aucun isolat ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 11 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 52 % (121/234) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 12 % (28/234) des isolats (17 S. Kentucky, 6 S. Heidelberg, 2 S. Kiambu, 1 S. Infantis, 1 S. Typhimurium et 1 S. Typhimurium var. 5-). Les profils de résistance les plus communs étaient STR-TET (29 %, 69/234) et A2C-AMP-CRO (5 %, 12/234). Le principal sérotype associé au profil STR-TET était Kentucky (77 %, 53/69). Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient A2C-AMP-CRO-STR-SSS et A2C-AMP-CRO-STR-TET, respectivement observés parmi 1 et 10 isolats de S. Kentucky.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 11. Le pourcentage d'isolats de Salmonella présentant de la résistance à la tétracycline était significativement plus élevé en 2008 (41 %, 96/234) qu'en 2003 (19 %, 24/126). Les pourcentages d'isolats présentant de la résistance au ceftiofur et à l'ampicilline étaient significativement moins élevés en 2008 (12 % et 16 % [38/234], respectivement) qu'en 2004 (22 % [31/142] et 28 % [39/142], respectivement).¹⁶

En 2008, le pourcentage d'isolats de Salmonella provenant d'échantillons de poulets prélevés en abattoir et qui présentaient de la résistance à la tétracycline (41 %, 96/234) était significativement plus élevé qu'en 2003 (19 %, 24/126). Les pourcentages d'isolats résistants au ceftiofur et à l'ampicilline étaient significativement moins élevés en 2008 (12 % [27/234] et 16 % [38/234], respectivement) qu'en 2004 (22 % [31/142] et 28 % [39/142], respectivement).

Tableau 11. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de poulets, par sérotype; Surveillance en abattoir, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Kentucky	93 (39,7)	18	58	17	0
Enteritidis	45 (19,2)	45	0	0	0
Heidelberg	33 (14,1)	19	8	6	0
Hadar	13 (5,6)	0	13	0	0
Typhimurium	7 (3,0)	5	1	1	0
Mbandaka	5 (2,1)	5	0	0	0
Rissen	5 (2,1)	1	4	0	0
Sérotypes moins communs	33 (14,1)	20	9	4	0
Total	234 (100)	113	93	28	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

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Figure 10. - Texte équivalent

Figure 10. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella provenant depoulets; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Poulets (n = 234)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	41%	35%	48%
	Sulfisoxazole	3%	1%	6%
	Chloramphénicol	0%	0%	2%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0%	0%	1%
	Streptomycine	40%	33%	46%
	Acide nalidixique	0%	0%	1%
	Kanamycine	0%	0%	2%
	Gentamicine	0%	0%	2%
	Céfoxitine	11%	7%	15%
	Ampicilline	16%	12%	22%
	Amikacine	0%	0%	1%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	1%
	Ceftriaxone	12%	8%	16%
	Ceftiofur	12%	8%	16%
	Amoxicilline-acide clavulanique	12%	8%	16%

Figure 11. - Cliquez pour agrandir

Figure 11. - Texte équivalent

Figure 11. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Salmonella provenant de poulets; Surveillance en abattoir, 2003-2008.

Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	126	142	199	187	206	234
Antimicrobien
Ampicilline	25%	27%	18%	16%	18%	16%
Ceftiofur	6%	22%	13%	10%	12%	12%
Gentamicine	5%	1%	2%	2%	0%	0%
Acide nalidixique	0%	0%	0%	0%	0%	0%
Streptomycine	24%	12%	14%	35%	37%	40%
Tétracycline	19%	15%	21%	37%	44%	41%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	1%	0%	1%	1%	0%	0%

Surveillance de la viande vendue au détail (n = 382) (Colombie-Britannique [n = 47], Saskatchewan [n = 64], Ontario [n = 139], Québec [n = 120], Région des Maritimes [n = 12])

Isolement bactérien : Des isolats de Salmonella ont été détectés dans 40 % (382/960) des échantillons de viande de poulet vendue au détail (tableau C.5, annexe C). Les pourcentages d'échantillons de viande de poulet dans lesquels on a détecté des isolats pour chacune des provinces/région se répartissent comme suit : Colombie-Britannique, 32 % (47/145); Saskatchewan, 40 % (64/161); Ontario, 45 % (139/311); Québec, 42 % (120/287) et région des Maritimes, 22 % (12/56).

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 12 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient Kentucky (31 %, 120/382), Heidelberg (20 %, 78/382), Enteritidis (16 %, 62/382), et Hadar (6 %, 22/382). Les sérotypes les plus communs par province ou région étaient Enteritidis (30 %, 14/47) et Kentucky (28 %, 13/47) pour la Colombie-Britannique; Kentucky (23 %, 15/64) et Enteritidis (22 %, 14/64) pour la Saskatchewan; Kentucky (33 %, 46/139) et Enteritidis (16 %, 22/139) pour l'Ontario; Kentucky (37 %, 44/120) et Heidelberg (32 %, 38/120) pour le Québec, et Heidelberg (4/12) et Thompson (3/12) pour la région des Maritimes.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 12 et au tableau B.13 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été respectivement détectées dans 21 % (10/47), 23 % (11/47) et 23 % (11/47) des isolats de Salmonella de la Colombie-Britannique, et de la résistance à chacun de ces antimicrobiens a également été détectée dans 5 % (3/64) des isolats de la Saskatchewan. Neuf pour cent (13/139) des isolats de l'Ontario étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été observées dans 10 % (14/139) des isolats. De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 15 % (18/120) des isolats du Québec, ainsi que parmi 2 des 12 isolats de la région des Maritimes. Aucune différence significative n'a été constatée entre les différentes provinces / région en ce qui a trait aux isolats présentant de la résistance aux antimicrobiens testés. Aucun des isolats des 5 provinces/région n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique. Aucun isolat n'a présenté de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 12. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 40 % (19/47) des isolats de Salmonella de la Colombie-Britannique, 44 % (28/64) des isolats de la Saskatchewan, 47 % (65/139) des isolats de l'Ontario, 54 % (65/120) des isolats du Québec et parmi 3 des 12 isolats des Maritimes. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 26 % (12/47) des isolats de la Colombie-Britannique (8 S. Kentucky, 2 S. Heidelberg, 1 S. Typhimurium et 1 Salmonella ssp. I 4,[5],12:-:-), 6 % (4/64) des isolats de la Saskatchewan (1 S. Heidelberg, 1 S. Infantis, 1 S. Typhimurium et 1 Salmonella ssp. I 4,[5],12:-:-), 10 % (14/139) des isolats de l'Ontario (3 S. Heidelberg, 3 S. Kentucky, 3 S. Kiambu, 1 S. Agona, 1 S. Thompson, 1 S. Typhimurium var. 5-, 1 Salmonella ssp. I 8,20:-:z6 et 1 Salmonella ssp. I Rough:r:1,2), 14 % (17/120) des isolats du Québec (6 S. Heidelberg, 6 S. Kentucky, 3 S. Kiambu, 1 S. Infantis, et 1 S. Typhimurium var. 5-) et 2 des 12 isolates de la région des Maritimes (1 S. Heidelberg et 1 Salmonella ssp. I 4,[5],12:-:-). Parmi les isolats des 5 provinces/région, les profils de résistance les plus communs étaient STR-TET (21 %, 81/382), A2C-AMP-CRO (7 %, 25/382) et TET (4 %, 17/382). Les profils de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens parmi les isolats étaient A2C-AMP-CRO-SSS-TET-SXT et A2C-AMP-CRO-GEN-STR-SSS, lesquels ont respectivement été observés parmi 1 isolat de l'Ontario (S. Kiambu) et 1 isolat de la région des Maritimes ( Salmonella ssp. I 4,[5],12:-:-).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 13. Le pourcentage d'isolats de la Saskatchewan présentant de la résistance à l'acide nalidixique était significativement moins élevé en 2008 (0 %) qu'en 2005 (10 %, 2/21). Les pourcentages d'isolats de l'Ontario résistants à l'ampicilline et au ceftiofur étaient significativement moins élevés en 2008 (14 % [19/139] et 10 %, respectivement) qu'en 2004¹⁷ (51 % [28/55] et 45 % [25/55], respectivement). Les pourcentages d'isolats de l'Ontario présentant de la résistance à la streptomycine et à la tétracycline étaient significativement plus élevés en 2008 (32 % [45/139] et 36 % [50/139], respectivement) qu'en 2003 (4 % [1/26] et 0 % [0/26], respectivement). Les pourcentages d'isolats du Québec résistants à l'ampicilline et au ceftiofur étaient significativement moins élevés en 2008 (21 % [25/120] et 15 %, respectivement) qu'en 2004 (47 % [28/60] et 37 % [22/60], respectivement). Dans les autres provinces et régions, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En Saskatchewan, le pourcentage d'isolats de Salmonella provenant de viande poulet vendue au détail qui présentait de la résistance à l'acide nalidixique était significativement moins élevé en 2008 (0 %, 0/64) qu'en 2005 (10 %, 2/21). Les pourcentages d'isolats de l'Ontario résistants à la streptomycine et à la tétracycline étaient significativement plus élevés en 2008 (32 % [45/139] et 36 % [50/139], respectivement) qu'en 2003 (4 % [1/26] et 0 % [0/26], respectivement). Les pourcentages d'isolats du Québec résistants à l'ampicilline et au ceftiofur étaient significativement moins élevés en 2008 (21 % [25/120] et 15 % [18/120], respectivement) qu'en 2004 (47 % [28/60] et 37 % [22/60], respectivement).

Tableau 12. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de viande de poulet, par province ou région et sérotype; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Colombie-Britannique
Enteritidis	14 (29,8)	14	0	0	0
Kentucky	13 (27,7)	1	4	8	0
Hadar	3 (6,4)	1	2	0	0
Heidelberg	3 (6,4)	0	1	2	0
Mbandaka	3 (6,4)	3	0	0	0
Typhimurium	3 (6,4)	2	0	1	0
I 4,[5],12:i:-	2 (4,3)	1	0	1	0
Senftenberg	2 (4,3)	2	0	0	0
Meleagridis	1 (2,1)	1	0	0	0
Rissen	1 (2,1)	1	0	0	0
Schwarzengrund	1 (2,1)	1	0	0	0
Thompson	1 (2,1)	1	0	0	0
Total	47 (100)	28	7	12	0
Saskatchewan
Kentucky	15 (23,4)	3	12	0	0
Enteritidis	14 (21,9)	14	0	0	0
Heidelberg	12 (18,8)	7	4	1	0
I 4,[5],12:i:-	7 (10,9)	6	0	1	0
Hadar	6 (9,4)	0	6	0	0
Infantis	3 (4,7)	2	0	1	0
Mbandaka	2 (3,1)	1	1	0	0
Sérotypes moins communs	5 (7,8)	3	1	1	0
Total	64 (100)	36	24	4	0
Ontario
Kentucky	46 (33,1)	10	33	3	0
Enteritidis	22 (15,8)	22	0	0	0
Heidelberg	21 (15,1)	17	1	3	0
Hadar	11 (7,9)	0	11	0	0
Kiambu	7 (5,0)	2	2	3	0
Thompson	7 (5,0)	6	0	1	0
Typhimurium	6 (4,3)	6	0	0	0
Schwarzengrund	4 (2,9)	2	2	0	0
Infantis	3 (2,2)	3	0	0	0
Sérotypes moins communs	12 (8,6)	6	2	4	0
Total	139 (100)	74	51	14	0
Québec
Kentucky	44 (36,7)	6	32	6	0
Heidelberg	38 (31,7)	22	10	6	0
Enteritidis	11 (9,2)	11	0	0	0
Thompson	6 (5,0)	6	0	0	0
Kiambu	5 (4,2)	1	1	3	0
I 6,7:-:1,5	3 (2,5)	3	0	0	0
Schwarzengrund	3 (2,5)	1	2	0	0
Sérotypes moins communs	10 (8,3)	5	3	2	0
Total	120 (100)	55	48	17	0
Maritimes
Heidelberg	4 (33,3)	3	0	1	0
Thompson	3 (25,0)	3	0	0	0
Kentucky	2 (16,7)	1	1	0	0
Enteritidis	1 (8,3)	1	0	0	0
I 4,[5],12:-:-	1 (8,3)	0	0	1	0
I 6,7:k:-	1 (8,3)	1	0	0	0
Total	12 (100)	9	1	2	0
Total	382 (100)	202	131	49	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ». La région des Maritimes inclut le Nouveau-Brunswick, la Nouvelle-Écosse et l'Île-du-Prince-Édouard.

Figure 12. - Cliquez pour agrandir

Figure 12. - Texte équivalent

Figure 12. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella provenant deviande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Maritimes (n = 12)			Québec (n = 120)			Ontario (n = 139)			Saskatchewan (n = 64)			Colombie-Britannique (n = 47)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	8%	0%	38%	35%	27%	44%	36%	28%	45%	36%	24%	49%	30%	17%	45%
	Sulfisoxazole	8%	0%	38%	4%	1%	9%	2%	0%	6%	5%	1%	13%	6%	1%	18%
	Chloramphénicol	0%	0%	22%	0%	0%	2%	1%	0%	4%	2%	0%	8%	2%	0%	11%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0%	0%	22%	0%	0%	2%	1%	0%	4%	0%	0%	5%	0%	0%	6%
	Streptomycine	17%	2%	48%	31%	23%	40%	32%	25%	41%	36%	24%	49%	30%	17%	45%
	Acide nalidixique	0%	0%	22%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	5%	0%	0%	6%
	Kanamycine	0%	0%	22%	1%	0%	5%	0%	0%	2%	3%	0%	11%	0%	0%	6%
	Gentamicine	8%	0%	38%	2%	0%	6%	1%	0%	4%	0%	0%	5%	0%	0%	6%
	Céfoxitine	17%	2%	48%	14%	8%	22%	9%	5%	15%	5%	1%	13%	21%	11%	36%
	Ampicilline	17%	2%	48%	21%	14%	29%	14%	8%	21%	9%	4%	19%	28%	16%	43%
	Amikacine	0%	0%	22%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	5%	0%	0%	6%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	22%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	5%	0%	0%	6%
	Ceftriaxone	17%	2%	48%	15%	9%	23%	10%	6%	16%	5%	1%	13%	23%	12%	38%
	Ceftiofur	17%	2%	48%	15%	9%	23%	10%	6%	16%	5%	1%	13%	23%	12%	38%
	Amoxicilline-acide clavulanique	17%	2%	48%	15%	9%	23%	9%	5%	15%	5%	1%	13%	21%	11%	36%

Figure 13. - Cliquez pour agrandir

Figure 13. - Texte équivalent

Figure 13. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Salmonella provenant de viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003- 2008.

	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	18	47	21	25	43	64	26	55	26	36	172	139	28	60	26	33	113	120	12
Antimicrobien
Ampicilline	39%	28%	5%	12%	23%	9%	19%	51%	19%	17%	16%	14%	61%	47%	23%	15%	16%	21%	17%
Ceftiofur	33%	23%	0%	4%	2%	5%	12%	45%	15%	14%	11%	10%	50%	37%	15%	9%	9%	15%	17%
Gentamicine	0%	0%	0%	0%	0%	0%	4%	0%	0%	0%	2%	1%	4%	3%	0%	0%	3%	2%	8%
Acide nalidixique	0%	0%	10%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%
Streptomycine	11%	30%	43%	20%	37%	36%	4%	4%	12%	25%	31%	32%	21%	22%	8%	39%	37%	31%	17%
Tétracycline	17%	30%	52%	32%	35%	36%	0%	4%	8%	25%	34%	36%	21%	22%	8%	39%	37%	35%	8%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0%	0%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	3%	1%	1%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	0%

Surveillance des isolats cliniques animaux^{Note de bas de page 18} (n = 209)

Note : Il est possible que les poulets ayant fait l'objet de l'échantillonnage aient été des poules pondeuses ou des poulets à griller. Il se peut aussi qu'une certaine proportion des isolats provenait d'échantillons environnementaux.

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 13 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient les suivants : Enteritidis (47 %, 99/209), Kentucky (18 %, 38/209) et Heidelberg (15 %, 31/209). Ces 3 sérotypes représentaient 80 % (168/209) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.14 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été observées dans 16 % (33/209, 34/209, et 34/209, respectivement) des isolats de Salmonella. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à l'acide nalidixique ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole, et aucun ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 13 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été détectée dans 32 % (66/209) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 17 % (35/209) des isolats (incluant 19 S. Kentucky et 6 S. Heidelberg). Les profils de résistance les plus communs étaient A2C-AMP-CRO (7 %, 15/209), A2C-AMP-CRO-STR-TET (5 %, 10/209) et TET (5 %, 10/209). Quinze isolats présentaient le profil de résistance A2C-AMP-CRO, incluant les sérotypes Kentucky (7/15) et Heidelberg (5/15). Tous les isolats présentant le profil de résistance A2C-AMP-CRO-STR-TET étaient des isolats de S. Kentucky. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN (1 S. Mbandaka).

En 2008, de la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 16 % (33/209, 34/209 et 34/209, respectivement) des isolats cliniques de Salmonella provenant de poulets. Tous les isolats présentant le profil de résistance A2C-AMP-CRO-STR-TET (5 %, 10/209) étaient des isolats de S. Kentucky. Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN (1 S. Mbandaka).

Tableau 13. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de poulets, par sérotype; Surveillance des isolats cliniques animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Enteritidis	99 (47,4)	99	0	0	0
Kentucky	38 (18,2)	4	15	19	0
Heidelberg	31 (14,8)	20	5	6	0
Typhimurium	10 (4,8)	5	2	3	0
I 4,[5],12:i:-	5 (2,4)	3	0	2	0
Sérotypes moins communs	26 (12,4)	12	9	1	4
Total	209 (100)	143	31	31	4
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Escherichia coli

Surveillance en abattoir
(n = 170)

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 99 % (170/171) des échantillons caecaux de poulet prélevés en abattoir (tableau C.5, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 14 et au tableau B.15 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur et à la ceftriaxone ont été respectivement observées dans 26 % (45/170), 20 % (34/170) et 23 % (39/170) des isolats d'E. coli. Trois pour cent (5/170) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine. De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 4 % (6/170) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 77 % (131/170) des isolats d'E. coli. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 31 % (52/170) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (6 %, 11/170) et A2C-AMP-CRO (6 %, 11/170) ainsi que STR-TET (5 %, 9/170). De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à la ceftriaxone ont été observées dans 1 % (1/170) des isolats. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACSSuT-A2C-CRO-GEN-NAL.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 15. Le pourcentage d'isolats d'E. coli résistants à la tétracycline était significativement moins élevé en 2008 (51 %, 86/170) qu'en 2003 (69 %, 106/153). Par contre, le pourcentage d'isolats résistants au triméthoprime-sulfaméthoxazole était significativement plus élevé en 2008 (12 %, 20/170) qu'en 2007 (4 %, 8/180). Aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, 23 % (39/170) des isolats d'Escherichia coli détectés dans des échantillons de poulets en abattoir étaient résistants à la ceftriaxone. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 3 % (5/170) des isolats. Parmi ces isolats, 1 % (1/170) présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à la ceftriaxone. De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 4 % (6/170) des isolats.

Figure 14. - Cliquez pour agrandir

Figure 14. - Texte équivalent

Figure 14. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde poulets; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Poulets (n = 170)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	51%	43%	58%
	Sulfisoxazole	40%	33%	48%
	Chloramphénicol	3%	1%	7%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	12%	7%	18%
	Streptomycine	44%	36%	51%
	Acide nalidixique	4%	1%	8%
	Kanamycine	20%	14%	27%
	Gentamicine	8%	4%	13%
	Céfoxitine	26%	19%	33%
	Ampicilline	36%	29%	44%
	Amikacine	0%	0%	2%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	2%
	Ceftriaxone	23%	17%	30%
	Ceftiofur	20%	14%	27%
	Amoxicilline-acide clavulanique	26%	20%	34%

Figure 15. - Cliquez pour agrandir

Figure 15. - Texte équivalent

Figure 15. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de poulets; Surveillance en abattoir, 2003-2008.

Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	153	130	220	167	180	170
Antimicrobien
Ampicilline	41%	43%	38%	43%	39%	36%
Ceftiofur	17%	25%	20%	21%	26%	20%
Gentamicine	15%	12%	11%	8%	11%	8%
Acide nalidixique	4%	3%	5%	4%	2%	4%
Streptomycine	52%	53%	43%	34%	40%	44%
Tétracycline	69%	55%	58%	51%	57%	51%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	8%	12%	9%	10%	4%	12%

Surveillance de la viande vendue au détail
(n = 479)
(Colombie-Britannique [n = 70], Saskatchewan [n = 91], Ontario [n = 150], Québec [n = 131], Région des Maritimes [n = 37])

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 91 % (480/526) des échantillons de viande de poulet vendue au détail (tableau C.5, annexe C). Les pourcentages d'échantillons de viande de poulet dans lesquels on a détecté des isolats pour chacune des provinces/région se répartissent comme suit : Colombie-Britannique, 90 % (70/78); Saskatchewan, 99 % (91/92); Ontario, 96 % (150/156); Québec, 91 % (131/144) et Maritimes, 68 % (38/56). Parmi les isolats détectés, 1 isolat de la région des Maritimes n'a pas pu être remis en culture pour les tests de sensibilité aux antimicrobiens; le nombre d'isolats testés provenant de cette région était donc de 37.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 16 et au tableau B.16 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été observée dans 53 % (37/70) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 21 % (19/91) des isolats de la Saskatchewan, 27 % (41/150) des isolats de l'Ontario, 22 % (29/131) des isolats du Québec et 27 % (10/37) des isolats des Maritimes. De la résistance au ceftiofur a été observée dans 49 % (34/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 20 % (18/91) des isolats de la Saskatchewan, 24 % (36/150) des isolats de l'Ontario, 18 % (24/131) des isolats du Québec et 19 % (7/37) des isolats des Maritimes. De la résistance à la ceftriaxone a été observée dans 54 % (38/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 21 % (19/91) des isolats de la Saskatchewan, 28 % (42/150) des isolats de l'Ontario, 21 % (28/131) des isolats du Québec et 27 % (10/37) des isolats de la région des Maritimes. De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 1 % (1/131) des isolats du Québec. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 4 % (3/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 7 % (6/91) des isolats de la Saskatchewan, 4 % (6/150) des isolats de l'Ontario, et 8 % (11/131) des isolats du Québec. De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 4 % (3/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 7 % (6/91) des isolats de la Saskatchewan, 4 % (6/150) des isolats de l'Ontario et 8 % (11/131) des isolats du Québec.

Les pourcentages d'isolats présentant de la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique et à la ceftriaxone étaient significativement plus élevés en Colombie-Britannique qu'en Saskatchewan, en Ontario et au Québec. Les pourcentages d'isolats de la Colombie-Britannique résistants au ceftiofur et à la céfoxitine étaient significativement plus élevés que pour les 4 autres provinces/région. Le pourcentage d'isolats de la Colombie-Britannique présentant de la résistance à l'ampicilline était aussi significativement plus élevé que pour les 4 autres provinces/région. Par ailleurs, le pourcentage d'isolats résistants à la gentamicine au Québec était significativement plus élevé qu'en Colombie-Britannique. Les pourcentages d'isolats résistants au triméthoprime-sulfaméthoxazole et au sulfisoxazole étaient significativement plus élevés au Québec qu'en Saskatchewan. Aucune différence significative entre les provinces et régions n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants à tout autre antimicrobien testé. Aucun des isolats dans aucune province ou région n'était résistant à l'amikacine, et aucun isolat de la région des Maritimes ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 77 % (54/70) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 70 % (64/91) des isolats de la Saskatchewan, 69 % (103/150) des isolats de l'Ontario, 70 % (92/131) des isolats du Québec et 62 % (23/37) des isolats de la région des Maritimes. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 51 % (36/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 22 % (20/91) des isolats de la Saskatchewan, 30 % (45/150) des isolats de l'Ontario, 27 % (36/131) des isolats du Québec et 27 % (10/37) des isolats de la région des Maritimes. Parmi les isolats des 5 provinces/Maritime, les profils de résistance les plus communs étaient A2C-AMP-CRO (10 %, 46/479), TET (6 %, 28/479), GEN-STR-SSS (3 %, 14/479) et A2C-AMP-CRO-TET (3 %, 14/479). De la résistance à la ceftriaxone et de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine ont été observées dans 2 % (11/480) des isolats de toute origine, à l'exception de la Saskatchewan et de la région des Maritimes. Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN-NAL (1 isolat de la Colombie-Britannique).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 17. Les pourcentages d'isolats d'E. coli de la Saskatchewan résistants à l'ampicilline et au ceftiofur étaient significativement plus élevés en 2008 (40 % [37/91] et 20 %, respectivement) qu'en 2005 (24 % [20/82] et 4 % [3/82]). Le pourcentage d'isolats de la Saskatchewan résistants au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (20 %) qu'en 2007 (13 %, 10/75) et 2005 (4 %, 3/82). Les pourcentages d'isolats du Québec résistants à l'ampicilline et au ceftiofur étaient significativement moins élevés en 2008 (33 % [43/131] et 18 %, respectivement) qu'en 2004 (52 % [82/158] et 34 % [54/158], respectivement). Le pourcentage d'isolats du Québec résistants à l'acide nalidixique était significativement plus élevé en 2008 (8 %) qu'en 2003 (0 %, 0/111). Le pourcentage d'isolats du Québec résistants au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (18 %) qu'en 2006 (6 %, 8/135). Dans les autres provinces et dans la région des Maritimes, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, les pourcentages d'isolats d'Escherichia coli provenant de viande de poulet vendue au détail qui présentaient de la résistance à la ceftriaxone étaient de 54 % (38/70) en Colombie-Britannique, 21 % (19/91) en Saskatchewan, 28 % (42/150) en Ontario, 21 % (28/131) au Québec et 27 % (10/37) dans la région des Maritimes. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 4 % (3/70) des isolats de la Colombie-Britannique, 7 % (6/91) des isolats de la Saskatchewan, 4 % (6/150) des isolats de l'Ontario, et 9 % (12/131) des isolats du Québec. Le pourcentage d'isolats de la Saskatchewan résistants au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (20 %, 18/91) qu'en 2007 (13 %, 10/75) et 2005 (4 %, 3/82). Le pourcentage d'isolats du Québec résistants au ceftiofur était significativement moins élevé en 2008 (18 %, 24/131) qu'en 2004 (34 %, 54/158), mais il était significativement plus élevé en 2008 (18 %) qu'en 2006 (6 %, 8/135). De la résistance à la ceftriaxone et de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine ont été détectées dans 2 % (11/480) des isolats; ces isolats étaient de toute origine, à l'exception de la Saskatchewan et de la région des Maritimes.

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Figure 16. - texte équivalent

Figure 16. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Maritimes (n = 37)			Québec (n = 131)			Ontario (n = 150)			Saskatchewan (n = 91)			Colombie-Britannique (n = 70)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	41%	25%	58%	45%	36%	54%	40%	32%	48%	48%	38%	59%	46%	34%	58%
	Sulfisoxazole	30%	16%	47%	45%	36%	54%	31%	23%	39%	20%	12%	29%	27%	17%	39%
	Chloramphénicol	8%	2%	22%	5%	2%	10%	5%	2%	9%	3%	1%	9%	6%	2%	14%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	16%	6%	32%	15%	10%	23%	7%	3%	12%	3%	1%	9%	6%	2%	14%
	Streptomycine	30%	16%	47%	39%	31%	48%	33%	26%	41%	29%	20%	39%	31%	21%	44%
	Acide nalidixique	0%	0%	8%	8%	4%	15%	4%	1%	9%	7%	2%	14%	4%	1%	12%
	Kanamycine	8%	2%	22%	6%	3%	12%	9%	5%	15%	12%	6%	21%	7%	2%	16%
	Gentamicine	5%	1%	18%	21%	14%	29%	12%	7%	18%	8%	3%	15%	6%	2%	14%
	Céfoxitine	24%	12%	41%	20%	13%	28%	28%	21%	36%	21%	13%	31%	54%	42%	66%
	Ampicilline	30%	16%	47%	33%	25%	42%	39%	31%	48%	41%	30%	51%	63%	50%	74%
	Amikacine	0%	0%	8%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	3%	0%	0%	4%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	8%	1%	0%	4%	0%	0%	2%	0%	0%	3%	0%	0%	4%
	Ceftriaxone	27%	14%	44%	21%	15%	29%	28%	21%	36%	21%	13%	31%	54%	42%	66%
	Ceftiofur	19%	8%	35%	18%	12%	26%	24%	17%	32%	20%	12%	29%	49%	36%	61%
	Amoxicilline-acide clavulanique	27%	14%	44%	22%	15%	30%	27%	20%	35%	21%	13%	31%	53%	41%	65%

Figure 17. - Cliquez pour agrandir

Figure 17. - Texte équivalent

Figure 17. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008.

	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	42	70	81	85	75	91	136	150	145	152	157	150	111	158	142	135	128	131	37
Antimicrobien
Ampicilline	60%	63%	25%	31%	35%	41%	35%	39%	33%	42%	39%	39%	50%	52%	49%	35%	34%	33%	30%
Ceftiofur	29%	49%	4%	6%	13%	20%	18%	21%	17%	22%	22%	24%	32%	34%	25%	6%	13%	18%	19%
Gentamicine	0%	6%	6%	6%	11%	8%	7%	5%	7%	6%	13%	12%	17%	10%	11%	21%	24%	21%	5%
Acide nalidixique	5%	4%	5%	4%	5%	7%	1%	1%	1%	3%	3%	4%	0%	5%	2%	1%	3%	8%	0%
Streptomycine	21%	31%	26%	33%	32%	29%	32%	33%	26%	26%	31%	33%	48%	46%	36%	43%	37%	39%	30%
Tétracycline	45%	46%	48%	47%	44%	48%	51%	52%	46%	41%	48%	40%	57%	53%	43%	49%	48%	45%	41%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	17%	6%	1%	1%	4%	3%	4%	4%	3%	4%	4%	7%	12%	11%	10%	6%	12%	15%	16%

Campylobacter

Surveillance de la viande vendue au détail
(n = 264)
(Colombie-Britannique [n = 50], Saskatchewan [n = 40], Ontario [n = 120], Québec [n = 54])1

Isolement bactérien : Des isolats de Campylobacter ont été détectés dans 29 % (266/904) des échantillons de viande de poulet vendue au détail (tableau C.5, annexe C). Quatre-vingt-neuf pour cent (235/265) d'entre eux étaient des isolats de C. jejuni et 11 % (30/265) des isolats de C. coli. Les pourcentages d'échantillons de viande de poulet dans lesquels on a détecté des isolats se répartissaient comme suit pour chacune des provinces : Colombie-Britannique, 34 % (50/145); Saskatchewan, 25 % (41/161); Ontario, 39 % (121/311); et Québec, 19 % (54/287). Parmi ces isolats, il a été impossible de remettre en culture 1 isolat de la Saskatchewan et 1 de l'Ontario, ce qui a réduit le nombre d'isolats pouvant être utilisés pour les tests de sensibilité aux antimicrobiens à 40 pour la Saskatchewan et à 120 pour l'Ontario.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés aux figures 18 et 19 et au tableau B.17 (annexe B). De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 8 % (4/50) des isolats de Campylobacter provenant de la Colombie-Britannique, 10 % (4/40) des isolats provenant de la Saskatchewan et 4 % (5/120) des isolats de l'Ontario. Ces isolats de Campylobacter résistants à la ciprofloxacine se répartissaient comme suit selon les espèces : C. jejuni, 5 % (11/235) et C. coli, 7 % (2/30). De la résistance à la télithromycine a été observée dans 4 % (5/120) des isolats de l'Ontario et 2 % (1/54) des isolats du Québec. Ces isolats de Campylobacter résistants à la télithromycine se répartissaient comme suit selon les espèces : C. jejuni, 2 % (4/234) et C. coli, 7 % (2/30). Aucune différence significative n'a été observée entre les provinces pour ce qui est des pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens testés. Aucun des isolats était non-sensible au florfénicol. Aucun des isolats du Québec n'était résistant à la ciprofloxacine. De plus, aucun des isolats de la Colombie-Britannique et de la Saskatchewan n'était résistant à la télithromycine, à l'azithromycine, à la clindamycine, à l'érythromycine ou à la gentamicine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 14. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 36 % (18/50) des isolats de Campylobacter de la Colombie-Britannique, 45 % (18/40) des isolats de la Saskatchewan, 53 % (63/120) des isolats de l'Ontario et 56 % (30/54) des isolats du Québec. De la résistance à 3 antimicrobiens ou plus a été observée dans 4 % (2/50) des isolats de la Colombie-Britannique, 10 % (4/40) des isolats de la Saskatchewan, 10 % (12/120) des isolats de l'Ontario et 11 % (6/54) des isolats du Québec. Parmi les isolats des 4 provinces, les profils de résistance les plus communs étaient TET (38 %, 101/264), AZM-ERY-TET (3 %, 9/264) et CIP-NAL-TET (3 %, 9/264). Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AZM-CIP-CLI-ERY-NAL-TEL-TET (1 isolat de C. jejuni de l'Ontario).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 20. Le pourcentage d'isolats de Campylobacter provenant de l'Ontario qui étaient résistants à l'azithromycine était significativement plus élevé en 2008 (8 %, 10/120) qu'en 2007 (2 %, 2/117). Aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés, pour les autres provinces.

En 2008, les pourcentages d'isolats de viande de poulet résistants à la ciprofloxacine étaient de 8 % (4/50) pour la Colombie-Britannique, 10 % (4/40) pour la Saskatchewan et 4 % (5/120) pour l'Ontario. Parmi les isolats des 4 provinces, les profils de résistance les plus communs étaient TET (38 %, 101/264), AZM-ERY-TET (3 %, 9/264) et CIP-NAL-TET (3 %, 9/264). Le pourcentage d'isolats de Campylobacter de l'Ontario résistants à l'azithromycine était significativement plus élevé en 2008 (8 %, 10/120) qu'en 2007 (2 %, 2/117). Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AZM-CIP-CLI-ERY-NAL-TEL-TET (1 isolat de C. jejuni de l'Ontario).

Figure 18. - Cliquez pour agrandir

Figure 18. - Texte équivalent

Figure 18. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Campylobacter provenantde viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Maritimes (n = 2)			Québec (n = 54)			Ontario (n = 120)			Saskatchewan (n = 40)			Colombie-Britannique (n = 50)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	50%	1%	99%	56%	41%	69%	49%	40%	58%	45%	29%	62%	32%	20%	47%
	Florfénicol	0%	0%	78%	0%	0%	5%	0%	0%	2%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
II	Acide nalidixique	0%	0%	78%	0%	0%	5%	4%	1%	9%	10%	3%	24%	8%	2%	19%
	Gentamicine	0%	0%	78%	0%	0%	5%	1%	0%	5%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
	Érythromycine	0%	0%	78%	11%	4%	23%	8%	4%	15%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
	Clindamycine	0%	0%	78%	2%	0%	10%	4%	1%	9%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
	Azithromycine	0%	0%	78%	11%	4%	23%	8%	4%	15%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
I	Télithromycine	0%	0%	78%	2%	0%	10%	4%	1%	9%	0%	0%	7%	0%	0%	6%
	Ciprofloxacine	0%	0%	78%	0%	0%	5%	4%	1%	9%	10%	3%	24%	8%	2%	19%

Figure 19. - Cliquez pour agrandir

Figure 19. - Texte équivalent

Figure 19. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats Campylobacter provenant deviande de poulet, par espèce de Campylobacter; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Campylobacter jejuni (n = 234)			Campylobacter coli (n = 30)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	48%	42%	55%	33%	17%	53%
	Florfénicol	0%	0%	1%	0%	0%	10%
II	Acide nalidixique	5%	2%	8%	7%	1%	22%
	Gentamicine	0%	0%	1%	3%	0%	17%
	Érythromycine	6%	3%	9%	10%	2%	27%
	Clindamycine	2%	0%	4%	7%	1%	22%
	Azithromycine	6%	3%	9%	10%	2%	27%
I	Télithromycine	2%	0%	4%	7%	1%	22%
	Ciprofloxacine	5%	2%	8%	7%	1%	22%

Tableau 14. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Campylobacter provenant de viande poulet, par province et par espèce de Campylobacter; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Espèce	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 2	3 - 4	5 - 9
		Nombre d'isolats
Colombie-Britannique
C. jejuni	44 (88,0)	28	15	1	0
C. coli	6 (12,0)	4	1	1	0
Total	50 (100)	32	16	2	0
Saskatchewan
C. jejuni	37 (92,5)	19	14	4	0
C. coli	3 (7,5)	3	0	0	0
Total	40 (100)	22	14	4	0
Ontario
C. jejuni	104 (86,7)	49	46	8	1
C. coli	16 (13,3)	8	5	1	2
Total	120 (100)	57	51	9	3
Québec
C. jejuni	49 (90,7)	20	23	5	1
C. coli	5 (9,3)	4	1	0	0
Total	54 (100)	24	24	5	1
Total	264 (100)	135	105	20	4

Figure 20. - Cliquez pour agrandir

Figure 20. - Texte équivalent

Figure 20. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Campylobacter provenant de viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008.

	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	28	50	52	51	49	40	78	140	120	105	117	120	94	158	103	100	59	54	2
Antimicrobien
Ciprofloxacine	4%	8%	6%	2%	6%	10%	4%	2%	3%	3%	1%	4%	3%	3%	2%	2%	14%	0%	0%
Azithromycine	0%	0%	0%	2%	2%	0%	9%	8%	5%	4%	2%	8%	22%	16%	13%	9%	10%	11%	0%
Gentamicine	0%	0%	0%	0%	0%	0%	1%	0%	0%	0%	0%	1%	2%	0%	0%	0%	0%	0%	0%
Tétracycline	39%	32%	54%	35%	39%	45%	58%	47%	61%	55%	57%	49%	70%	79%	70%	66%	54%	56%	50%

Enterococcus

Surveillance de la viande vendue au détail
(n = 464)
(Colombie-Britannique [n = 77], Saskatchewan [n = 91], Ontario [n = 154], Québec [n = 142])²⁰

Isolement bactérien : Des isolats d'Enterococcus ont été détectés dans 99,6 % (468/470) des échantillons de viande de poulet vendue au détail (tableau C.5, annexe C). Quatre isolats n'ont pas pu être mis en culture après avoir été congelés, ce qui a réduit à 464 le nombre d'isolats utilisés pour les tests de sensibilité aux antimicrobiens. Quatre-vingt-quatorze pour cent (436/464) des isolats restants étaient des isolats d'E. faecalis, 3 % (16/464) d'autres Enterococcus spp. et 3 % (12/464) étaient des E. faecium. Les pourcentages d'échantillons de viande de poulet dans lesquels des isolats d'Enterococcus ont été détectés dans chacune des provinces se répartissent comme suit : Colombie-Britannique, 100 % (78/78); Saskatchewan, 100 % (92/92); Ontario, 99 % (154/156) et Québec, 100 % (144/144).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés aux figures 21 et 22 et au tableau B.18 (annexe B). De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 1 % (1/91) des isolats d'Enterococcus de la Saskatchewan, 3 % (4/154) des isolats de l'Ontario et 1 % (1/142) des isolats du Québec. Trois des 12 isolats d'E. faecium et 1 % (3/436) des isolats d'E. faecalis étaient résistants à la ciprofloxacine. De la résistance à la tigécycline a été observée dans 1 % (1/142) des isolats d'E. faecalis du Québec. Aucune différence significative n'a été observée entre les provinces en ce qui a trait aux pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens testés. Aucune résistance à la ciprofloxacine n'a été observée parmi les isolats de la Colombie-Britannique. Aucun des isolats dans aucune province n'était résistant à la linézolide ou à la vancomycine ou étaient non-sensibles à la daptomycine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 15. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 96 % (74/77) des isolats d'Enterococcus de la Colombie-Britannique, 88 % (85/91) des isolats de la Saskatchewan, 92 % (142/154) des isolats de l'Ontario, et 89 % (127/142) des isolats du Québec. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 18 % (14/77) des isolats de la Colombie-Britannique, 22 % (20/91) des isolats de la Saskatchewan, 16 % (25/154) des isolats de l'Ontario et 25 % (36/142) des isolats du Québec. Parmi les isolats des 4 provinces, les profils de résistance les plus communs étaient TET (27 %, 127/464), ERY-TET-TYL (19 %, 89/464) et ERY-STR-TET-TYL (11 %, 50/464). Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens parmi les isolats était ERY-LIN-NIT-PEN-STR-QDA-TET-TYL (1 isolat d'E. faecium provenant de la Saskatchewan).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 23. Les pourcentages d'isolats d'Enterococcus provenant de la Saskatchewan qui étaient résistants à l'érythromycine, à la streptomycine et à la tylosine étaient significativement plus élevés en 2008 (67 % [61/91], 40 % [36/91] et 67 % [61/91], respectivement) qu'en 2005 (39 % [31/80], 20 % [16/80] et 40 % [32/80], respectivement). Les pourcentages d'isolats de la Saskatchewan résistants à l'érythromycine et à la tylosine étaient significativement plus élevés en 2008 (67 % dans chaque cas) qu'en 2007 (46 % [35/76] dans chaque cas). Le pourcentage d'isolats de l'Ontario présentant de la résistance à la tylosine était significativement plus élevé en 2008 (51 %, 78/154) qu'en 2007 (39 %, 63/161). Pour les autres provinces, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance à la ciprofloxacine a été observée parmi les isolats d'Enterococcus provenant d'échantillons de viande de poulet vendue au détail, provenant de la Saskatchewan (1 %, 1/91), de l'Ontario (3 %, 4/154) et du Québec (1 %, 1/142). Les pourcentages d'isolats de la Saskatchewan présentant de la résistance à l'érythromycine, à la streptomycine et à la tylosine étaient significativement plus élevés en 2008 (67 % [61/91], 40 % [36/91] et 67 % [61/91], respectivement) qu'en 2005 (39 % [31/80], 20 % [16/80] et 40 % [32/80], respectivement). Les pourcentages d'isolats résistants à l'érythromycine et à la tylosine étaient significativement plus élevés en 2008 (67 % dans chaque cas) qu'en 2007 (46 % [35/76] dans chaque cas). Le pourcentage d'isolats de l'Ontario résistants à la tylosine était significativement plus élevé en 2008 (51 %, 78/154) qu'en 2007 (39 %, 63/161).

Figure 21. - Cliquez pour agrandir

Figure 21. - Texte équivalent

Figure 21. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Enterococcus provenant deviande de poulet, par province; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Colombie-Britannique (n = 77, QDA et LIN n = 7)			Saskatchewan (n = 91, QDA et LIN n = 6)			Ontario (n = 154, QDA et LIN n = 6)			Québec (n = 142, QDA et LIN n = 9)			Maritimes (n = 18, QDA et LIN n = 1)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV	Flavomycine	4%	1%	11%	2%	0%	8%	1%	0%	5%	4%	1%	8%	6%	0%	27%
III	Tétracycline	75%	64%	84%	86%	77%	92%	88%	81%	92%	87%	80%	92%	78%	52%	94%
	Nitrofurantoïne	4%	1%	11%	4%	1%	11%	1%	0%	5%	3%	1%	7%	0%	0%	15%
	Chloramphénicol	0%	0%	4%	0%	0%	3%	1%	0%	4%	6%	2%	11%	0%	0%	15%
II	Tylosine	49%	38%	61%	67%	56%	77%	51%	42%	59%	56%	48%	65%	39%	17%	64%
	Streptomycine	39%	28%	51%	40%	29%	50%	27%	20%	35%	37%	29%	46%	22%	6%	48%
	Quinupristine-dalfopristine	43%	10%	82%	83%	36%	100%	50%	12%	88%	89%	52%	100%	100%	5%	100%
	Pénicilline	3%	0%	9%	2%	0%	8%	1%	0%	5%	1%	0%	5%	0%	0%	15%
	Lincomycine	100%	65%	100%	100%	61%	100%	100%	61%	100%	100%	72%	100%	100%	5%	100%
	Kanamycine	19%	11%	30%	23%	15%	33%	15%	10%	22%	20%	14%	28%	28%	10%	53%
	Gentamicine	4%	1%	11%	3%	1%	9%	5%	2%	9%	10%	5%	16%	17%	4%	41%
	Érythromycine	51%	39%	62%	67%	56%	77%	50%	42%	58%	57%	48%	65%	39%	17%	64%
I	Vancomycine	0%	0%	4%	0%	0%	3%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	15%
	Tigécycline	0%	0%	4%	0%	0%	3%	0%	0%	2%	1%	0%	4%	0%	0%	15%
	Linézolide	0%	0%	4%	0%	0%	3%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	15%
	Daptomycine	0%	0%	4%	0%	0%	3%	0%	0%	2%	0%	0%	2%	0%	0%	15%
	Ciprofloxacine	0%	0%	4%	1%	0%	6%	3%	1%	7%	1%	0%	4%	0%	0%	15%

Figure 22. - Cliquez pour agrandir

Figure 22. - Texte équivalent

Figure 22. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Enterococcus provenant deviande de poulet, par espèce d'Enterococcus; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Enterococcus faecalis (n = 436)			Enterococcus faecium (n = 12)			Enterococcus spp. (n = 16)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV	Flavomycine	0%	0%	2%	25%	5%	57%	44%	20%	70%
III	Tétracycline	86%	82%	89%	83%	52%	98%	69%	41%	89%
	Nitrofurantoïne	0%	0%	1%	42%	15%	72%	50%	25%	75%
	Chloramphénicol	2%	1%	4%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
II	Tylosine	56%	51%	60%	75%	43%	95%	38%	15%	65%
	Streptomycine	36%	31%	41%	17%	2%	48%	13%	2%	38%
	Quinupristine-dalfopristine	0%	0%	0%	75%	43%	95%	63%	35%	85%
	Pénicilline	0%	0%	1%	50%	21%	79%	13%	2%	38%
	Lincomycine	0%	0%	0%	100%	78%	100%	100%	83%	100%
	Kanamycine	20%	16%	24%	8%	0%	38%	0%	0%	17%
	Gentamicine	6%	4%	9%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
	Érythromycine	56%	51%	60%	75%	43%	95%	38%	15%	65%
I	Vancomycine	0%	0%	1%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
	Tigécycline	0%	0%	1%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
	Linézolide	0%	0%	1%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
	Daptomycine	0%	0%	1%	0%	0%	22%	0%	0%	17%
	Ciprofloxacine	1%	0%	2%	25%	5%	57%	0%	0%	17%

Tableau 15. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats d'Enterococcus provenant de viande de poulet, par espèce d'Enterococcus; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Espèce	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 17
		Nombre d'isolats
Colombie-Britannique
E. faecalis	70 (90,9)	3	55	12	0
Enterococcus spp.	4 (5,2)	0	3	1	0
E. faecium	3 (3,9)	0	2	1	0
Total	77 (100)	3	60	14	0
Saskatchewan
E. faecalis	85 (93,4)	6	62	17	0
Enterococcus spp.	5 (5,5)	0	3	2	0
E. faecium	1 (1,1)	0	0	1	0
Total	91 (100)	6	65	20	0
Ontario
E. faecalis	148 (96,1)	12	114	22	0
E. faecium	3 (1,9)	0	0	3	0
Enterococcus spp.	3 (1,9)	0	3	0	0
Total	154 (100)	12	117	25	0
Québec
E. faecalis	133 (93,7)	15	90	28	0
E. faecium	5 (3,5)	0	1	4	0
Enterococcus spp.	4 (2,8)	0	0	4	0
Total	142 (100)	15	91	36	0
Total	464 (100)	36	333	95	0

Figure 23. - Cliquez pour agrandir

Figure 23. - Texte équivalent

Figure 23. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Enterococcus provenant de viande de poulet; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003- 2008.

Province	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	42	77	80	85	76	91	142	159	150	154	161	154	125	162	150	143	141	142	18
Antimicrobien
Ciprofloxacine	0%	0%	1%	4%	3%	1%	1%	0%	1%	1%	1%	3%	2%	0%	1%	0%	2%	1%	0%
Érythromycine	43%	51%	39%	36%	46%	67%	48%	39%	45%	40%	40%	50%	66%	46%	43%	47%	46%	57%	39%
Gentamicine	5%	4%	3%	5%	4%	3%	6%	4%	3%	4%	8%	5%	8%	5%	7%	9%	11%	10%	17%
Lincomycine	75%	100%	86%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%	100%
Quinupristine-dalfopristine	50%	43%	71%	40%	50%	83%	100%	77%	83%	57%	86%	50%	75%	91%	62%	63%	77%	89%	100%
Streptomycine	26%	39%	20%	26%	30%	40%	28%	22%	19%	19%	24%	27%	38%	22%	23%	34%	36%	37%	22%
Tétracycline	81%	75%	90%	76%	89%	86%	88%	85%	90%	83%	90%	88%	88%	86%	86%	83%	88%	87%	78%
Tylosine	43%	49%	40%	36%	46%	67%	48%	40%	44%	39%	39%	51%	66%	46%	43%	47%	46%	56%	39%

Porcs

Salmonella

Surveillance à la ferme ²¹
(n = 61)

Isolement bactérien : Des isolats de Salmonella ont été détectés dans 13 % (61/486) des échantillons de matière fécale provenant de porcs.

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 16 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs ont été var. 5- (28 %, 17/61), Brandenburg (15 %, 9/61), Bovismorbificans (11 %, 7/61) et Derby (11 %, 7/61). Ces 4 sérotypes représentaient 66 % (40/61) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 24 et au tableau B.19 (annexe B). Aucun des isolats n'était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à la céfoxitine ou à l'acide nalidixique. De plus, aucun des isolats de Salmonella ne présentait de sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 16 et au tableau C.4, (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 62 % (38/61) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 23 % (14/61) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient ACKSSuT (15 %, 9/61), STR-SSS-TET (11 %, 7/61) et TET (10 %, 6/61). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AKSSuT-GEN-SXT (1 S. Ohio var. 14+).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 25. Entre 2007 et 2008, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats de Salmonella résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, parmi les échantillons de matière fécale prélevés auprès de porcs à la ferme, aucun des isolats de Salmonella n'était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à la céfoxitine ou à l'acide nalidixique ou présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Figure 24. - Cliquez pour agrandir

Figure 24. - Texte équivalent

Figure 24. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats Salmonella provenant deporcs; Surveillance à la ferme, 2008.

Antimicrobien		Porcs (n = 61)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	57%	44%	70%
	Sulfisoxazole	39%	27%	53%
	Chloramphénicol	25%	14%	37%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	3%	0%	11%
	Streptomycine	36%	24%	49%
	Acide nalidixique	0%	0%	5%
	Kanamycine	21%	12%	34%
	Gentamicine	2%	0%	9%
	Céfoxitine	0%	0%	5%
	Ampicilline	33%	21%	46%
	Amikacine	0%	0%	5%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	5%
	Ceftriaxone	0%	0%	5%
	Ceftiofur	0%	0%	5%
	Amoxicilline-acide clavulanique	0%	0%	5%

Tableau 16. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de porcs, par sérotype; Surveillance à la ferme, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Typhimurium var. 5-	17 (27,9)	5	4	8	0
Brandenburg	9 (14,8)	0	9	0	0
Bovismorbificans	7 (11,5)	5	2	0	0
Derby	7 (11,5)	0	7	0	0
Mbandaka	4 (6,6)	2	2	0	0
Typhimurium	3 (4,9)	0	0	3	0
I 4,[5],12:i:-	2 (3,3)	1	0	1	0
Infantis	2 (3,3)	2	0	0	0
London	2 (3,3)	2	0	0	0
Sérotypes moins communs	8 (13,1)	6	0	2	0
Total	61 (100)	23	24	14	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Figure 25. - Cliquez pour agrandir

Figure 25. - Texte équivalent

Figure 25. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Salmonella provenant de porcs; Surveillance à la ferme, 2006-2008.

Année	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	72	110	61
Antimicrobien
Ampicilline	24%	35%	33%
Ceftiofur	1%	0%	0%
Gentamicine	0%	0%	2%
Acide nalidixique	0%	0%	0%
Streptomycine	38%	42%	40%
Tétracycline	57%	57%	60%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	7%	9%	3%

Surveillance en abattoir
(n = 151)

Isolement bactérien : Des isolats de Salmonella ont été détectés dans 44 % (151/340) des échantillons de matière fécale provenant de porcs (tableau C.5, annexe C).

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 17 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient Derby (22 %, 33/151), Typhimurium var. 5- (21 %, 31/151) et Typhimurium (11 %, 17/151). Ces 3 sérotypes représentaient 54 % (81/151) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 26 et au tableau B.20 (annexe B). Un pour cent (2/151) des isolats de Salmonella étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été observées dans 1 % (1/151) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique. Aucun des isolats ne présentait de sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 17 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 64 % (96/151) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 24 % (36/151) des isolats (incluant 22 S. Typhimurium var. 5- et 10 S. Typhimurium). Les profils de résistance les plus communs étaient TET (15 %, 22/151), STR-SSS-TET (13 %, 19/151), ACSSuT (13 %, 19/151) et ACKSSuT (6 %, 9/151). Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient A2C-AMP-CRO-STR-TET (1 S. Anatum) et ACKSSuT-SXT (1 S. Typhimurium et 1 S. Typhimurium var. 5-).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 27. Les pourcentages d'isolats résistants à l'ampicilline, à la streptomycine, au triméthoprime-sulfaméthoxazole et à la tétracycline étaient significativement plus élevés en 2008 (28 % [42/151], 44 % [67/151], 7 % [10/151] et 58 % [87/151], respectivement) qu'en 2003 (18 % [70/391], 34 % [132/391], 2 % [9/391] et 45 % [176/391] respectivement). Toutefois, le pourcentage d'isolats résistants à la gentamicine était significativement moins élevé en 2008 (1 %, 1/151) qu'en 2007 (6 %, 6/105).

En 2008, 1 % (2/151) des isolats de Salmonella provenant d'échantillons de porcs prélevés en abattoir étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 1 % (1/151) des isolats. Les pourcentages d'isolats de Salmonella résistants à l'ampicilline, à la streptomycine, au triméthoprime-sulfaméthoxazole et à la tétracycline étaient significativement plus élevés en 2008 (28 % [42/151], 44 % [67/151], 7 % [10/151] et 58 % [87/151], respectivement) qu'en 2003 (18 % [69/391], 34 % [132/391], 2 % [9/391] et 45 % [176/391], respectivement). Le pourcentage d'isolats résistants à la gentamicine était significativement moins élevé en 2008 (1 %, 1/151) qu'en 2007 (6 %, 6/105).

Figure 26. - Cliquez pour agrandir

Figure 26. - Texte équivalent

Figure 26. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella provenant deporcs; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Porcs (n = 151)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	58%	49%	66%
	Sulfisoxazole	46%	38%	55%
	Chloramphénicol	23%	17%	31%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	7%	3%	12%
	Streptomycine	44%	36%	53%
	Acide nalidixique	0%	0%	2%
	Kanamycine	10%	6%	16%
	Gentamicine	1%	0%	4%
	Céfoxitine	1%	0%	4%
	Ampicilline	28%	21%	36%
	Amikacine	0%	0%	2%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	2%
	Ceftriaxone	1%	0%	4%
	Ceftiofur	1%	0%	4%
	Amoxicilline-acide clavulanique	1%	0%	5%

Tableau 17. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats Salmonella provenant de porcs, par sérotype; Surveillance en abattoir, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Derby	33 (21,9)	4	28	1	0
Typhimurium var. 5-	31 (20,5)	1	8	22	0
Typhimurium	17 (11,3)	2	5	10	0
Brandenburg	10 (6,6)	4	6	0	0
Infantis	8 (5,3)	7	1	0	0
Worthington	7 (4,6)	1	6	0	0
Uganda	6 (4,0)	6	0	0	0
Give	5 (3,3)	4	1	0	0
Ohio	5 (3,3)	2	1	2	0
Bovismorbificans	4 (2,6)	4	0	0	0
Mbandaka	4 (2,6)	4	0	0	0
Sérotypes moins communs	21 (13,9)	16	4	1	0
Total	151 (100)	55	60	36	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Figure 27. - Cliquez pour agrandir

Figure 27. - Texte équivalent

Figure 27. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats de Salmonella provenant de porcs; Surveillance en abattoir, 2003-2008.

Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	391	269	212	145	105	151
Antimicrobien
Ampicilline	18%	13%	13%	19%	29%	28%
Ceftiofur	0%	0%	0%	1%	1%	1%
Gentamicine	2%	2%	0%	1%	6%	1%
Acide nalidixique	0%	0%	0%	0%	0%	0%
Streptomycine	34%	26%	30%	30%	45%	44%
Tétracycline	45%	42%	44%	48%	55%	58%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	2%	5%	2%	6%	6%	7%

Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008^{Note de bas de page 23}
(n = 36)
(Colombie-Britannique [n = 4], Saskatchewan [n = 7], Ontario [n = 14], Québec [n = 9], Région des Maritimes [n = 2])

Isolement bactérien : De 2003 à 2008 inclusivement, des isolats de Salmonella ont été détectés dans 1 % (37/2,612) des échantillons de viande de porc vendue au détail (tableau C.5, annexe C)Note de bas de page 22. Les pourcentages d'échantillons de viande de porc dans lesquels des isolats ont été détectés se répartissent comme suit pour chacune des provinces et régions : Colombie-Britannique, 2 % (4/244); Saskatchewan, 2 % (7/464); Ontario, 2 % (15/978); Québec, 1 % (9/840) et région des Maritimes, 2 % (2/86). En 2003, 1 isolat de l'Ontario n'a pas été mis en culture après avoir été congelé et n'a donc pas pu être soumis à des analyses de sérotypage ni à des tests de sensibilité aux antimicrobiens. En raison du faible nombre d'isolats par province ou région, les données de toutes les provinces et régions ont été regroupées et présentées pour la période complète de 2003 à 2008.

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 18 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes les plus communs de Salmonella observés dans la viande de porc vendue au détail étaient Typhimurium (19 %, 7/36), Derby (11 %, 4/36), Typhimurium var. 5- (11 %, 4/36), Heidelberg (8 %, 3/36), Johannesburg (8 %, 3/36) et Kentucky (8 %, 3/36). Tous les isolats de Johannesburg provenaient de la Saskatchewan. Cinq des 7 isolats de S. Typhimurium et 3 des 4 isolats de S. Typhimurium var. 5- provenaient de l'Ontario.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 28 et au tableau B.21. De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées parmi 1 isolat de S. Kentucky du Québec. Aucun des isolats des 5 provinces/région n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine, à la gentamicine ou à l'acide nalidixique. Aucun des isolats ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 18 et au tableau B.21 (annexe B). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 69 % (25/36) des isolats de Salmonella provenant de viande de porc vendue au détail (3 de la Colombie-Britannique, 6 de la Saskatchewan, 8 de l'Ontario, 6 du Québec et 2 de la région des Maritimes). De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 17 % (6/36) des isolats (3 S. Typhimurium et 2 S. Typhimurium var. 5- de l'Ontario et 1 S. Kentucky du Québec). Parmi les isolats des 5 provinces/région, les profils de résistance les plus communs étaient TET (8 %, 3/36), STR-TET (8 %, 3/36), STR-SSS-TET (8 %, 3/36), CHL-STR-SSS-TET (8 %, 3/36), ACSSuT (8 %, 3/36) et AMP (6 %, 2/36). Les isolats qui présentaient le profil de résistance ACSSuT provenaient tous de l'Ontario (2 S. Typhimurium et 1 S. Typhimurium var. 5-). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était A2C-AMP-CRO-STR, observé chez 1 isolat de S. Kentucky du Québec en 2007.

De 2003 à 2008, des isolats de Salmonella ont été détectés dans 1 % des échantillons de viande de porc vendue au détail. Un isolat de S. Kentucky détecté dans un échantillon de viande de porc provenant du Québec en 2007 était résistant à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur, à la ceftriaxone, à l'ampicilline, à la céfoxitine et à la streptomycine. Aucun autre isolat n'était résistant aux antimicrobiens testés de la Catégorie 1. Trois isolats de l'Ontario (2 S. Typhimurium et 1 S. Typhimurium var. 5-) présentaient le profil de résistance ACSSuT.

Figure 28. - Cliquez pour agrandir

Figure 28. - Texte équivalent

Figure 28. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats de Salmonella provenant deviande de porc; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008.

		Porc (n = 36)
	Antimicrobien	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	53%	35%	70%
	Sulfisoxazole	42%	26%	59%
	Chloramphénicol	25%	12%	42%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	6%	1%	19%
	Streptomycine	42%	26%	59%
	Acide nalidixique	0%	0%	8%
	Kanamycine	6%	1%	19%
	Gentamicine	0%	0%	8%
	Céfoxitine	3%	0%	15%
	Ampicilline	28%	14%	45%
	Amikacine	0%	0%	8%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	8%
	Ceftriaxone	3%	0%	15%
	Ceftiofur	3%	0%	15%
	Amoxicilline-acide clavulanique	3%	0%	15%

Tableau 18. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de viande de porc, par sérotype; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Colombie-Britannique
Derby	1 (25,0)	0	1	0	0
Give	1 (25,0)	1	0	0	0
Kentucky	1 (25,0)	0	1	0	0
London	1 (25,0)	0	1	0	0
Total	4 (100)	1	3	0	0
Saskatchewan
Johannesburg	3 (42,9)	0	3	0	0
Derby	1 (14,3)	0	1	0	0
I 40:-:enx	1 (14,3)	0	1	0	0
Ohio	1 (14,3)	1	0	0	0
Schwarzengrund	1 (14,3)	0	1	0	0
Total	7 (100)	1	6	0	0
Ontario
Typhimurium	5 (35,7)	1	1	3	0
Typhimurium var. 5-	3 (21,4)	1	0	2	0
Derby	1 (7,1)	1	0	0	0
Enteritidis	1 (7,1)	1	0	0	0
Heidelberg	1 (7,1)	0	1	0	0
I Rough:z10:-	1 (7,1)	1	0	0	0
Kentucky	1 (7,1)	0	1	0	0
Krefeld	1 (7,1)	1	0	0	0
Total	14 (100)	6	3	5	0
Québec
Heidelberg	2 (22,2)	1	1	0	0
Agona	1 (11,1)	0	1	0	0
Berta	1 (11,1)	1	0	0	0
Derby	1 (11,1)	0	1	0	0
I 4,[5],12:i:-	1 (11,1)	1	0	0	0
Kentucky	1 (11,1)	0	0	1	0
Typhimurium	1 (11,1)	0	1	0	0
Typhimurium var. 5-	1 (11,1)	0	1	0	0
Total	9 (100)	3	5	1	0
Maritimes
Typhimurium	1 (50,0)	0	1	0	0
Vi:Rough:-:-	1 (50,0)	0	1	0	0
Total	2 (100)	0	2	0	0
Total	36 (100)	11	19	6	0
La région des Maritimes inclut le Nouveau-Brunswick, la Nouvelle-Écosse et l'Île-du-Prince-Édouard.

Surveillance des isolats cliniques animaux^{Note de bas de page 24}
(n = 158)

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 19 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes les plus communs de Salmonella dans les isolats cliniques de porcs étaient Typhimurium (39 %, 61/158), Typhimurium var. 5- (17 %, 27/158) et Derby (9 %, 15/158). Ces 3 sérotypes représentaient 65 % (103/158) des isolats de Salmonella.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.22 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 1 % (2/158) des isolats de Salmonella. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique. Aucun ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 19 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 72 % (113/158) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 39 % (61/158) des isolats, dont la plupart étaient des isolats de S. Typhimurium (29/61) et de S. Typhimurium var. 5- (23/61). Les profils de résistance les plus communs étaient ACSSuT (19 %, 30/158), STR-SSS-TET (9 %, 15/158) et ACKSSuT (8 %, 13/158). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO-GEN-SXT (1 S. Infantis).

En 2008, de la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 1 % (2/158) des isolats de Salmonella provenant d'échantillons cliniques de porcs. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACKSSuT-A2C-CRO- GEN-SXT (1 S. Infantis).

Tableau 19. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de porcs, par sérotype; Surveillance des isolats cliniques animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Typhimurium	61 (38,6)	13	19	29	0
Typhimurium var. 5-	27 (17,1)	2	2	23	0
Derby	15 (9,5)	1	14	0	0
I 4,[5],12:i:-	8 (5,1)	2	2	4	0
Brandenburg	7 (4,4)	7	0	0	0
Infantis	5 (3,2)	3	1	0	1
Enteritidis	4 (2,5)	4	0	0	0
Sérotypes moins communs	31 (19,6)	13	14	4	0
Total	158 (100)	45	52	60	1
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Escherichia coli

Surveillance à la ferme^{Note de bas de page 26}
(n = 1425)

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 99 % (481/486) des échantillons de matière fécale provenant de porcs. Jusqu'à 3 isolats par échantillon positif ont été gardés à des fins d'analyse. Le nombre total d'isolats prévu était de 1449 (483 x 3), mais le pourcentage réel d'isolats a été de 98 % (1425/1449). Trois échantillons n'ont fourni qu'un seul isolat et 11 ont fourni seulement 2 isolats. Il y a donc eu 17 isolats de moins que le nombre prévu. De plus, 7 autres isolats n'ont pas pu être mis en culture après avoir été congelés; un total de 1425 isolats a donc été soumis à des tests de sensibilité aux antimicrobiens.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 29 et au tableau B.23 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 1 % (17/1425; 15/1425 et 18/1425, respectivement) des isolats d'E. coli. De la sensibilité réduite à la ciproflaxacine a été observée dans moins de 1 % (3/1425) des isolats. Un pourcent (5/1425) des isolats étaient résistants à l'acide nalidixique. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine ou à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 87 % (1231/1425) des isolats d'E. coli. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 12 % (170/1425) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (18 %, 256/1425), AMP-TET (6 %, 86/1425) et SSS-TET (5 %, 77/1425). Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AMC-AMP-CHL-CRO-FOX-GEN-KAN-SSS-SXT-TET-TIO et a été observé parmi 1 isolat.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 30. Le pourcentage des isolats d'E. coli résistants au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (1 %, 15/1425) qu'en 2007 (<1 %, 7/1575).^{Note de bas de page 25} Aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 1 % (17/1425, 15/1425 et 18/1425, respectivement) des isolats d'Escherichia coli provenant d'échantillons de matière fécale prélevés auprès de porcs à la ferme. Le pourcentage d'isolats résistants au ceftiofur était significativement plus élevé en 2008 (1 %, 15/1425) qu'en 2007 (moins de 1 %, 7/1575).

Figure 29. - Cliquez pour agrandir

Figure 29. - Texte équivalent

Figure 29. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde porcs; Surveillance à la ferme, 2008.

Antimicrobien		Porcs (n = 1425)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	79%	77%	81%
	Sulfisoxazole	48%	45%	50%
	Chloramphénicol	19%	17%	21%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	10%	9%	12%
	Streptomycine	34%	32%	37%
	Acide nalidixique	0%	0%	1%
	Kanamycine	15%	13%	16%
	Gentamicine	1%	1%	2%
	Céfoxitine	1%	1%	2%
	Ampicilline	34%	32%	37%
	Amikacine	0%	0%	0%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	0%
	Ceftriaxone	1%	1%	2%
	Ceftiofur	1%	1%	2%
	Amoxicilline-acide clavulanique	1%	1%	2%

Figure 30. - Cliquez pour agrandir

Figure 30. - Texte équivalent

Figure 30. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de porcs; Surveillance à la ferme, 2007-2008.

Année	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	1721	1575	1425
Antimicrobien
Ampicilline	35%	36%	34%
Ceftiofur	1%	1%	1%
Gentamicine	1%	1%	1%
Acide nalidixique	0%	0%	0%
Streptomycine	37%	34%	35%
Tétracycline	79%	78%	80%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	12%	10%	19%

Surveillance en abattoir (n = 150)

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 100 % (150/150) des échantillons caecaux provenant de porcs (tableau C.5, annexe C).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 31 et au tableau B.24 (annexe B). Un pour cent (1/150) des isolats d'E. coli étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur et à la ceftriaxone. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine et de la résistance à l'acide nalidixique ont chacune été détectées dans 1 % (1/150) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à la céfoxitine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 89 % (133/150) des isolats d'E. coli. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 13 % (20/150) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient TET (19 %, 29/150), CHL-SSS-TET (6 %, 9/150) et STR-TET (6 %, 9/150). L'isolat présentant de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine était résistant à la ceftriaxone et à l'acide nalidixique. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AKSSuT-TIO-CRO-GEN-NAL. L'isolat associé à ce profil de résistance était le même que celui qui présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 32. Entre 2008 et 2003 et entre 2008 et 2007, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats d'E. coli résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 13 % (20/150) des isolats porcins d'Escherichia coli prélevés en abattoir. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était AKSSuT-TIO-CRO-GEN-NAL. L'isolat associé à ce profil de résistance présentait aussi de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Figure 31. - Cliquez pour agrandir

Figure 31. - Texte équivalent

Figure 31. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde porcs; Surveillance en abattoir, 2008.

Antimicrobien		Porcs (n = 150)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	85%	78%	90%
	Sulfisoxazole	52%	44%	60%
	Chloramphénicol	25%	18%	32%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	13%	8%	20%
	Streptomycine	35%	28%	44%
	Acide nalidixique	1%	0%	4%
	Kanamycine	19%	13%	26%
	Gentamicine	2%	0%	6%
	Céfoxitine	0%	0%	2%
	Ampicilline	33%	26%	41%
	Amikacine	0%	0%	2%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	2%
	Ceftriaxone	1%	0%	4%
	Ceftiofur	1%	0%	4%
	Amoxicilline-acide clavulanique	1%	0%	4%

Figure 32. - Cliquez pour agrandir

Figure 32. - Texte équivalent

Figure 32. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de porcs; Surveillance en abattoir, 2003-2008.

Année	2003	2004	2005	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	153	142	163	114	93	150
Antimicrobien
Ampicilline	35%	30%	35%	35%	37%	33%
Ceftiofur	0%	0%	1%	0%	1%	1%
Gentamicine	3%	1%	1%	2%	0%	2%
Acide nalidixique	1%	0%	1%	0%	0%	1%
Streptomycine	40%	39%	39%	26%	33%	35%
Tétracycline	82%	71%	75%	83%	75%	85%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	14%	5%	10%	18%	12%	13%

Surveillance de la viande vendue au détail
(n = 317)
(Colombie-Britannique [n = 44], Saskatchewan [n = 41], Ontario [n = 155], Québec [n = 60], Région des Maritimes [n = 17])

Isolement bactérien : Des isolats d'Escherichia coli ont été détectés dans 32 % (317/979) des échantillons de viande de porc vendue au détail (tableau C.5, annexe C). Les pourcentages d'échantillons de viande de porc dans lesquels des isolats ont été détectés se répartissent comme suit pour chacune des provinces/région : Colombie-Britannique, 30 % (44/148); Saskatchewan, 23 % (41/176); Ontario, 50 % (155/312); Québec, 21 % (60/287) et région des Maritimes, 30 % (17/56).

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 33 et au tableau B.25 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique a été observée dans 7 % (3/44) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 7 % (3/41) des isolats de la Saskatchewan, 1 % (1/155) des isolats de l'Ontario et 3 % (2/60) des isolats du Québec. De la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 7 % (3/44) des isolats de la Colombie-Britannique, 7 % (3/41) des isolats de la Saskatchewan, 1 % (1/155) des isolats de l'Ontario et 3 % (2/60) des isolats du Québec. De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 2 % (1/60) des isolats du Québec. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 1 % (3/317) de tous les isolats (1 isolat de la Saskatchewan et 2 isolats du Québec). De la résistance à l'acide nalidixique a été observée dans 1 % (4/317) des isolats (1 isolat de la Saskatchewan et 3 isolats du Québec). Aucune différence significative parmi les provinces et la région des Maritimes n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens testés. Aucun des isolats d'aucune province ou région n'était résistant à l'amikacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 52 % (23/44) des isolats d'E. coli de la Colombie-Britannique, 39 % (16/41) des isolats de la Saskatchewan, 41 % (63/155) des isolats de l'Ontario, 42 % (25/60) des isolats du Québec et parmi 7 des 17 isolats de la région des Maritimes. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 9 % (4/44) des isolats de la Colombie-Britannique, 7 % (3/41) des isolats de la Saskatchewan, 7 % (11/155) des isolats de l'Ontario, 12 % (7/60) des isolats du Québec et parmi 2 des 17 isolats de la région des Maritimes. Parmi les isolats des 5 provinces/région, les profils de résistance les plus communs étaient TET (11 %, 34/317), AMP-TET (3 %, 10/317) et SSS-TET (3 %, 8/317). Moins de 1 % (1/317) des isolats étaient résistants à la ceftriaxone et à l'acide nalidixique, et présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine (1 isolat du Québec). Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était ACSSuT-A2C-CRO-SXT (1 isolat de l'Ontario).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 34. Le pourcentage d'isolats d'E. coli de l'Ontario présentant de la résistance à la tétracycline était significativement moins élevé en 2008 (38 %, 59/155) qu'en 2003 (55 %, 50/91). Pour les autres provinces, aucune variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 7 % (3/44) des isolats d'Escherichia coli provenant de viande de porc vendue au détail de la Colombie-Britannique, 7 % (3/41) des isolats de la Saskatchewan, 1 % (1/155) des isolats de l'Ontario et 3 % (2/60) des isolats du Québec. De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans 2 % (1/60) des isolats du Québec et de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 1 % (3/317) de tous les isolats (1 isolat de la Saskatchewan et 2 isolats du Québec). De la résistance à la ceftriaxone et de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine ont toutes deux été détectées dans moins de 1 % (1/317) des isolats (1 isolat du Québec) et cet isolat était aussi résistant à l'acide nalidixique. Le pourcentage des isolats d'E. coli de l'Ontario résistants à la tétracycline était significativement moins élevé en 2008 (38 %, 59/155) qu'en 2003 (55 %, 50/91).

Figure 33. - Cliquez pour agrandir

Figure 33. - Texte équivalent

Figure 33. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Escherichia coli provenantde viande de porc, par province/région; Surveillance de la viande vendue au détail, 2008.

Antimicrobien		Maritimes (n = 17)			Québec (n = 60)			Ontario (n = 155)			Saskatchewan (n = 41)			Colombie-Britannique (n = 44)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV
III	Tétracycline	41%	18%	67%	35%	23%	48%	38%	30%	46%	29%	16%	46%	45%	30%	61%
	Sulfisoxazole	18%	4%	43%	23%	13%	36%	21%	15%	28%	12%	4%	26%	27%	15%	43%
	Chloramphénicol	6%	0%	29%	7%	2%	16%	9%	5%	15%	0%	0%	7%	5%	1%	15%
II	Triméthoprime-sulfaméthoxazole	12%	1%	36%	10%	4%	21%	7%	4%	12%	0%	0%	7%	7%	1%	19%
	Streptomycine	12%	1%	36%	13%	6%	25%	14%	9%	21%	15%	6%	29%	23%	11%	38%
	Acide nalidixique	0%	0%	16%	5%	1%	14%	0%	0%	2%	2%	0%	13%	0%	0%	7%
	Kanamycine	12%	1%	36%	2%	0%	9%	3%	1%	7%	2%	0%	13%	2%	0%	12%
	Gentamicine	0%	0%	16%	2%	0%	9%	3%	1%	7%	2%	0%	13%	5%	1%	15%
	Céfoxitine	0%	0%	16%	3%	0%	12%	1%	0%	4%	7%	2%	20%	7%	1%	19%
	Ampicilline	18%	4%	43%	18%	10%	30%	17%	11%	24%	10%	3%	23%	23%	11%	38%
	Amikacine	0%	0%	16%	0%	0%	5%	0%	0%	2%	0%	0%	7%	0%	0%	7%
I	Ciprofloxacine	0%	0%	16%	2%	0%	9%	0%	0%	2%	0%	0%	7%	0%	0%	7%
	Ceftriaxone	0%	0%	16%	3%	0%	12%	1%	0%	4%	7%	2%	20%	7%	1%	19%
	Ceftiofur	0%	0%	16%	3%	0%	12%	1%	0%	4%	7%	2%	20%	7%	1%	19%
	Amoxicilline-acide clavulanique	0%	0%	16%	3%	0%	12%	1%	0%	4%	7%	2%	20%	7%	1%	19%

Figure 34. - Cliquez pour agrandir

Figure 34. - Texte équivalent

Figure 34. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Escherichia coli provenant de viande de porc; Surveillance de la viande vendue au détail, 2003-2008.

	Colombie-Britannique		Saskatchewan				Ontario						Québec						Maritimes
Année	2007	2008	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2003	2004	2005	2006	2007	2008	2008
Nombre d'isolats	23	44	48	49	38	41	90	199	179	182	172	155	61	107	78	57	64	60	17
Antimicrobien
Ampicilline	13%	23%	2%	6%	5%	10%	20%	23%	21%	21%	23%	17%	20%	19%	12%	19%	20%	18%	18%
Ceftiofur	0%	7%	0%	0%	3%	7%	1%	1%	1%	1%	1%	1%	0%	2%	3%	0%	0%	3%	0%
Gentamicine	0%	5%	0%	0%	0%	2%	1%	3%	1%	1%	1%	3%	2%	3%	1%	4%	2%	2%	0%
Acide nalidixique	0%	0%	0%	0%	0%	2%	0%	0%	0%	0%	1%	0%	0%	0%	0%	0%	0%	5%	0%
Streptomycine	13%	23%	17%	10%	5%	15%	17%	26%	20%	20%	21%	14%	28%	21%	17%	19%	23%	13%	12%
Tétracycline	35%	45%	27%	31%	24%	29%	54%	55%	49%	48%	46%	38%	48%	36%	33%	37%	45%	35%	41%
Triméthoprime-sulfaméthoxazole	0%	7%	2%	2%	5%	0%	4%	7%	7%	4%	5%	7%	10%	7%	6%	7%	3%	10%	12%

Enterococcus

Surveillance à la ferme^{Note de bas de page 27}
(n = 1266)

Isolement bactérien : Des isolats d'Enterococcus ont été détectés dans 92 % (448/486) des échantillons de matières fécales de porcs. Jusqu'à 3 isolats par échantillon positif ont été gardés à des fins d'analyse. Le nombre total d'isolats prévu était de 1338 (448 x 3), mais le pourcentage réel d'isolats a été de 95 % (1266/1338). Seize échantillons n'ont fourni que 1 seul isolat et 33 échantillons n'ont fourni que 2 isolats. Il y a donc eu 65 isolats de moins que prévu. De plus, 7 isolats n'ont pas pu être mis en culture après avoir été congelés. Par conséquent, un total de 1266 isolats a été soumis à des tests de sensibilité aux antimicrobiens. Soixante-treize pour cent (918/1266) des isolats étaient des isolats d'E. faecalis, 23 % (288/1266) étaient d'autres Enterococcus spp. et 5 % (60/1266) étaient des isolats d'E. faecium.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés à la figure 35 et au tableau B.26 (annexe B). De la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans moins de 1 % (2/918) des isolats d'E. faecalis, dans 33 % (20/60) des isolats d'E. faecium et dans 1 % (3/288) des isolats des autres Enterococcus spp. Moins de 1 % (1/918) des isolats d'E. faecalis et aucun des isolats d'E. faecium ou des autres Enterococcus spp. étaient non sensibles à la daptomycine. De la résistance à la tigécycline a été observée dans 2 % (15/918) des isolats d'E. faecalis, 2 % (1/60) des isolats d'E. faecium et 2 % (6/288) des isolats des autres Enterococcus spp. Aucun des isolats n'était résistant à la linézolide ou à la vancomycine. Aucun isolat d'E. faecalis n'était résistant à la pénicilline et aucun isolat d'E. faecium n'était résistant à la gentamicine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 20. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 96 % (1213/1266) des isolats d'Enterococcus. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 39 % (500/1266) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient ERY-TET-TYL (21 %, 270/1266), ERY-KAN-STR-TET-TYL (15 %, 188/1266) et TET (9 %, 112/1266). Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient ERY-FLA-KAN-LIN-PEN-QDA-STR-TET-TIG-TYL (1 Enterococcus spp.) et ERY-FLA-KAN-LIN-NIT-PEN-QDA-STR-TET-TYL (1 Enterococcus spp.).

Variations temporelles : Les résultats sont présentés à la figure 36. Le pourcentage d'isolats d'Enterococcus résistants à la lincomycine était significativement plus élevé en 2008 (26 %, 334/1266) qu'en 2006 (20 %, 125/641). Aucune autre variation temporelle significative n'a été observée dans les pourcentages d'isolats résistants aux antimicrobiens sélectionnés.

En 2008, de la résistance à la ciprofloxacine a été observée dans moins de 1 % des isolats d'Enterococcus faecalis (3/288) et des autres Enterococcus spp. (2/918) provenant d'échantillons de porcs à la ferme. Cette résistance a également été observée dans 33 % (20/60) des isolats d'E. faecium. Aucun des isolats d'Enterococcus n'était résistant à la linézolide ou à la vancomycine. Moins de 1 % (1/918) des isolats étaient non sensibles à la daptomycine. Le pourcentage d'isolats résistants à la lincomycine était significativement plus élevé en 2008 (26 %, 334/1266) qu'en 2006 (20 %, 125/641).

Figure 35. - Cliquez pour agrandir

Figure 35. - Texte équivalent

Figure 35. Résistance aux antimicrobiens observée parmi les isolats d'Enterococcus provenant deporcs; Surveillance à la ferme, 2008.

Antimicrobien		Enterococcus faecalis (n = 918)			Enterococcus faecium (n = 60)			Enterococcus spp. (n = 288)
		Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance	Pourcentage	Borne inférieure de l'intervalle de confiance	Borne supérieure de l'intervalle de confiance
IV	Flavomycine	0%	0%	1%	93%	84%	98%	48%	42%	54%
III	Tétracycline	94%	92%	95%	40%	28%	53%	83%	79%	87%
	Nitrofurantoïne	1%	0%	2%	7%	2%	16%	19%	14%	24%
	Chloramphénicol	7%	6%	9%	0%	0%	5%	6%	3%	9%
II	Tylosine	78%	75%	81%	10%	4%	21%	66%	61%	72%
	Streptomycine	47%	44%	50%	8%	3%	18%	29%	24%	34%
	Quinupristine-dalfopristine	0%	0%	0%	12%	5%	23%	52%	46%	58%
	Pénicilline	0%	0%	0%	3%	0%	12%	12%	8%	16%
	Lincomycine	0%	0%	0%	88%	77%	95%	98%	95%	99%
	Kanamycine	34%	31%	37%	8%	3%	18%	23%	19%	29%
	Gentamicine	9%	7%	11%	0%	0%	5%	2%	1%	4%
	Érythromycine	78%	75%	80%	13%	6%	25%	66%	60%	71%
I	Vancomycine	0%	0%	0%	0%	0%	5%	0%	0%	1%
	Tigécycline	2%	1%	3%	2%	0%	9%	2%	1%	4%
	Linézolide	0%	0%	0%	0%	0%	5%	0%	0%	1%
	Daptomycine	0%	0%	1%	0%	0%	5%	0%	0%	1%
	Ciprofloxacine	0%	0%	1%	33%	22%	47%	1%	0%	3%

Tableau 20. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats d'Enterococcus provenant de porcs, par espèce d'Enterococcus; Surveillance à la ferme, 2008.

Sérotype	n (% total)	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 17
		Nombre d'isolats
E. faecalis	918 (72,5)	50	560	308	0
E. faecium	60 (4,7)	1	51	7	1
Enterococcus spp.	288 (22,7)	2	102	169	15
Total	1266 (100)	53	713	484	16

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Figure 36. - Texte équivalent

Figure 36. Variation temporelle de la résistance aux antimicrobiens sélectionnés parmi les isolats d'Enterococcus provenant de porcs; Surveillance à la ferme, 2006-2008.

Année	2006	2007	2008
Nombre d'isolats	640	988	1266
Antimicrobien
Ciprofloxacine	3%	1%	0%
Érythromycine	73%	74%	72%
Gentamicine	5%	6%	7%
Lincomycine	72%	97%	96%
Quinupristine-dalfopristine	42%	42%	47%
Streptomycine	41%	39%	42%
Tétracycline	86%	89%	90%
Tylosine	74%	74%	72%

Dindes

Salmonella

Surveillance des isolats cliniques animaux^{Note de bas de page 28}
(n = 32)

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 21 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes les plus communs de Salmonella parmi les isolats cliniques provenant de dindes étaient Typhimurium (22 %, 7/32), Agona (13 %, 4/32), Hadar (13 %, 4/32) et Heidelberg (13 %, 4/32). Ces 3 sérotypes représentaient 47 % (15/32) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.27 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 56 % (18/32) des isolats de Salmonella. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique et aucun ne présentait de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 21 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 91 % (29/32) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 59 % (19/32) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient A2C-AMP-CRO (34 %, 11/32) et TET (16 %, 5/32). Les isolats de S. Typhimurium (19 %, 6/32), S. Agona (13 %, 4/32) et Salmonella ssp. I 4,[5],12:-:- (3 %, 1/32) sont ceux qui présentaient le profil de résistance A2C-AMP-CRO. Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient AKSSuT-A2C-CRO-GEN (1 S. Senftenberg et 1 S. Bredeney) et ACSSuT-A2C-CRO-GEN (1 S. Senftenberg).

En 2008, 56 % (18/32) des isolats cliniques de Salmonella provenant d'échantillons de dindes étaient résistants à l'amoxicilline-acide clavulanique, au ceftiofur et à la ceftriaxone. Les profils de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient AKSSuT-A2C-CRO-GEN et ACSSuT-A2C-CRO-GEN, lesquels ont respectivement été détectés parmi 2 isolats (1 S. Senftenberg et 1 S. Bredeney) et 1 isolat de S. Senftenberg.

Tableau 21. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de dindes, par sérotype; Surveillance des isolats cliniques animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Typhimurium	7 (21,9)	0	0	7	0
Agona	4 (12,5)	0	0	4	0
Hadar	4 (12,5)	0	4	0	0
Heidelberg	4 (12,5)	0	4	0	0
Bredeney	3 (9,4)	0	0	0	3
Senftenberg	3 (9,4)	0	0	1	2
Anatum	1 (3,1)	0	1	0	0
Give	1 (3,1)	1	0	0	0
I 4,[5],12:-:-	1 (3,1)	0	0	1	0
Manhattan	1 (3,1)	1	0	0	0
Montevideo	1 (3,1)	0	0	1	0
Ouakam	1 (3,1)	0	1	0	0
Saintpaul	1 (3,1)	1	0	0	0
Total	32 (100)	3	10	14	5

Chevaux

Salmonella

Surveillance des isolats cliniques animaux^{Note de bas de page 29}
(n = 62)

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 22 et au tableau C.2 (annexe C). Les sérotypes les plus communs de Salmonella détectés parmi les isolats cliniques de chevaux étaient Heidelberg (42 %, 26/62), Newport (13 %, 8/62) et Typhimurium (10 %, 6/62). Ces 3 sérotypes représentaient 65 % (40/62) des isolats.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.28 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 11 % (7/62) des isolats de Salmonella. De la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 40 % (25/62) des isolats. Aucun des isolats n'était résistant à la ciprofloxacine, à l'amikacine ou à l'acide nalidixique.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 22 et au tableau C.4 (annexe C). De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 55 % (34/62) des isolats de Salmonella. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 52 % (32/62) des isolats. Les profils de résistance les plus communs étaient AMP-GEN-KAN-SSS-SXT (21 %, 13/62), AMP-CHL-GEN-KAN-SSS-SXT (15 %, 9/62) et A2C-AMP-CRO (10 %, 6/62). Tous les isolats présentant les profils de résistance AMP-GEN-KAN-SSS-SXT et AMP-CHL-GEN-KAN-SSS-SXT étaient des isolats de S. Heidelberg. Deux pour cent (1/62) des isolats étaient résistants à la ceftriaxone et présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine. Quarante pour cent (25/62) des isolats présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine, sans être résistants à l'acide nalidixique. Le profil comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était A2C-AMP-CRO-GEN-KAN-SSS-SXT (1 S. Heidelberg).

En 2008, de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine a été observée dans 40 % (25/62) des isolats cliniques de Salmonella provenant de chevaux. Deux pour cent (1/62) des isolats étaient résistants à la ceftriaxone et présentaient de la sensibilité réduite à la ciprofloxacine. De la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans 52 % (32/62) des isolats. Le profil de résistance comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens était A2C-AMP-CRO-GEN-KAN-SSS-SXT (1 S. Heidelberg).

Tableau 22. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant de chevaux, par sérotype; Surveillance des isolats cliniques animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
Heidelberg	26 (41,9)	0	0	25	1
Newport	8 (12,9)	8	0	0	0
Typhimurium	6 (9,7)	6	0	0	0
Litchfield	5 (8,1)	0	0	5	0
Thompson	5 (8,1)	5	0	0	0
Oranienburg	4 (6,5)	4	0	0	0
Agona	2 (3,2)	0	2	0	0
Sérotypes moins communs	6 (9,7)	5	0	1	0
Total	62 (100)	28	2	31	1
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».

Aliments et ingrédients pour animaux

Salmonella
(n = 57)

Note : Les données qui suivent comprennent les résultats obtenus dans le cadre des programmes de surveillance gouvernementaux en 2008. Les isolats de Salmonella provenaient d'échantillons d'aliments destinés à diverses espèces animales : 28 % (16/57) d'aliments pour chiens, 9 % (4/57) d'aliments pour porcs, 4 % (2/57) d'aliments pour volailles et 2 % (1/57) d'aliments pour chacune des espèces suivantes : bovins de boucherie, bovins laitiers, chevaux et visons. Les renseignements sur l'utilisation prévue des aliments manquaient toutefois pour 54 % (31/57) des isolats.

Sérotypes : Les résultats sont présentés au tableau 23. Les sérotypes de Salmonella les plus communs étaient London (16 %, 9/57), Montevideo (9 %, 5/57), Cubana (7 %, 4/57), Mbandaka (7 %, 4/57) et Rissen (7 %, 4/57). Les sérotypes Typhimurium et Typhimurium var. 5- représentaient chacun 2 % (1/57) des isolats. Aucun isolat d'Enteritidis, Heidelberg ou Newport n'a été détecté.

Résistance antimicrobienne : Les résultats sont présentés au tableau B.29 (annexe B). De la résistance à l'amoxicilline-acide clavulanique, de la résistance au ceftiofur et de la résistance à la ceftriaxone ont chacune été détectées dans 2 % (1/57) des isolats de S. Typhimurium. Aucune résistance ou de sensibilité réduite à la ciprofloxacine n'a été observée dans les isolats de Salmonella. Aucun des isolats n'était résistant à l'amikacine, à la gentamicine, à la kanamycine, à l'acide nalidixique ou au triméthoprime-sulfaméthoxazole.

Profils de résistance aux antimicrobiens : Les résultats sont présentés au tableau 23. De la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 11 % (6/57) des isolats de Salmonella. Pour la première fois depuis 2002, de la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée parmi des isolats provenant d'échantillons d'aliments pour animaux (5 %, 3/57). Les profils de résistance les plus communs étaient STR, STR-TET, STR-SSS, ACSSuT, A2C-AMP-CRO et CHL-STR-SSS-TET-SXT (2 %, 1/57 chacun). Les profils comportant le plus grand nombre d'antimicrobiens étaient ACSSuT (1 S. Typhimurium var. 5- isolat détecté dans des aliments pour chiens), A2C-AMP-CRO (1 isolat de S. Typhimurium détecté dans des aliments de provenance inconnue) et CHL-STR-SSS-TET-SXT (1 isolat de S. Worthington détecté dans des aliments pour visons).

En 2008, de la résistance à 1 antimicrobien ou plus a été observée dans 11 % (6/57) des isolats de Salmonella provenant d'échantillons d'aliments pour animaux. Pour la première fois depuis 2002, de la résistance à 5 antimicrobiens ou plus a été observée dans des isolats provenant d'échantillons d'aliments pour animaux (5 %, 3/57). Parmi ces isolats, un isolat de S. Typhimurium var. 5- présentait le profil de résistance ACSSuT et a été détecté dans des aliments pour chiens.

Tableau 23. Nombre d'antimicrobiens dans les profils de résistance d'isolats de Salmonella provenant d'aliments pour animaux, par sérotype; Aliments et ingrédients pour animaux, 2008.

Sérotype	Nombre (%) d'isolats	Nombre d'antimicrobiens dans le profil de résistance
		0	1 - 4	5 - 8	9 - 15
		Nombre d'isolats
London	9 (15,8)	9	0	0	0
Montevideo	5 (8,8)	5	0	0	0
Cubana	4 (7,0)	4	0	0	0
Mbandaka	4 (7,0)	3	1	0	0
Rissen	4 (7,0)	3	1	0	0
Anatum	3 (5,3)	3	0	0	0
Infantis	3 (5,3)	3	0	0	0
Schwarzengrund	3 (5,3)	3	0	0	0
Cerro	2 (3,5)	2	0	0	0
Johannesburg	2 (3,5)	2	0	0	0
Senftenberg	2 (3,5)	2	0	0	0
Tennessee	2 (3,5)	2	0	0	0
Sérotypes moins communs	14 (24,6)	10	1	3	0
Total	57 (100)	51	3	3	0
Les sérotypes présents dans moins de 2 % des isolats ont été regroupés dans la catégorie « Sérotypes moins communs ».